Id Trinity | TRINITY_DN50770_c0_g1_i34 |
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Name Transcript | Ll_transcript_378969 |
Sequence | AGGGTATGAGGAGATATTGACTTTATGGAAGTTGAAGCTTCTGAACTGTGGAGTAGTAGTGAAGGAATGATTTTGTGCTGCAAATTTGTAATGCTTACAA TGGATATGGAGTTTCATATTAAGCATTGCTAGTTTCTGAAAATGTGGCATCCCTGAAAGTGTCCGTTTGTAGAAGAAGATGATGCGGGATAAAATGACTT GCTTAAATGAGTATACAGTGCAAGTGGCTATGGATTCGGTGAAAAAGGAAGAATACTAATTTGAAAAATTCAATTAATTTACCTTCCCTGCTCAACAATC AAGTCGATTCAGTTACCTTCAGATGTACCATATCACTTGACTTTTTATACTCTGGGCATTTGCCACGTGATGGAATCTAATTTGACTGGTCTTTTGCCAG AAAGGCTTACAATTTTGGTTCTGTGTGATTGGTGTGCTGAATTGTGCTTTATACATACAGAGAATTATATTTGATGTCATTCATTTTGCAGGTGTTTGAT TATCTTCGGGCTACCCATGTGCTTTTAAAATTGTCTTCCACTTGGGTGAAATCTGATTAAAGAGCCATGCATAACGATACTAGTACCAGTGCCCCTCCAA CATCCGGTGGTCGGATTAGGCACCGTAAACGCTCAAATGAGGTTATTCCGGAAGATAGCAAAGCAAATGGAACGCGGTTACTTGTTAATGACAAAAGCAA ATATAAGTCCATGATAATTCGTGCATATTCATCCATTTGGATGATTGGGGGCTTTGTGTTAATCATCTATATGGGTCATCTCTATATTACAGCGATGGTT GTTGTAATCCAAATCTTCATGGCAAAAGAGCTTTTCAATCTACTCAGGAGAGCTCATGAAGATAGACAGCTGCCAGGATTTAGGCTATTAAATTGGCATT TTTTCTTCACTGCAATGTTATTTGTTTATGGACGTACTCTGAGTCCACGCCTGGTTAACACAGTTACTTCAGACATGGTTTTATATCGGCTAGTGAGCAG TCTTATAAAGTATCATATGGTTATCTGCTACTCCCTGTACATTGCAGCATTCATGTGGTTCATTCTCACATTAAAGAAGAAGATGTATAAGTACCAATTT GGTCAGTATGCTTGGACACATATGATTCTGATTGTTGTATTTGGGCAGTCCTCCTTTGCCGTGGCAAGCATTTTTGAAGGGATTTTCTGGTAATATAACC TACTAAAGGAAATAATGATTACCTTACCATTGCTAAAAAACATATTTGGCTGTCTTTTAGGTTCCTCTTTAGCATGATATCATATTTAACTGCACTGTTC CTTATCCACATGGAACACGTTTTAGGCAAGATTCTTTTTAATGTTATTTGACTGCTCTTTGGCGCCACAATAATCACCTCATAGAATGGTTAAATAATTA TATTTTGTCCAAGGATTTAAGCATAACATGTATAAATCAGTGGATTGTTGTCTAAGTCCAACATGATCTTTCAACACAAGATTTTGGTGGAAAAGATTTG GGAGACATGTACAATATCACAATGATGTTGTTTGATCCATGTAGTTGGCCACTTGGCCTTGCCTATTGGGTTTTTGTTGCTCTGTTATTTACAAAGAATG TTTCTATTTAGTATATCATCCTAACACTCATTCACTCCCCAACTATTTTTCCAATCTCCCTTTTCAAGGTTTGATTGTTGACAGTAGTATTTATTCTTTT CCCTCAGTAAAATTTGTATTGTTTATTAATTACACCGATGAGAGTGCATCATCTTGAACTGCTCAGGTTTTAAGTGGTTTTATATGTATGCATGCATGCA TCATTGATAGAATTGTCTTTTTTTTAATCTGTTGCCATTGCTTTGACACAAGTAAAACATCCCACATTCAGCATCACTATTTTGTGGCTTCAAGATGACA CTTTGTATTGAGAATTGAATTGATGTTAGTGCTTTCCTTTTCTTTTACCATACAGGTTTCTTCTTCCAGCATCACTAATTGTAATTAATGACATTGCTGC TTATTTCTTTGGTTTCTTCTTTGGAAGAACCCCTTTGATCAAGTTATCTCCAAAGAAAACTTGGGAGGGCTTTATTGGGGCATCTGTTACAACCATTATC TCTGCATTTCTGCTTGCTAGCATCATGGGTCGGTCTCAATGGCTAACATGTCCAAGGAAGGATTTGTCATCTGGCTGGCTTGATTGTGATCCTGGTCCGC TGTTTAAGCCAGACTCCTATTCCTTAACGGGCCAAGTTCCTCACTGGGTAAGTACATGACACTCAGCTACATTTATAATCCTTGAAGCCACAATATATAT GTATATATATATATTTACATGTGGAATCAAGTGTGGTGTACCCAATCAATGAGGATGCACTAATCTAAAATTCACTAAATAAGTAATAGCTTCCCCAAAT TCACCAATACAATCTAGAAGCCCCAGGTAGCAAAAGCAACCTCAAATTTGACTGAGACTCAAAAAATCTGTAAAACATGTGAATGTGAAATTGTATCTGA TGCGAACCTTGGGAGAAACCATACCACAAAGTTACTATTGTGGTGGGAGAGCTCAAGGTTATGTAATACAACAACAAAGACCCATGTTGGGCTCAAGTCC CACATCTTGCAGTATGATCCTAATTCCACTAGGCTCTGCAGCTCTGACACTCATGTAGGCCAGCTTTGCAGGTAGCCCTTGACTAGTTCCGGGGTGAATG CTGCAAAGAGACATTTTGTAAAGTTCTAATGCGTAGTGATTCAAACCTTGGAAGAACGACACCACAAAAGCTACTCTTTGTTGTCGGAGAGCCCAAGGCC ATATAAATCCCACACTGGAATCCCATACTTCTGATGTGGGGCTCCTATCTTACAATTGGTCCTAACAGAATCAGACTCAAAAGTGGCAGAGCATCCAAAA AATTGCTAAGTCAGCCAATCACACAATTCGATCAATGGTTTAAATCAGCTCAGTCGATGACAAATCAGCCTGGTCAATGAATTGACAATTTTCTCATGAA TGTAAAGGTTAAATTTGAACCATTCACTGTAACTTCCTCTCTGAGATATAATTGCCATTAAATACATGGTTAGAGTTTGATTGCTACACTCCACCTGAGC TTATAAAATATGACCATACTGTCATGAAATGCCAATCCAGGTTCCCAGAATATCTGAAAATCATAACCTATCACATTGTCTCTTGTTCTATATGCAGTTT CCTTGGAAAGAGATATCAATCCTACCAGTTCAATGGCATGTTTTATGTCTTGGTTTGTTTGCTTCAGTAATTGCGCCTTTTGGAGGCTTCTTTGCAAGTG GTTTCAAAAGGGCTTTTAAAATAAAGGATTTTGGTGATAGTATTCCAGGGCATGGTGGAATTACTGACAGAATGGACTGCCAGGTACACTCTTGCTGTTT CAATATATGAAGATCTATCGTAAATTGTTAATATTTGACTACTTGTGACTTCTATATATCATCATTCATAAACTCAATTTAAAATCATGGTTTCTCTCCC CATGTGTCAGCCTCTAACCTCAATGAAAGAAAAAAGGAACTCCTTAGGGGAAAAAATGACACAAGTTAAGATGATCATGTCAATCAAATAATGAGATAAA GGGGCATTTTTATGTTCACTTAATTCAAATGTGGAGTTGGAAACATCCAGAGGATGTCCTATGATAAACAAACATATACAATGTTTTCTTCGTGGTGTAC TGTAGTGAATATGGATGTCAAATGCGTACCCCCTCCCTCTCTAACTTCCTCCTTCCTCAACAGTTTAAGTGCTGCCGTATACTCTATGTTTATATTAGAT CTGGTCTGTTCTTTTTTTAGGGTAAAAGTGGAAGCTAAAATCATCCTAGTATCCTACTTAAATTTTCAAGCAAGATTTAACCATTTTTTCCTATTGTAGA TGGTAATGGCTGTATTCGCATATATATATCATCAGTCATTCATTGTGCCACAAAGTTTCTCAATTGAAATGATTTTAGACCAGATATTGATGAACCTGTC ATTCGATGAACAACAAGCTCTATATATGAGGCTTGGGGAAATGTTGCAACAAGGGGTTCAGGGGCAGTCTTAGATCCATGCCAAGGTGTATTCTACTCAC TTTCTATTTTGTGATTTCTTCTTTGGCATGGGGAAGTGGAAAAAAGGTTCTTTGTACATGTGTTCTATCCTGAATGAAATGGGTCAAAGATTCAAGAAGC TGTCGAGATTTGTATATTAGTCTCAAATATTTACTTATGACTTTGCTTGAACAACCATTGCTTATTCATATGGCTAATAGCAGAAGTGAATGCCTTTACT GTATTTAATTTCTTGAGGGGAGTGATTAACATTTTTCAACTACATTTTAACCAATGTTCTGTTGCAATAAGCAAAGAAATCTTATTCTACTAGCGCATTT TGATGTAAAGTAGCTAGTTGTTAAAGCATACACATTGTAGTGTTATTTACCAAAGCTTTTGATGGGGGTGCATAATATGCTCAATATAAACTAATTTTAA GTTGC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_179770; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_378969
Blastp | Phosphatidate cytidylyltransferase 1 from Solanum with 80.29% of identity |
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Blastx | Phosphatidate cytidylyltransferase 1 from Solanum with 80.29% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | Link to kegg annotations (102597765) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019419797.1) |
Pfam | Cytidylyltransferase family (PF01148.19) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |