Ll_transcript_515129

• Id Trinity: TRINITY_DN50830_c2_g1_i17
• Name Transcript: Ll_transcript_515129
• Sequence: GTCACCAATAACATACAACCACGTCTCTTTGTATTATTCACACCACTGACTTTCTGTATATAAAAAGATGTAACACCAACACAGTTTTCCACCCTGTCCA AACCTTAGTTTTCACCCTATCAAGTTGAAGTAGAAACCATGTCTCTGCTTTCAGATCTCATCAACCTCAACCTCTCTGAAACCTGCACAGATAAGATCAT TGCTGAATACATATGGTGAGCTTTTTGGAAATCTTATTCCATCAAGTATACCTTATTAAAAAACAGGGGACTCTATTTCCTTAAAAACAGAGTACTCTTG TTTATTTTTGGTTATGAAAACCATTGACCAAAGTCCTACTACAAAAAACTAACCTTTTTTGGATATATTTATGTTTCTGATTCTGGGTATATTTTGTTGT GATTCATTCTTATGGGACTTGTCTTCCTTAGACATGTTGTTGGATTAAATACATAAGAAGTAGAGACCTTTTTCATTTTTATTAGGCTGAGTTCTAAAAA TCTGTTCTTGGGTTTTATCTATTTTGTAAAATAGTATTTGAAAAGTGAAAACCACTTAATGTTTTTTTATGTATTGATAAATAGGATTGGTGGATCTGGT TTGGATATCAGAAGCAAAGCCAGGGTAAAGTTTTTTTCTTCATCACATGTGATAAATAGTTATGTAAACTTTTTCATGTTACTATTTCAACAGTTTTTGA TGATTTGTCTATATGATTTTGAAACAGACTCTTACTGGACCAGTAAATGACCCTTCAAAACTTCCCAAGTGGAACTATGATGGATCTAGCACAGGTCAAG CTCCTGGTGAAGACAGTGAAGTTATCCTATAGTATGAATCTCAACTATTTATTTATCCTTTTTCTACTTATTAATTGCCTTTTGTTTTCATCTTGTTTTG GCATAAAACTGATGTATGGAATTTCTTTTTTTGTCTGGTATATTTATTTTTAAAATAGCCCACAAGCTATTTTCAAGGACCCATTTAGAAGAGGCAACAA CATTCTTGTAAGTATTTTCAACATAAACAATTTTATCATAATTACTGAACCAATTATTTTTATATGCATCAAAAGTTACAATTTTTAAGCCCCCTATTAA GTTTTGATGTAAAACTATAGGTTATTTGTGATGCTTATACTCCAGCTGGTGAACCAATTCCAACAAATAAGAGGCATAATGCTGCCAAAATTTTCAATCA ACCTGAAGTTATTGCTGAGGAACCATGGTGTGTATTTCATAATATCCAAAATTGTATTTTTAATGTTTTAAACCATTATGCTTCACAAATTCTTGAAACC CTTTTTAGGAATCACTATTTACATTATGATCTATACATCAAGTTCTTATAAAATGATTAAAAAAATGGATCTTGATTTATATTAACAGGTATGGTATTGA GCAAGAGTATACCTTATTGCAGAAAGATACAAATTGGCCACTTGGTTGGCCAATTGGTGGATACCCTGGACCACAGGTATTAATATTTTTCATTTTCATA ATATCTTCTCGATCATGTCAATCATACACATTTATTTTCACATATACACATTTTCACAATTTGATTATCATTTCAATTATGTCACATAAAAGAACTGTGT ATGGAATTTGATTGTTATATAGTTCAGCAACCTAAACATATTTGATCTTTGAAGTTTCAACAACAACTTCAATTTGGCATCATTTTCTACAAATTAGTTC AATGGTCGATTGCCTAAGATTTCGGTCCAATTAATAAAATATCTTTGAACATGGTATACCATTCTGTAACTGTCAAAATATGATAAAGTTTTAATACATT AACCCATACATTAACTCATAAACATGAACCATGTGCATATGTTTCTTTGGGTTATAGGAAATATATCAATTATAGCAGGAGTGTAAATTGATTACTTTAA AACGTTGATGTGCAAATATCAAAATTTATTGTCATTAATTACAATATTTGTTTACCTTAATAATTAAATTACTGTATCATTGAACAGGGCCCATACTACT GTGGAATTGGTGCTGATAAAGCCTATGGCCGTGAGATTGTAGATGCACATTACAAAGCTTGTATTTATGCTGGCATCAACATTAGTGGTATCAATGGAGA AGTTATGCCTGGCCAGTGGGAATTCCAAGTTGGTCCTTCTGTTGGTATCTCTGCTGGAGATGAAATATGGGCTGCTCGTTACCTACTAGAGAGGATTACT GAGATAGCTGGAGTAGTTGTTTCATTTGATCCTAAGCCTATTCCGGGTGATTGGAATGGTGCTGGTGCTCATACAAACTATAGCACCAAGTCCATGAGAA ATGATGGAGGTTATAAGATTATAGAGAAGGCTATTGAAAAGCTTGGGTTGAAACACAAGGAGCATATTGCTGCTTATGGAGAAGGCAATGAGAGGCGCCT CACCGGTAAACATGAAACAGCAAGTATCGAAAAATTCTCTTGGGGTGTTGCAAACCGTGGTGCCTCAGTTAGAGTTGGAAGAGACACAGAGAAAGAAGGG AAAGGTTACTTTGAGGATAGAAGGCCAGCTTCTAATATGGATCCTTATGTGGTTACTTCCTTGATTGCTGAAACTACCATCCTTTGGAAACCATGAAACT CTTCAGATTTAAACCACCATATGTTTTGTGTTTCAACACATTTAGTATAATTCATATCTTTAAGGTGGTTTTTCAATGGTTATTGTATTGTGTTCTTTTT AGCAAAAGCATTTGAACCTTGTATGATGTGTTTGGATTATAATAAAGTTATCATTAATAAAAAAAAGTGCTTTTTTACTCCACTCAAA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_180316;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_515129

FPKM

• PAB: 0.3
• PNAB: 0.2
• PS1: 0.1
• PS2: 0
• PS3: 0.1
• PW1: 0.1
• PW2: 0.3
• PW3: 0.6

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_515129

• Blastp: Glutamine synthetase nodule isozyme from Medicago with 92.02% of identity
• Blastx: Glutamine synthetase nodule isozyme from Medicago with 92.61% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0002361)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019436730.1)
• Pfam: Glutamine synthetase, catalytic domain (PF00120.23)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;