Ll_transcript_379649

Id TrinityTRINITY_DN50721_c1_g1_i10
Name TranscriptLl_transcript_379649
SequenceGTCTTATGGTTTTTCTACTCAGATTAAAGTTGATGTTGATACTATAATTTAAGCACTTTAGGACACTTTTGTCAGTCATTATACATTTGATTTATTGTTT TATGGTTTTCTGATTTGTGCATTTTTTGTTCACAAATTGTCATTGATTGTATATGAGAACAGAACTAGGTGGTAAACTTTGTGGTATTGAATATTGTGAG GTCGAAGTTTCTTGTAAAATATTCTAAAGCAACTTGAAGTAGATGCATGGATCGAGGGGATCAAATGGCGTTATCCGGCTCTGCATCTTACTATATGCAG AGAGGGATGCCTGGTTCTGGAACACAACCTGAATTACATAATTCACCTAATCTTCGTCCCATGCCGAATCCCAATTTACCATTTCAATCAGACATTGGGG GTGGTAGTACTATAGGATCCACATTGCCAATGGAGTCTACCGGAATTTTATCTCAATCGGTCAATGTCGTTGCTCATTCCGGGGCTCCAACTGGGGACCG TGTCAAAAGGAAGAGAGGAAGGCCTAGGAAATATGGAACTGATGGAACCGTGTCACTGACATTGAGTCCAGGTCCAATAACACCGGCTAGTCATCCTGGA ACCTTGATACAAACAGAAGGCCAAAAACGCGGTCGAGGGCGTCCGCGTGGGTCAGGGAAGAAACAGCAGCTGGCTTCTCTTGGTAAATCTCTTCTGCAAC TTTTTTGTTGTGTGTTAAATAAAATAATTATAATTGGAAGTTGAGATGTTGTTTGTTTTGTAAGTCCATGTCCTACTAATATCTGATTTTATATTTCCTG CTTTTGAATTAAGGTTTGTTTATTTATTTATTCATACTGGCATGATCATATCATAGTGAATTGAGTTAACAATGACTTTTATATTCCAATGTAATTTGCG ATAAATTATGAGTTTCTTTGACTTAATTTTTTTGCTTATTCATGATAGATGGGTTGTTTCCTGAGTTGGTTGAGCTCTATAAAGTTTTGGGTTACTGAGA TTAGTGTATTAGTGCACATTATTTATGGATTTTTCTATGAAAATATCAAGCGTTTCAACCCTCAGTCGTTTCAGTCATTTGATGCTTTGTTTTTTTAGAT TAGTGTATTAGTGCACATTATTTATGGATTTTTCTATGAAAATATCAAGCGTTTCAACCCTCAGTCGTTTCAGTCATTTGATGCTTTGTTTTTTTAGATT ATAGTATTTTTTATAATTTAATATTATTCAACTCACAAACTTGAGCATTGAACCTATCTTTGATAGTTTGAATGTTATTCACACTCACAAACCACTCAGC CGCTTTCAATGTGCAAGTGATTATTTTTTGAAACCACTCGAGTGTTGAAGTCTAACTTCAATCATTTTGATATTATTCACACTCACAATCCACTTGAGCA TTGAAAGTTGAAACACTTGAGTGTTTATTATTTTAATGCATTCTTTACTGTTTTGTATGTGTGTAATAGTTGGCTATTTATAGCTATACACATTTCTCAA TATATCAAATATTTTGATCCTGCCGAAGATAGGGATGCATGCTTTTATTCGGTTGTGTGCAGAAGTGGTTGAGCTCTCATCCACATATGATCAAACATTT TGGTTTATTGAGATTAGTGTATATATACAAATTATTTATAACCTTGTTCATTAGATAATACTCCTTCCATTCTGTATATTTTTTGTTCAAGGTTAATGTA CACAGATTAAGAAATCATTAAAAAGTACTATGTTTTGACTAACACGTTTCTCTATTTCCAATGAGAGAAGGAGGAAAAAATAGAATCAATTAATGATAAG TGTAATTGTTGAGTGATGATAGAATTTGATATAAATTTTATTTAGATTTAGATCGAATAAATTTGCTTTATGAATTGGCTAATGCAAATGATTAGTGGGA TAACTTACTCTCAGGGGTTTACCACTGCAGCAAGTTAGCAATATTTGATATTAAGAAACTGAAGAGCTCCAATTCAATGACCTAAAATGCAGTTCAAATT TTGTTTGTTTGATCAATTGGATTAGTCTATTATGAACTTGTGATTTGAAGGAGTATCACTAAAGTTACTTGGTTGTAATTGATCAGAGAAACTGTCATTT CATTCAACATGTATATAATATTCTGTAAGTGCCTATGTTTCATATGTCTTATTTTAGCCATGTTTTTCCAAAGTAAGTTTACAACTTATCTAACCTGAAG TGAGTTATAATTCTGATATTTTTTTTTTGAAGACCTTTATAATCTAGCTATGATTCAGGGCAAAGAAGCTAGTGAACTTCATGTTAAGAACATCTGCTCT ATCCGTAAAGGATGAGTAATCCTTTGGAATTAGTTTATCTTAAATTTGGTTTGAATATGTATATTGTTAAGCTTGATGTTTTAAGTGGCTATTGCCAGGT GAATTGATGTCTGGTTCAGCAGGAATGGGTTTCACACCTCATATCGTCACCGTTGGAGTTGGAGAAGACATTGCAACAAAAATTATGGCATTTTCTCAGC AGGGCCCTAGAGCGATATGCATTTTGTCAGCCACCGGTGCTGTCTCTACGGTGACACTTCGCCAGTCTTCAACTTCAGGCGGCACTGTCACATATGAGGG GTGTTTCGAGATATTATGTCTATCAGGCTCTTACTTGCTTACTGATGGTGGTGGCTCCCGCAACCGAACCGGTGGACTCAGTGTTTCCCTTGCTGGTCCT GGTGGTTGTGTCATTGGTGGAGGAATTGGCGGAGTGCTTATTGCTTCAAGTCAAGTTCAGGTGATAATCGGGAGCTTTATATGGGGTGGATTAAAGGCGA AGAAAATGAGAAAGGAAGCTTCAGAAGTTGCTATGGTATCAGACCATCAGGCTGTTCATAATCCGGAAGTCGCGATTAATAGCATTTCCTCGAATCATAA TTTTCCTCCATCCTCATCTCCAAGCGCCTGGCCTGCATCGCGGCCAGTGGATATGCACAATTCGCATATCGACATCGATTTAATGCGTGGGTAACAATGT ATACATTTCGGATTCATGGTCCCTCTTCTAATTTTCTTGTTGTAGTAATGATAGAATGAAGTGCCAACAATAGTGTAGAAGCCAATGTGACTTGGAATTT GATAAAATGTCACCTATTCATCCATGATTGACTTTGGAATTTTTATATCTTTTTTTAGCTGTGATTGAATTTGAACATTAAGCTTAGGTGATTAGTGGAA ATACCTTTCTACATCTTCAAACTTAAATGTAATTTATCTTTCTTTCAATTCAAGTTCTCTAGAATACTATCACTTAAGAGAAAAATATAATGTTGAC BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_179398; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_379649

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_379649
BlastpAT-hook motif nuclear-localized protein 9 from Arabidopsis with 44.79% of identity
BlastxAT-hook motif nuclear-localized protein 9 from Arabidopsis with 56.72% of identity
EggnogAT hook motif domain containing protein, expressed(ENOG410YDXW)
KeggLink to kegg annotations (AT2G45850)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019460600.1)
PfamAT hook motif (PF02178.18)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;