Id Trinity | TRINITY_DN50903_c0_g2_i12 |
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Name Transcript | Ll_transcript_386775 |
Sequence | CCCCCACTAGTGGATCGGTTTGGTGTGGGTATTCCTATTGGACCTGGACCCTTGGGCCTAAGGCCAGGATTTTTTCCTGAAGAAAATTCTCCGAAAAGAG GCACAGATACAACTCGTGACGATGACTGGAAGTGTCCAAAATGTGGCAATATCAACTTCTCATTCAGAAATGTTTGCAACATGAGAAAGTGCAACACCCC AAAGCCTGTATCCCAGGTTTGGTGCCTTCATATATTTTGATCATATTGACTATCATTTATATTCAACATTGTTTGATTTGAATTTTCAGCTGCAGGTCTC AAAATCTGACAAAAATTCCAAGCAAAAGATGCCTGAGGGAAGCTGGAAGTGTGAGAAATGTAATAATGTAAACTATCCATTCAGAACCAAGTGCAACAGA CAGAACTGTGGTGCAGAAAAGCCAGCTTTGTCAAGTAAATCTCCATCACCAGCCTCAGATCAAAATGACCAGGTTTGTTGGTAAAATTATTTTCATTTCA ATAGCCTTTGTTATTTGTTGCAACTTTTTATTGATTTTTTGGCTCTGTATACATAATTTACGTCATAAAGTGCCAGCTTGTTGCAAAGCTGTTTAAGTGG ATTCATTGGAAAGACATTGCTTTTGCTTCATTCCATCTTGAATCCATATACTATTCGCAGCTATATGATTTTAGGTTCTTTCATGTTTGTCCATTCCATC ATTTAATTTGCAACTATTTACTTTTCCAGTGAGTAATAGGACAGGTTTGAGGGTTGAGAAGGTCGAGATTTGTCATCCAACATTGCTCAATTTGGATGTC TGACTGTTGTTCATGTCGTCCTCTATGTTGCTGCAGTTGTCAAGTCACTCACTTTCTCATTATCTGTGTCATGTTGTAGTAACTGAGATGGTATTTGGTC TCTGAATCTTTCTCATTATCCGTGTCATGTTGTAGTAACTGAGATGGTATTTGGTCTCTTTGAATCTATGTTGCATGTGTCTGCCATCTTGCCCTGGCAA AGATTTTACAGACTGGTTGTGGTATTTCATTGATAGCTACCTATGCTCTCAGAATCAACTCACTGCTCTAGTTGTTATGTATCATGTCTTTAGTTGAGGT ACCACTGGCTAGAAAGGTTATTGCAGGTTCCTGTTTAGTTCTCTTTTGGTTCGATGGAACTATGGATGAATCAACATCATATAAAATAGATGAATTTGGT TTTTTCTTTTTAGCGATAACATGGTAATTGTTCAGCGCACCCTTTCACAAAAACCTACAGCTACAGGTCCTCCATCCTATCTTGCCTGCCTTAACTATCT AGTTAAGTATCTTTAGATGATTAGATGACTCTAGCATATGAACATTTCATGTTCTTAATAATTTTGGTTCTCATATTTCAAGTTCTTAACCATCTTCTAA GTCGCATTCAAAGACCATATTCTTTCGTGATGTTGAGGGTGAGTCTCGGCGCAACAATAAAGTTAATGTTCAGTGACCAAGAGGTCATGAAGTCAAATCC TAGAAACAACATTGTCGCTTGCTAGAGTAAGGTTGCATATATCTATCCCCATATTCCACTTGGTGGGAGCCTTGTGTACTAGCCTGCTTATGTGAAGTAC AGATTATTTATGGTTGATCAAAGATTTCTTTGATAATTTAATTCAGAACCACTGATAAAATTAGTAGCTGGAAGCATTTGTTAGAGCCTGCACTGCTTGT TGCTTTAAAAGTAAAGTTGCATTCTCATGCTTGTGGACCATCATTATCATTACCAAATACCAATACTAATGACAGTTTCTGAAATCTTAAACATATTTCA GTTTTATTTTTTTTAAATTTCATCAACTTAAATTATCTATAACTCAATTTTAAACCTTTTTCAAACTAATCAAATATTTAATTTTAGTGTTTTTAAAAGG AGAGGTTAACCAGTACTCATGGTTAAGGATTCAAAAGTAGGAAGGTTTGTGTTGAAAATGTTGAATTCAATATATTAAACAATTTCTATTTTTAGATTAG GCACCAATTATTGATATAAATAGTTTTCTCGATTAATTGACTTATTTCTTATTCAAAAAATGATGTGCAAAACCAAATTCTCCTAAAATTGTTTCGTTCT AATTATCTCATGGTTGTATTTTGATGTAAATATAGATTCCATGATAGTCTACTTTGAGAGATCCCATTATTTGCTAAGCAACTAATTCTTTTGAGGTTGA AATTAATTAATGATAGAAAAGCTGGTTTACCGACTAGTTTAGTTTGTGAGGAGAGATTAAGTTACTTCAAGAGTAAGTTTAAAAAACTTAATCCTCATCT TAACTATCAATTAATTGGAAATCCAATGGTTTGAATTTGTGATAAATCTAAACCATTGAATTTCTAATGAATTGGTAGTTAAGATGAGGAGTAAGTCTAA ACTTGATCTCTCTTGTGCCCGCAAATCAAAAGTGCGTGTGAACACTACCACTTACCATTTATTGGCAAATTTTCATGTGTGGGGAAATGGGCCGGTCAAA TCAGACAGGCAAACTAAACTTATATGTCTTACTAAAAAAACAAGCTTAGAACATGGTTGAAGCAATGTTATAAAACAATACCTGTCTTCAAATTGATCAC TGTATTGATAGAATAGTATAACAGTTCGATCGATGGTTCATTAATTAAACAATATATATAGGTAAAGTTAGATATACATATATAATATAGAAACATCAAT GTTAAAAAATTAATAAAGAATATAATAACTATTTTTGTTTATGTTATTTGTTAGTAAAATGTATTACTTGATGGTTGGGAGGAGTGTAAGCGGTTCTGGT TTAAACCGCGAAACCACTGGAACTAAATCACAAAATATGGTTTGGTTCAGTTCTGCAATTCGGTTTATTTATTTTTTTTAAGGAACTATTTATGGTTTTG GAAATTTAAGAACCATTAGAATCGAATTGTACATTAAAGAAATAGATACTAGAAATAATGTTTTATTATTGTTTAAATTTTTTAACTAGTTTTGTGTCTT AAATTATCGATTTTGGGTGAATTGTGGTGTTATATATGTTTAAATTATTATTATGTTTATATTATATATGTTATTAGTTACTAAATTGTTTCTTATTATC TTGATGATTTGGAATATAACTTCCAGCTTTTGTGGTATTGAGTTTAAAACTAACATAAATTGTAAGTTTATATATGCAATTAGTATATATTTTACTAGTT GATATACATGTTATTAATTAATCGTATTGTTATATATGTTAC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_180885; |
Additional information | - |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_386775
Blastp | - |
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Blastx | RanBP2-type zinc finger protein At1g67325 from Arabidopsis with 73.91% of identity |
Eggnog | Zinc finger, RAN-binding domain containing 2(ENOG4111QXA) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT1G67325) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019464618.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |