Ll_transcript_377467

• Id Trinity: TRINITY_DN50726_c0_g1_i31
• Name Transcript: Ll_transcript_377467
• Sequence: ATCTACTACAATTGGTGACGAGGAGATAGGTTCAAGGGAAGAGATGCAAGAATTGTTATTGAGTGTTGGTATAATATCCCCCGTCACCAAAGAGTCTGCG GGTGCTTTGTATCATCAACAGTTATCTCGTCAGTGGGGAGCCTTGGCGCAAAGATAAGGTTGTTGTTTAGCGACGAAGAGGTGATGAGTTCAAATCTTGG AAAGAGCCTATCTGCTTGCAAGTTTAGGCTGCATACATCTACCCTTCCCAAACCCCACTAGGTGGGAGCTTGTGCACTGGGCTACCCTATTTTTAATTGG GAGGTTATCAGGACTTGTGTTCAGTGAGCGAAATGGGAACATTTAAGTTCGGCTAGTATGACAGGAACTCAGGAATAATGAAGTATTCATAAAATATGAT CCATATCTTAGTGAACATGTTGAGATGAATCTGCTTTTGGTGATGAGTGATGAGAAGGAAGAGCCGACAGCAGGGTAGTATCAACGACAGCTGGTATTGA AGAAAATCTAAAAATACTAGAAACCAAGCCAAGAAGGATTAACATGAGAGTAACAATGGTCTCTGCCTTCTTAATGCTATGGATTAAATTAACAATATCT TGCTGATGGGCTTTCTTTAAGGGAAACTTGATTAGTGGCCTTTTGTTAATTTCCTATTTGTTTAAAATATTCTAATATATCCTTGCTAATACTTAGTTGG CAGATTTTGTCAAAGTCCCACTTGAGAGAGCTGGAGGAATTATCAATCTAATTGATGTTTATTGTCTATTCAATCGTGCTCGCGGCACAGAATTGATTTC ACCTGATGATTTGTTGCAAGCATGTTCTCTGTGGGAGAAGTTTGATGTTTCATTGGTTCTGCGTAAGTTCGATAGTGGAGTCATGGTAATACAGACCAAG TCCCACAGTGATGAAGAGGTTATTGCTAAAATCAAGATACTGGTTATGAAACCTGATGCTCTTCGACATGGGATAAGTGCTAGTGATGCTGCAAGGACAC TTGGAGTTGCCCCAGCAATGGCAAAGAAGCATCTCTTGTCTGCTGAGAGCAAGGGTGTACTATGCAGAGATATAAGCCCTGATGGATTTCGATTTTACAT TAACTTGTTCCTTGAATTTGATCGAGATGATATGTATTTGTAAGTAAACTAGAACTGCTTGATACGTAGTTTTGTCTTCTTGATGTCATGACCAAATCAG TTACCCGGTAGAGCTAACTGCTTTCTGTGCTGAGAAGTACACTATTTGTCTTCTTTATCCAGCGATACTGACTTTGCAGTGTAGCTTGATGCTTTCTAGT TGCTCTAGAGTTAAATTCTGAGTTCTTACATCACATTGGTTTAAACTTGTCGTGCTAAAAGTATTACTTAGTGCCATTTATACAGAGTGAAAGATCAAGG GCTTTATGCCTCATGGGTAAGGGCAAACCATGCTCGTGGGTAGATTTGCAAGCTTGTTCAACCAAATTTAAGGTGTCAAGACCCTATTGGACTGGTTAAG GGAGATAGAGAAAAGTGGTGATCTTCACTCGTCTCAAGGTTAATATTAATGATTTCAAATCAAGCACCTCATCATATCAACAACAAAAATCGTGTTAACA CGTGCAGTCTGCCAAATTGGAGTGGTGTATTTTAATATGGTATTTATATGTTGCAACTTGCAACTGATCCAGTTGAGGAAAGCATGGCGGAGGCAGTAGT TTTGGTAATTTTTTACACGGTACCTTTATGTACATTATAGACATGATTTGCATGAAATTGTTTATTACATAGAAATGTTTGGAAGTTATCAAAATAAGAG AAGTTTTTAGTCATGCTCTCAATTGGCCAAACTACCTTGCTTCTCTTTTATCAATTTTAAAGCGTTGGGAATGTTAACAAGTGCTCTAGGATCATTGTTT ATGGAAGAGGAATTAGAAACTGTGTTGAAAAATGATGTTTTCATATATGAACTCTGCTTTCC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_179422;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_377467

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 0
• PS1: 0
• PS2: 0
• PS3: 0.2
• PW1: 0
• PW2: 0.7
• PW3: 0.1

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_377467

• Blastp: -
• Blastx: Vacuolar protein sorting-associated protein 36 from Arabidopsis with 70.27% of identity
• Eggnog: vacuolar protein sorting(ENOG410XR74)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G04920)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019453473.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;