Ll_transcript_379610

• Id Trinity: TRINITY_DN50764_c0_g2_i21
• Name Transcript: Ll_transcript_379610
• Sequence: TAAACATCATGCTACACATTCTCTCCCTCTCAATATTCTAAACAAACGATTTCTACATAATGTAGTTTTTTCTTTATGCGTGTGTGAACATAATTTTTCC AAAAACAAATGGAATATTTGAAGTTAACTAAACTAAGACAAAGACAAGCCATTAAAATATTCAAAATATTCATATTGTATGGTATTATAGGGTAATGTTG AAGTTGGCATGAACTTATATGAAGACGAAGTTGGTAACTTATGGTGATTCCCGACGCAGTTGAAAGTGATCCAGATCTCAAACATCGTGGTCTGCGGCGG AGGCACGGTGGCTTGCATGATTCGCCCGCGGAAGAAGAGAGTTCGGGTTCGGAGGAAGAGGTGGTGAAGGAATCTTCTTCTGATGAGTGTAACGGGAAGA GTGTTAATTTGAACGGAGGAGAAAAGGAACAAGGTTCCGATGTTCCCGCCGTTGAGTTTATCTACCGTGCTTCATTCCCTGCTCACCGGAGAATCAAGGA AAGCCCACTTAGCTCTGACACTATTTTCCGTCAGAGTCATGCTGGCCTATTCAACCTCTGTGTAGTTGTGCTTGTTTCAGTCAACAGCAGACTTATCATT GAGAATTTAATGAAGTATGGTTGGTTGATTGAGTTTGGCTTTTGGTTTAGTTTGACATCATTGAGAGATTGGCCCCTCTTCATGTGTTGAAAAGTTGGCA CAAAGAAAGTATATTTCTGAGACAGTTGTTGTTCTGCTTCACATAATCATTACAACAACTACACTTTTATATCCAGTTTTAGTAATCCTCAGGTGTGATT CTGCTTTTGTATTTGGTGTCGCGCTAATGCTTTTCGCTTGCATTGTGTGGTTGAAATTAGTATCCTATGCACATACTAACTATGATCTGAGAGCAATTTC CAAATCAACTGAAAAGGGAGAAGCAGTGACCAGTACTCTGAATATTGACTATACTTACGATGTGAGCTTCAAGAGCTTGGTATACTTCACGGTTGCTCCG ACATTGTGTTACCAGGTAGCAAAACTTTAACTCATTTATTTCTGCAACTTTTGGTCAATTTCTTTTATTTGTCGTAGTTGCCTCATTATATTCTCCGATT TTACAGACATTTGCATTCATTTTTCTCTTTCTAGAGTGTATACTGCATAACAGGCATGGACTTACGTGGAATGAGGTTTTTAGCTAGAGGTCAAGTCAGA ATGTGTCAAGCAGAGATAATTACACAGCTAGCAATTAAATTGGTGTCTAGCAATCATTATTGATCGAGAATGTTTGCGATTACTGTGTGATTACTTGATT AGTGCAATTAACTTGTCGTCGCTGGATGGCAATGCTACATCTTTCAGCAAATATGTGCACTTTTTATCCCATCATTACTTTTCACCTTCAAATGTTGACC TCATTCATTTCACAATTGTCCCCTTAGACTGCCAAACATTTTCTAGTATCCAATATTGTGTACATATGTGACAGTATCGAGCATTTTGTAGCATCAAATA TTGTGTATATAAGTGTTCTATCTCGCTGGCAATTTCTCGGTGTTATATATGTGAGACTAAGGGTGTGGATTGGGTTTGATACCTTCTGCTATATTCAGTG TTTATCTTGCAGAGTTCTCACTTTAGAATTTCTTTTAGCAATTTTCTGCATCGGTTAATTAATTTTTTACTGAGCAAAATCTCTAAAATTGTTTTCACTC ACTTGTATTTTACACTATTGTATCAATTATTCTTTGAACTATTGTTATAGCCAAGCTATCCTCGCACACCTTCAATTCGAAAGGGTTGGCTGTTACGCCA AATTGTCAAGCTGATAATATTTACAGGAGTTATGGGATTTATAATAGAACAATATATTAATCCTATTGTGCAAAATTCACAACATCCTTTGAAGGGAAAC CTTCTATATGCCATGGAGAGGATTCTGAAGCTTTCAATTCCAAATTTATACGTATGGTTCTGCATGTTCTACTGCTTTTTTCACCTCTGGTTAAATATAC TCGCAGAGCTTCTTCGATTTGGTGATCGTGAATTCTACAAGGATTGGTGGAATGCCAAAAATGTTGGAGATTATTGGAGACTATGGAATATGCCTGTTCA CAAATGGATGATCCGCCACCTATATTTTCCATGTTTAAGGAATGGTATACCCAAGGGTGTTGCTCTTTTAATCGCCTTCCTGGTTTCTGCTTTGTTCCAT GAGCTGTGCATTGCTGTTCCTTGCCACATATTCAAGTGGTGGGCTTTTATAGGAATTATGTTTCAGGTTCCTGTGGTCTTGATCACTAATTATGTGCAAA ACAAGTTTCAAAACTCAATGGTTGGAAATATGACTTTTTGGTTCACTTTCTGTATTCTTGGGCAACCTATGTGTGTCCTACTATACTACCATGACTTGAT GAATAGGGAAGGCAAAGTTGGCTAAGCTAGCAGCATTGAACAATTTTCGGAGTTAAAGTCATGTTAAGATATGTTGCTCAAATATTGTATGAATTTGCAA ATTAAACAGTTTTGGAAGCAATACACAGGCAATGATAACTGCAAGTAATAGTGTCTGTGTAACTGGTTTCTGTTAATTGGTACAAGTGGTGCTGTAAATT GTTTAGGTTCTATCATCAAAATAGTTGTTCATGTTCAATAAAGCTATATATATTTCTAGCTTGTGAGTTCCACATATGAATGAATAATGATGCCCTTTAA AATGAAAATATTTACCTTATGGTAAGATAAAAGGTTAAAAACTTCAAAAGTTGGGAGAGTATCTTGCTTATGAATTTAGATCTCTCCAATATTGGAGGGT CCAATATCAGAAAGAGACAATATATGGCAAAAAAAGTATAGTTATTTGTTTTAAGAGACTATGGTCATATTTGTATCATTTTTGTTAGGCTAATGTTAAT GACATGTTCTCTCTTTTCTTCAGTATCTCATCCTCCAATCATGTT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_179726;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_379610

FPKM

• PAB: 1.3
• PNAB: 1.2
• PS1: 0.4
• PS2: 1
• PS3: 0.2
• PW1: 0.6
• PW2: 0.3
• PW3: 1.6

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_379610

• Blastp: Diacylglycerol O-acyltransferase 1B from Soja with 57.59% of identity
• Blastx: Diacylglycerol O-acyltransferase 1B from Soja with 88.84% of identity
• Eggnog: Oacyltransferase(COG5056)
• Kegg: Link to kegg annotations (732606)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019443014.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;