Ll_transcript_378965

Id TrinityTRINITY_DN50770_c0_g1_i32
Name TranscriptLl_transcript_378965
SequenceAGGGTATGAGGAGATATTGACTTTATGGAAGTTGAAGCTTCTGAACTGTGGAGTAGTAGTGAAGGAATGATTTTGTGCTGCAAATTTGTAATGCTTACAA TGGATATGGAGTTTCATATTAAGCATTGCTAGTTTCTGAAAATGTGGCATCCCTGAAAGTGTCCGTTTGTAGAAGAAGATGATGCGGGATAAAATGACTT GCTTAAATGAGTATACAGTGCAAGTGGCTATGGATTCGGTGAAAAAGGAAGAATACTAATTTGAAAAATTCAATTAATTTACCTTCCCTGCTCAACAATC AAGTCGATTCAGTTACCTTCAGATGTACCATATCACTTGACTTTTTATACTCTGGGCATTTGCCACGTGATGGAATCTAATTTGACTGGTCTTTTGCCAG AAAGGCTTACAATTTTGGTTCTGTGTGATTGGTGTGCTGAATTGTGCTTTATACATACAGAGAATTATATTTGATGTCATTCATTTTGCAGGTGTTTGAT TATCTTCGGGCTACCCATGTGCTTTTAAAATTGTCTTCCACTTGGGTGAAATCTGATTAAAGAGCCATGCATAACGATACTAGTACCAGTGCCCCTCCAA CATCCGGTGGTCGGATTAGGCACCGTAAACGCTCAAATGAGGTTATTCCGGAAGATAGCAAAGCAAATGGAACGCGGTTACTTGTTAATGACAAAAGCAA ATATAAGTCCATGATAATTCGTGCATATTCATCCATTTGGATGATTGGGGGCTTTGTGTTAATCATCTATATGGGTCATCTCTATATTACAGCGATGGTT GTTGTAATCCAAATCTTCATGGCAAAAGAGCTTTTCAATCTACTCAGGAGAGCTCATGAAGATAGACAGCTGCCAGGATTTAGGCTATTAAATTGGCATT TTTTCTTCACTGCAATGTTATTTGTTTATGGACGTACTCTGAGTCCACGCCTGGTTAACACAGTTACTTCAGACATGGTTTTATATCGGCTAGTGAGCAG TCTTATAAAGTATCATATGGTTATCTGCTACTCCCTGTACATTGCAGCATTCATGTGGTTCATTCTCACATTAAAGAAGAAGATGTATAAGTACCAATTT GGTCAGTATGCTTGGACACATATGATTCTGATTGTTGTATTTGGGCAGTCCTCCTTTGCCGTGGCAAGCATTTTTGAAGGGATTTTCTGGTAATATAACC TACTAAAGGAAATAATGATTACCTTACCATTGCTAAAAAACATATTTGGCTGTCTTTTAGGTTCCTCTTTAGCATGATATCATATTTAACTGCACTGTTC CTTATCCACATGGAACACGTTTTAGGCAAGATTCTTTTTAATGTTATTTGACTGCTCTTTGGCGCCACAATAATCACCTCATAGAATGGTTAAATAATTA TATTTTGTCCAAGGATTTAAGCATAACATGTATAAATCAGTGGATTGTTGTCTAAGTCCAACATGATCTTTCAACACAAGATTTTGGTGGAAAAGATTTG GGAGACATGTACAATATCACAATGATGTTGTTTGATCCATGTAGTTGGCCACTTGGCCTTGCCTATTGGGTTTTTGTTGCTCTGTTATTTACAAAGAATG TTTCTATTTAGTATATCATCCTAACACTCATTCACTCCCCAACTATTTTTCCAATCTCCCTTTTCAAGGTTTGATTGTTGACAGTAGTATTTATTCTTTT CCCTCAGTAAAATTTGTATTGTTTATTAATTACACCGATGAGAGTGCATCATCTTGAACTGCTCAGGTTTTAAGTGGTTTTATATGTATGCATGCATGCA TCATTGATAGAATTGTCTTTTTTTTAATCTGTTGCCATTGCTTTGACACAAGTAAAACATCCCACATTCAGCATCACTATTTTGTGGCTTCAAGATGACA CTTTGTATTGAGAATTGAATTGATGTTAGTGCTTTCCTTTTCTTTTACCATACAGGTTTCTTCTTCCAGCATCACTAATTGTAATTAATGACATTGCTGC TTATTTCTTTGGTTTCTTCTTTGGAAGAACCCCTTTGATCAAGTTATCTCCAAAGAAAACTTGGGAGGGCTTTATTGGGGCATCTGTTACAACCATTATC TCTGCATTTCTGCTTGCTAGCATCATGGGTCGGTCTCAATGGCTAACATGTCCAAGGAAGGATTTGTCATCTGGCTGGCTTGATTGTGATCCTGGTCCGC TGTTTAAGCCAGACTCCTATTCCTTAACGGGCCAAGTTCCTCACTGGGTAAGTACATGACACTCAGCTACATTTATAATCCTTGAAGCCACAATATATAT GTATATATATATATTTACATGTGGAATCAAGTGTGGTGTACCCAATCAATGAGGATGCACTAATCTAAAATTCACTAAATAAGTAATAGCTTCCCCAAAT TCACCAATACAATCTAGAAGCCCCAGGTAGCAAAAGCAACCTCAAATTTGACTGAGACTCAAAAAATCTGTAAAACATGTGAATGTGAAATTGTATCTGA TGCGAACCTTGGGAGAAACCATACCACAAAGTTACTATTGTGGTGGGAGAGCTCAAGGTTATGTAATACAACAACAAAGACCCATGTTGGGCTCAAGTCC CACATCTTGCAGTATGATCCTAATTCCACTAGGCTCTGCAGCTCTGACACTCATGTAGGCCAGCTTTGCAGGTAGCCCTTGACTAGTTCCGGGGTGAATG CTGCAAAGAGACATTTTGTAAAGTTCTAATGCGTAGTGATTCAAACCTTGGAAGAACGACACCACAAAAGCTACTCTTTGTTGTCGGAGAGCCCAAGGCC ATATAAATCCCACACTGGAATCCCATACTTCTGATGTGGGGCTCCTATCTTACAATTGGTCCTAACAGAATCAGACTCAAAAGTGGCAGAGCATCCAAAA AATTGCTAAGTCAGCCAATCACACAATTCGATCAATGGTTTAAATCAGCTCAGTCGATGACAAATCAGCCTGGTCAATGAATTGACAATTTTCTCATGAA TGTAAAGGTTAAATTTGAACCATTCACTGTAACTTCCTCTCTGAGATATAATTGCCATTAAATACATGGTTAGAGTTTGATTGCTACACTCCACCTGAGC TTATAAAATATGACCATACTGTCATGAAATGCCAATCCAGGTTCCCAGAATATCTGAAAATCATAACCTATCACATTGTCTCTTGTTCTATATGCAGTTT CCTTGGAAAGAGATATCAATCCTACCAGTTCAATGGCATGTTTTATGTCTTGGTTTGTTTGCTTCAGTAATTGCGCCTTTTGGAGGCTTCTTTGCAAGTG GTTTCAAAAGGGCTTTTAAAATAAAGGATTTTGGTGATAGTATTCCAGGGCATGGTGGAATTACTGACAGAATGGACTGCCAGGTACACTCTTGCTGTTT CAATATATGAAGATCTATCGTAAATTGTTAATATTTGACTACTTGTGACTTCTATATATCATCATTCATAAACTCAATTTAAAATCATGGTTTCTCTCCC CATGTGTCAGCCTCTAACCTCAATGAAAGAAAAAAGGAACTCCTTAGGGGAAAAAATGACACAAGTTAAGATGATCATGTCAATCAAATAATGAGATAAA GGGGCATTTTTATGTTCACTTAATTCAAATGTGGAGTTGGAAACATCCAGAGGATGTCCTATGATAAACAAACATATACAATGTTTTCTTCGTGGTGTAC TGTAGTGAATATGGATGTCAAATGCGTACCCCCTCCCTCTCTAACTTCCTCCTTCCTCAACAGTTTAAGTGCTGCCGTATACTCTATGTTTATATTAGAT CTGGTCTGTTCTTTTTTTAGGGTAAAAGTGGAAGCTAAAATCATCCTAGTATCCTACTTAAATTTTCAAGCAAGATTTAACCATTTTTTCCTATTGTAGA TGGTAATGGCTGTATTCGCATATATATATCATCAGTCATTCATTGTGCCACAAAGTTTCTCAATTGAAATGATTTTAGACCAGATATTGATGAACCTGTC ATTCGATGAACAACAAGCTCTATATATGAGGCTTGGGGAAATGTTGCAACAGGGGGTTCAAGGACAGTCTTAGATCCACATGCTAAGGTGTATTATCCTC TTGCATTCTATTCCATGCCTTCTTCATTGACATGGGTAAGTGGAAAATATACTTAGTAGATGTGTGTTCTATCCTTTGAGAAATGGATCAAATATTGAAG AAGCTGTCAAGATGTGTATAGTGTATCCTGAACACTAATATTTTGTTCTTAGTTTCTTTGGCTTAGTATACGACTTTGCTTGAACAGCCATCACTTATTC ATGTAGCCAATAACAGAAGTGAACGCATGTACTGTATTCAATTTCTTAAGGGGAGTGTTTAACATTTTTCAATTACCTTTGAATCATAAATCTTATTCTA CTACTACACATGTTGCAAAGGGAAACAGCTATAGCAATATAGCATTTACTAAAA BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_179770; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_378965

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_378965
BlastpPhosphatidate cytidylyltransferase 1 from Solanum with 80.29% of identity
BlastxPhosphatidate cytidylyltransferase 1 from Solanum with 80.29% of identity
Eggnog-
KeggLink to kegg annotations (102597765)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019419797.1)
PfamCytidylyltransferase family (PF01148.19)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;