Ll_transcript_515163

• Id Trinity: TRINITY_DN50819_c2_g1_i13
• Name Transcript: Ll_transcript_515163
• Sequence: TAAAAGTTATGTGATTTGTCGGATTCAACTATTCAACTCATAAGTTAAGTTCAACACGTTTCCTTCCAAACTATAGACAGCTCAACTTGATCAAAGCAAT ATTTGACTACTCATTTAATAACAGGTACTACTCTGCTAACAGAGTCTTGGATCCACACAAATATCACAAATCTAATGGCTCGTTGATGTGAAGAAAACAT TTTACTGGCTATATTTAATTGAAGTAATATTCATTTCCACCTCTAACTTCTGACCCCACTCACCCTCTTTCTATCTTCATCCATTAATACACACAGAAGT TAAAAAAGCCAAACTTTCCTTCTCTCATTATCTACAACACAACACCATTTTCTTCTCTTCTCTACTCTCTCCTTACCCATTTCCACTCATAGCATGTTTG CCCACGGTCACAACAAAGTTCAAATCTTTCATTCACACACACTCATCTCTGAGTTTTTCACCTCTTAGGGTCACTCATTGAAGTTCTGATTGTAAACAAG AACAGAAGGAAATGGGAAGCCAATGGAGAAAAGTGAAGCTTGCACTTGGGTTCAATACTTGTGTTCACATTCCTAGAGATTTTGATGATTCTTCCTCATC CCTCAACTCTGCCCCAGAAAGGTTTTCCGGCAGTATCTCATCCTCCGATGTTGTCACGCCGGCCGGTGACCGCCGAAGCACTTCTAGACCATCCTCCTCC GGTCTCCGGTTACCCAAATCAGGACCCAAATCCCCTAAGGTCAGCAATTAGCAATACCCAAAAAACTTTCTCATGTGTTGAAGTTAAAAAGATTCAATCT TTATCTTTTTTTTTATGGCTTCACCACTGAATCTCCATGGTAGATTCCGATTAAAAGTTTTTCACCATTTTGGTTGAAGTCACTTTCATTGTCTCAGCTT TTTTATTTTGGTATCAATGCTTTAAGCTTAATTATTGTTGTCAATTAGTGGGCATCAACTTAAGGTTTTAATGAGTTGTTAATTTTGTTGCTTTTGTTTT CGTCTCTCAATTGAGGTTATTGTGGAGTGTGACGTGTTCTGACCATAGAGGAAGAAACACTTTATTCGTTGATGTGTTTTCAACTCAATTATTATAGGTG GGGAAAGGGTAATGAAAGTGGGTGTCCTGTGCATACTCTTTATGGACCAGTTGTTTGGTCTCATTCATTAGAGAGTGTGAGATGATTTGCATTTTAGACC CTTCAATTTAGTGGATCTTATCCCCACAAAACATCCCTTACTCGTTGACTGTGAAATTCCCAGTTGCAAACAAAAAAAAAGTTGGAATCATGTGGGGTAA CAGTTTAATTTTGATGCACTGAACTTTTACACAATCAATCACTATTCACTAGTTATTACAAGGGTTAATCATTTTTATTGAATAGTGTATTTTTTTATTT ACTATTACTGCCAATTAAACCCTTATATTTTGCTTGAAAACTTTAAGTTATTGCTAGAAATTGTCCCAATCACTGATTGAAATGATATTTTCAGTCAAAT CTAAATTGTTGAATGAATCATCTTAGATCTCTCACTTCGATTTTGATGGCATTTTTATTTTATTAGTTAATTAGTTAGTATAAGATTGAATGTTTGGAGT TGAAAATTCGTCCTAGTACTTTTTTAACATCGTTTTCTGATTATTGTTACTTAATTGACCTTTTTTTTCCGGTAGTATAAAGTTGTAGATTTGATTTCCC TAGAATGGAGGCATCTAAGTAAGATAGGTTGCGTTCTATTTCATCTTTTTATGCAATGGCCTTAGTAGTGGACCTGCAATCAGGACAGAAACATGTGAAC AATCTTAGACACTAGTATGTAATAGTGAACTTTGCAAATGTTACATTTTTCTATGAATACTTTATTGAGGCACCTTTCAGATTTGCCATTTCATTGAACT TATGTATTTAAATTATCTGATTAAAAGATAATTTACTGGTAGACAATTTATGTATCTCCCCATACATCAAGACATATGTGGCCACTACTTCCATTACTGA ATTTATGTTCACTTAATGGTTTTTATTATTTTATTATATTAATAAAACCTCCAATCCTTAAATAGTCACTGAACTGTGGGATTTGATTTGAATTTATTTA GGAGTTCTGACTTAGGACCAAGTACTGCTACCAGTTAGGTTACTTTTTAATCACAGTCTAATTTCAAGTCTAGGCTTTTGAACTTGAAAATTAATCTGAA ATAATAGTTGAAGTATTAATATGTTAGTGTTGGAAGGGGTAGGGGTATAATTTTCATTCCTGACAAAGATTATAGATAGTTGGAAAAGGTTGAAGATGTT TGTATTTTCATCCTAGAGTTCTTCAAAAGCTGAAAGATTCAGGAAATATAGTTTGAAGACTTTGGTTGGTCTTTAATGGTCTGATTCTGATACACTTTCT CGGATTGTTAACTGTTGATACAAGGCGTCTTATTTAAAAATATGTTTCTGATTGGTGCATCCATTGCCATCCTTTGTTGATCAGAAAAAGGTAATAGATG TTGCCTAAAACTTGGAAAAAATATTATTGGGCATTCTACAAAGTATTAGGTTACCAACACCCGGAATAACATTTTTAGCTAGAGCAGTAGTTTTTATCCT ATCCCATTTATGAGTTTACTGATAGATAATACCTAGTAGTTTAGATTTTTGTTTGGCCTTCAACATGTGAAATTTTAACCGTATCATCGTTTTGAATCTT TTCAGTCTTTTTGACTGGTGAAAATTCCAGGGATTACCTGGCAGAGGCCCTCTAGCCTCTTTGATTTCAGTCTTTAAACAAAAGTTGCATTGAGCAGATA TCAAACTAAAGTGTTGATATACGACAGTAAGCAGTTTATACTGTATTTCAAATTTGAACCTCTATTGTCTGAAATTATTTCTCCCATGTGTAAACGTTGG TTCTTCTTAGTCCATGTTGGTACCTAATTTAGCAACCAAGTCTTGATAGATATGTCATATGTCAAATGTGGGTAAATGTTTCACCGTTTCACTTTGTTAG GTGTCTTTATAAATATCTTTCACATGGTTCTTTTGTCTCTTTAATCCTTTGTTTGATATTATGAATATGTCGAGTTTGTTTTATGCGGGTTTGAACCCTT GTGCCATACTTTATATCCCACAGCTCTACCAACTGAGCTGACTCTTCGGGACCAATAGGGCCTTCCTTTCCTTCAGATGTTTACTGCAGTAGACTTAACT CCTGAAAGCCATATTAGCACCTATAAAGCCTTCTTTTGCTGACATTTTTAACCACATTATGCAGGGGACTTGTGCAATATGCCTGAACATCATGAAACCA GGGCAGGGTCATGCCATTTTCATTGCAGAATGTTCTCACTCTTTCCATTTCTACTGTATCACTTCTAATGTAAAACACGGGAACCAGAATTGCCCTGTCT GCAGAGCAAAATGGAAAGAAGTTCCTTTTCACAGTCCCGCTTTTAATGTCCCCCATAACATGGCTCGAATCAACCCACTAACTCCTCGTGATGATGACTG GACAACTCTCTTAAGAATTCCTTCTCAACAACTCGATGCAGGTCGGCCGAGTTCATCACTTAATCATGCTCCTGAGCCAGCAATCTTTGATGATGATGAA GCCCTGGATCAACAAAATTCAAATACCCACAATAAAAATGAGGATGATCACGATATAGTAAGTACATTGGAGATCAAAACATATCCTGAAGTTTCAGCTG TTCCAAAGTCAGCCTCACGTGATAATTTTGCTGTATTAATCCATCTCAAAGCTCCTCCTTCAGGAAGAAACCAAAATAAGGGCGGAAACAATGCAGAAGA ACCTCCTTCGGATAAAAAATCTCATGCTGCAATTGATCTAGTTACAGTTCTCGATGTAAGTGGTAGCATGGGAGGTACTAAGCTTGCGCTTTTAAAGCGA GCAATGGGCTTTGTCATACAGAATCTCGGTCCATCAGACAGACTGTCTGTCATTGCCTTCTCCTCAACAGCGCACCGCATCTTTCCTCTTCGGCTAATGA CTGATACTGGACGGCAGCAGGCATTGCAAGCTGTCAATTCATTGATTGCCAACGGTGGTACAAACATTGCCGAAGGCTTGAGGAAAGGCGCCAAGGTATT TGTTGATCGCAGGTGGAAGAACCCAGTTAGCAGCATCATATTGCTATCTGATGGAAAGGATACATACTCAGTCAGTAGAGGTCCAAATGTTGAAACAAAT TACCAGTTACTTGTCCCGGACTCAATTCATCGCAATAATAGCACAGGCTTGCATATACCTGTGCATGCATTTGGCTTTGGCTCTGACCATGATGCTGCTT TAATGCATTCAATCTCTGAGATATCTGGTGGTACATTTTCTTTCATTGAAGCTGAGGATGTGATTCAGGATGCATTTGCACAATGTATTGGGGGACTCTT GAGTGTGGTGGTGCAAGAATTACAGGTCAAAGTTGAGTGTGTTCACCCTAGTCTGCAACTTAGTTCAGTAAAAGCTGGAAGTTACCAAACAAGCTTGACG GACAATTCTAGAATGGCTTCTATTAATGTTGGAGATCTGTATGCTGAAGAAGAAAGAGACTTTTTGGTGACAGTCAATGTTCCAGTTGATGGTTCAAGTA GTGAGATGTCATTGTTGATTGTTCGAGCTCTTTATAGAGACCCCATAACAAAAGAAATGGTGGATTTGGAAGAAAACAGTGAAGTAAAAATTCAGCGTCC CGACAATGTAGGTACAGCAGAACTAGTTGTGTCAATAGAAGTAGACAGACAGCGAAACAGGCTTCTTGCAGCTGAGGCAATGGCCGAGGCAAGAGTCGCA GCCGAGCGTCATGATTTATCTGCTGCAGTTTCTATCCTGGAGAATTGTCACAAGGCATTGTCTGAAACTGTTTCTGCCCGAGCCGGGGATAGCTTATGTC TTGCTCTTTCTGTTGAATTAGAG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_180235;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_515163

FPKM

• PAB: 0.3
• PNAB: 0.4
• PS1: 0.6
• PS2: 0.1
• PS3: 0.2
• PW1: 0.6
• PW2: 0.5
• PW3: 0.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_515163

• Blastp: Uncharacterized protein sll0103 from Synechocystis with 26.59% of identity
• Blastx: Uncharacterized protein sll0103 from Synechocystis with 26.59% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: Link to kegg annotations (sll0103)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019448747.1)
• Pfam: Anaphase-promoting complex subunit 11 RING-H2 finger (PF12861.6)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;