Ll_transcript_378957

Id TrinityTRINITY_DN50770_c0_g1_i25
Name TranscriptLl_transcript_378957
SequenceCTCTTTTCTTGTGTGCGTTGTTTTGCTTTGTTCCATTCCCAACACTGTTCCGAAAGGGTTAAAGGCTTCACCGTTTTGGCCTCCTCTTTTCTCTTCTAAT TCTTCGCATTCGTTTTCTCATTCTCCTTCTTCTTCATTTCGCACACACACTCTCTCTCTCTCACAACGTGTTCTTCGTTTATCACCAGCACAATTAAACC AGGTGTGTGCCAACCTTCAAGCTACCCATGTGGTTTTAACATTGTCTTTCGTATTGGGTGAAATCTGATTAAAGAGCTATGCAGAGCGATACTAGTACTA GTGCCCCTCCAACTTCTGGTGGTCGGATTAGGCACCGAAAACGTTCATCTGAGGTCATTCCGGAAGATAGCAAAGCAAATGGAACCCGGTTACTTGTTAA TGACAAAAGCAAATATAAGTCCATGATAATTCGTGCATATTCATCCATTTGGATGATTGGGGGCTTTGTGTTAATCATCTATATGGGTCATCTCTATATT ACAGCGATGGTTGTTGTAATCCAAATCTTCATGGCAAAAGAGCTTTTCAATCTACTCAGGAGAGCTCATGAAGATAGACAGCTGCCAGGATTTAGGCTAT TAAATTGGCATTTTTTCTTCACTGCAATGTTATTTGTTTATGGACGTACTCTGAGTCCACGCCTGGTTAACACAGTTACTTCAGACATGGTTTTATATCG GCTAGTGAGCAGTCTTATAAAGTATCATATGGTTATCTGCTACTCCCTGTACATTGCAGCATTCATGTGGTTCATTCTCACATTAAAGAAGAAGATGTAT AAGTACCAATTTGGTCAGTATGCTTGGACACATATGATTCTGATTGTTGTATTTGGGCAGTCCTCCTTTGCCGTGGCAAGCATTTTTGAAGGGATTTTCT GGTAATATAACCTACTAAAGGAAATAATGATTACCTTACCATTGCTAAAAAACATATTTGGCTGTCTTTTAGGTTCCTCTTTAGCATGATATCATATTTA ACTGCACTGTTCCTTATCCACATGGAACACGTTTTAGGCAAGATTCTTTTTAATGTTATTTGACTGCTCTTTGGCGCCACAATAATCACCTCATAGAATG GTTAAATAATTATATTTTGTCCAAGGATTTAAGCATAACATGTATAAATCAGTGGATTGTTGTCTAAGTCCAACATGATCTTTCAACACAAGATTTTGGT GGAAAAGATTTGGGAGACATGTACAATATCACAATGATGTTGTTTGATCCATGTAGTTGGCCACTTGGCCTTGCCTATTGGGTTTTTGTTGCTCTGTTAT TTACAAAGAATGTTTCTATTTAGTATATCATCCTAACACTCATTCACTCCCCAACTATTTTTCCAATCTCCCTTTTCAAGGTTTGATTGTTGACAGTAGT ATTTATTCTTTTCCCTCAGTAAAATTTGTATTGTTTATTAATTACACCGATGAGAGTGCATCATCTTGAACTGCTCAGGTTTTAAGTGGTTTTATATGTA TGCATGCATGCATCATTGATAGAATTGTCTTTTTTTTAATCTGTTGCCATTGCTTTGACACAAGTAAAACATCCCACATTCAGCATCACTATTTTGTGGC TTCAAGATGACACTTTGTATTGAGAATTGAATTGATGTTAGTGCTTTCCTTTTCTTTTACCATACAGGTTTCTTCTTCCAGCATCACTAATTGTAATTAA TGACATTGCTGCTTATTTCTTTGGTTTCTTCTTTGGAAGAACCCCTTTGATCAAGTTATCTCCAAAGAAAACTTGGGAGGGCTTTATTGGGGCATCTGTT ACAACCATTATCTCTGCATTTCTGCTTGCTAGCATCATGGGTCGGTCTCAATGGCTAACATGTCCAAGGAAGGATTTGTCATCTGGCTGGCTTGATTGTG ATCCTGGTCCGCTGTTTAAGCCAGACTCCTATTCCTTAACGGGCCAAGTTCCTCACTGGGTAAGTACATGACACTCAGCTACATTTATAATCCTTGAAGC CACAATATATATGTATATATATATATTTACATGTGGAATCAAGTGTGGTGTACCCAATCAATGAGGATGCACTAATCTAAAATTCACTAAATAAGTAATA GCTTCCCCAAATTCACCAATACAATCTAGAAGCCCCAGGTAGCAAAAGCAACCTCAAATTTGACTGAGACTCAAAAAATCTGTAAAACATGTGAATGTGA AATTGTATCTGATGCGAACCTTGGGAGAAACCATACCACAAAGTTACTATTGTGGTGGGAGAGCTCAAGGTTATGTAATACAACAACAAAGACCCATGTT GGGCTCAAGTCCCACATCTTGCAGTATGATCCTAATTCCACTAGGCTCTGCAGCTCTGACACTCATGTAGGCCAGCTTTGCAGGTAGCCCTTGACTAGTT CCGGGGTGAATGCTGCAAAGAGACATTTTGTAAAGTTCTAATGCGTAGTGATTCAAACCTTGGAAGAACGACACCACAAAAGCTACTCTTTGTTGTCGGA GAGCCCAAGGCCATATAAATCCCACACTGGAATCCCATACTTCTGATGTGGGGCTCCTATCTTACAATTGGTCCTAACAGAATCAGACTCAAAAGTGGCA GAGCATCCAAAAAATTGCTAAGTCAGCCAATCACACAATTCGATCAATGGTTTAAATCAGCTCAGTCGATGACAAATCAGCCTGGTCAATGAATTGACAA TTTTCTCATGAATGTAAAGGTTAAATTTGAACCATTCACTGTAACTTCCTCTCTGAGATATAATTGCCATTAAATACATGGTTAGAGTTTGATTGCTACA CTCCACCTGAGCTTATAAAATATGACCATACTGTCATGAAATGCCAATCCAGGTTCCCAGAATATCTGAAAATCATAACCTATCACATTGTCTCTTGTTC TATATGCAGTTTCCTTGGAAAGAGATATCAATCCTACCAGTTCAATGGCATGTTTTATGTCTTGGTTTGTTTGCTTCAGTAATTGCGCCTTTTGGAGGCT TCTTTGCAAGTGGTTTCAAAAGGGCTTTTAAAATAAAGGATTTTGGTGATAGTATTCCAGGGCATGGTGGAATTACTGACAGAATGGACTGCCAGGTACA CTCTTGCTGTTTCAATATATGAAGATCTATCGTAAATTGTTAATATTTGACTACTTGTGACTTCTATATATCATCATTCATAAACTCAATTTAAAATCAT GGTTTCTCTCCCCATGTGTCAGCCTCTAACCTCAATGAAAGAAAAAAGGAACTCCTTAGGGGAAAAAATGACACAAGTTAAGATGATCATGTCAATCAAA TAATGAGATAAAGGGGCATTTTTATGTTCACTTAATTCAAATGTGGAGTTGGAAACATCCAGAGGATGTCCTATGATAAACAAACATATACAATGTTTTC TTCGTGGTGTACTGTAGTGAATATGGATGTCAAATGCGTACCCCCTCCCTCTCTAACTTCCTCCTTCCTCAACAGTTTAAGTGCTGCCGTATACTCTATG TTTATATTAGATCTGGTCTGTTCTTTTTTTAGGGTAAAAGTGGAAGCTAAAATCATCCTAGTATCCTACTTAAATTTTCAAGCAAGATTTAACCATTTTT TCCTATTGTAGATGGTAATGGCTGTATTCGCATATATATATCATCAGTCATTCATTGTGCCACAAAGTTTCTCAATTGAAATGATTTTAGACCAGATATT GATGAACCTGTCATTCGATGAACAACAAGCTCTATATATGAGGCTTGGGGAAATGTTGCAACAAGGGGTTCAGGGGCAGTCTTAGATCCATGCCAAGGTG TATTCTACTCACTTTCTATTTTGTGATTTCTTCTTTGGCATGGGGAAGTGGAAAAAAGGTTCTTTGTACATGTGTTCTATCCTGAATGAAATGGGTCAAA GATTCAAGAAGCTGTCGAGATTTGTATATTAGTCTCAAATATTTACTTATGACTTTGCTTGAACAACCATTGCTTATTCATATGGCTAATAGCAGAAGTG AATGCCTTTACTGTATTTAATTTCTTGAGGGGAGTGATTAACATTTTTCAACTACATTTTAACCAATGTTCTGTTGCAATAAGCAAAGAAATCTTATTCT ACTAGCGCATTTTGATGTAAAGTAGCTAGTTGTTAAAGCATACACATTGTAGTGTTATTTACCAAAGCTTTTGATGGGGGTGCATAATATGCTCAATATA AACTAATTTTAAGTTGC BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_179770; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_378957

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_378957
BlastpPhosphatidate cytidylyltransferase 2 from Arabidopsis with 76.92% of identity
BlastxPhosphatidate cytidylyltransferase 2 from Arabidopsis with 76.92% of identity
Eggnogphosphatidate Cytidylyltransferase(COG0575)
KeggLink to kegg annotations (AT4G22340)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019439978.1)
PfamCytidylyltransferase family (PF01148.19)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;