Ll_transcript_377348

• Id Trinity: TRINITY_DN50766_c0_g2_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_377348
• Sequence: CTTTCTTGTAAGTATGGATCATTATGCTTGTTTTTCAATTTTAAGATGCACATAAATTCTTTCACATTAAGATGGTTTGATCTAGGTGCTTATTGTTTTC AAATCTCAACTATCAAATTTATCTTATTTTCAGATTAAAGTAGAGAAAATTCTCTGTTAGGATGTGATCTGGATATTTATTTTTTTAAAAGCTAATAGAT CTATCTTATTTGCAAATCAAATTAAGAATAATTTAGATATGTTTCTTCGGTATTAGCAAGGGTATCCGTTCATCATACTGTTAACGAACTAATATCTTTC GAAGCGCATGACTGTACTCCCGATATTTGTCACTCCCAGAAATCAAATACTTCACTAACTTTTTTATCTTTCTGGATGTAGCAGAACCTTTTATTTAATC TGCTTAAAAGCTACTTTCCCAAAGACATTGAAATTATATATGATTATAGTCATAAAAGATTGACTCATAATTTCAACTATGCAAATTGATTAAGATCATA ATGGTTTGATTTTATTTGCAATGAGCAGCTAGCATAGATCCATATGTGATTCTCACATTCAGGGCACAGGAGCACAAGAGCACTGTGAAAGAAGGTGCAT TTCTGCCAAATTTCACTCTGTATTTGCTTCTTTATCAATTTTTTTTCAATATTGGCTCTTGATTACTGTGTTATGTATTAATTGCAGGTGGTGGATCCAA CCCACTATGGAATGAGATCTTTCTTTTCACTGTTTCCGATAGTGCTTCTGAACTTAATCTGAAGATAATGGAAAAAGACAATTTTAACCAAGATGATTTT CTTGGTGAGGCAATGTAAGTTAAATTCTTCTCTCTTGTTGAATAACTATAACTTGTAGAGGATCCAAATCCCATATATTGTTTTTCAACTCCAATTTCAT TGAAAATGAAAGGGTGGAAGACAAAATCCAAATTTCAGATGTTGCTTTTTCATTCCAATTTCATTTGGAAATGATAAGATGGAATTTCAAGTGAAGAGAC TTATAATGTAATTTCTGAATTTCTAATGGACCAAAAATATGATGCAAATTTCCGTCCTAACTAGCTGTAGTTACTGGTCTCATGTGAAGTTTTTGTTAAA TTGAATTTTCATTTGCTTTTTGCAATGAGTAATTGTTGTTGATGCAAATGATTTAATTTTTTTTGCTACTCTTCCGTCTCCTAGCCAGATTCGAACCAAT GATTTAAACATAACATACTCGAAAGTGTAAAAAAAATTTATACTGAAATCGTCTTGTCACATCATCTAAAAATATTTAACTCACACTAATCAATTCAAAA GTGACTTATGATTCCTGAATGGTTGATGGAGTAACAATTTTTAGATTGATAATGCATCAAAATTAAACTATGATACAGAAAGTGGTTAGAATGGGGCATC TGCATTTTTGGCATACTAAATAAGCATTCATCTCTACATGCAGAATTCCTATAGATGCAGTGGTTGCAGAAGGCAGCATTCCAGAGACTGCATACAATGT TGTGAAGGATGAAGACTATCGTGGAGAAATTAAGGTGGCTCTCACTTTTACTCCTGAGCCAGAGGTAACGCTAGAAGCCTAGAATCACTATTTTAAATAT ACCCGAATCACCATTGTGATGAGAATCGATAAACTTGTTACAATTAGAGGGAGGGTCGCATTGACTTACATCCGATAGGAATGAACCCACGAATTTGCCA ATTATGAGTTGGGCACTTTAAGCATTCAGTGATGGACGCTGAGTAGGAATTTTCTTATATAGTACTTTCTAATTGAAGTTAAATCTTTCAGAGAAATCAA CACAAACACTACAACACTACAGCGAGTCCACGACCACAATTTAATAAACTGATTAAAAATATTTTGTTATGTTACTTTTCTAATGCTTAGAGGCCTAGGT GAATTCCAATTTACCATTAACCTTTGTGGTTGCAGAGATATGATGACCGCTACAAGGCAGAAGAAAACTATGGGGGATGGACACAATTTAACAGAGATAT ATAAAGTGAAGCAAGTATTTACAATTTTCCGGGACCCATGATTTCATTTGGAACAAAAAATAAGCAGTTTTAGGTCACTGGGAAATTCTACTACAGTGTT TTTGTCTTTCTAGTGTGATGATACGAATTATGATGTTTGGTTGTTTCCTCCCTTTACGAGTTTAAGTGTAAAATTTTTTCTGCTTAACATTTTATTTAAC AGAAATTTAATTCATTTTAATGTTGCATATCCTCATCATCCTCATGCAAGAAAAACCTGGCCTGTATCCGTGAATGGTACATGTAATAATAGATTATGGG TGTGAACAAGATTTATGATACTCGTGAGTATCAC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_179734;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_377348

FPKM

• PAB: 0.3
• PNAB: 0.1
• PS1: 0.6
• PS2: 0.3
• PS3: 0.6
• PW1: 0.1
• PW2: 0
• PW3: 0

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_377348

• Blastp: -
• Blastx: Elicitor-responsive protein 3 from Oryza sativa with 60.87% of identity
• Eggnog: Domain-Containing protein(COG5038)
• Kegg: Link to kegg annotations (4336487)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019454769.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;