Ll_transcript_377223

• Id Trinity: TRINITY_DN50778_c3_g2_i3
• Name Transcript: Ll_transcript_377223
• Sequence: CCAAATGAATTATTTAAATAAGGTAAGATATCCTTTTCTTGTTTGTTCTGTGAAATTTATATTTCCTTCAAGTACTATCATGTACTTCTTATCTACGTCT AACAAGTGGCATAATGTACTTCTTTTGCTCAACACTGGATGTGTACTTCAAAATGGTTTAATAGACTTTCCCTTGTAAGTTTGTAACATTCAGTGAAATC TGTGGATGTATCATGTATTTTATGCTTTCATGAATGCCTTTGATTTTTAAACACTTCGCATGTTTACTCTTTACACTGATTGTTGTTGATAAGTATATAA GATTTTCATGTGGAAGTTGATCATCTTCTTATTTGACTTGTACATGAAATGTTTCTTGAACCATGTCTGTTTCTTATAGAAGACCATTACCATATTATCA TCACCTGTGGATAGGGAACATATTAAAAATGAAAAGGAATCTGTAACCATGAAGCACCTTTGAAAAATGGAAAAAGGAGACTTTTTCTTGCTTGAAAAAA TTAATGCTATGAAAGCATTAATCGGAACTCTGAAGAATAGGAATAATAAATAGATTATCCATTTTCACTTGTGGTGAAGAAATTTTGCTTTCCTCATTGG CAGTTCTTCTATAAAGAAAGCAATTTTCCTTAAAACTCTGTTTTACGTGATTATTTATCTAAGAGAACAACAATCACTTGGGCAATGTCTTTTCTTGATC AATGAAGTAGGGAACTAAAATTGATCTCATACTCTAATAATTCTAATAAATATATTAATGGTTTGCTTGTCGGTATTAGGAAGATCTGGTGAAGAAAGTG GAACATTTGGTTTAATAATTTAAATGCATATAAAGGCAGATTTGGGTATCCAGACAGAACAAGATCTTTATCTATTGCTTTAAACTTAATTTTGTAGGAT CAGGATGAGAATTCATTGTTGTGCGATTATTTAATATACTGTCGGTCACCTCTTTTGTTTTGTTTTTGTTTTTCTGGTGAGGGGCTTGATGGCTAGTGTT CCTTTTTTTAATTCATGTGCTAATCGTTTTAAATTTATGCAATCAGGCACTGGACACTTTTAATACAGCAGTGGTGTCTCCTATATATTACACTATGTTC ACCACACTAACCATCTTGGCTAGTGTCATCATGTTTAAGGTAAACTTTCTTTCTTAACAGCTATTACTGGACATCACTTCATTGCTATACCCTTTACAGT TCTTTAAATTGTTAAAATAATCAGGATTGAGTACCTGTTGTATAATCTGCATGTTCTGATTTTATCTGCTCATCAAGTTTCCCTTTGTTAGTGGGTTCAA CATAGAGATCATATGTAATGATCTGCTTATGAAACAAATGACTGCCTGCTGTGAGCTTTGTGACTCATGCATCTAGAAGATGTGAAAATTGTGTGCAAAC TTGCATTTAAATGGCTGTGAAAATTATTCTGCCTTATCCTTGCGCAAATCCTCCGGTGCAAAATAAGAACTGAGAGAAATTTAGAACTGTCTTCGTTTCA TCACATTTTGACTTGCAAATGCATTTAGTGTAATTTTTTGTAGACATTCAATATCTGGCCATATGCTATTTTTGAATATTGTTTGTTTTTTATTTTGGAA ATTGATATTATCAGGACTGGGATAGGCAAAGTCCAACACAAGTTATCACAGAAATATGTGGCTTTGTGACAATACTTTCAGGAACTTTTCTTCTTCACAA AACTAAGGATATGACTGATGGTCATGGTATGCAATCATCTTTATCTTCTGTTAGACTTGCTAAGCATTCAGAAGAGGATGGACAGGATGATGTTGAAGGC ATCCCTCTTACTCTAAGACGGCAAGAATCAATGAGAGATTCGTGATATATTATTTTCGTCTGAGTCACTCTTTTGCATAACTTACAAGCTTTGATGCGCT GGGGAGGGACTTTTCCAAGGTCATGGTGCAATTTATTGAGTAGTGATTGCCTCCCCGTCATATTTTTCTGTGATACAGTTGGAGTGGAAGGATGAGATTT TTGGTGTCGTTGTTCTTCATGGCCTCTTCATGATTATGCTTTCCGATCTTTCCTTGTATACCTTTCACACTCCATACAGAAGACAAAGGCCAATGTAATT TTCTGCACACTGATTCTATATAGTGTACCTCAGTTAAATGATAGTATTCTGCATATATTTTTGAATTGGACTGTATTGCTATGTTATTATCACTGTCTGC CATTTGATTATTAAGGTCAAATGAATTGCTTAATGCATGCCTTTGGTGACCTTTTTAATAACTAAACACCTCATAACCATGCAACCTTGACCTCTTGCTT CTTCATCGTTCCTTGCTCTCTTTTTCTTTGCAATTAAAAAAATGAAGAGAACTTGATTGCCA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_179846;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_377223

FPKM

• PAB: 0.8
• PNAB: 0.8
• PS1: 1.6
• PS2: 1.6
• PS3: 1.9
• PW1: 0.8
• PW2: 1.1
• PW3: 1.4

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_377223

• Blastp: -
• Blastx: Probable magnesium transporter NIPA3 from Arabidopsis with 58.44% of identity
• Eggnog: NIPA-like domain containing(ENOG410XNR8)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G34470)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019418466.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;