Ll_transcript_386736

• Id Trinity: TRINITY_DN50903_c0_g2_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_386736
• Sequence: CCCCCACTAGTGGATCGGTTTGGTGTGGGTATTCCTATTGGACCTGGACCCTTGGGCCTAAGGCCAGGATTTTTTCCTGAAGAAAATTCTCCGAAAAGAG GCACAGATACAACTCGTGACGATGACTGGAAGTGTCCAAAATGTGGCAATATCAACTTCTCATTCAGAAATGTTTGCAACATGAGAAAGTGCAACACCCC AAAGCCTGTATCCCAGGTTTGGTGCCTTCATATATTTTGATCATATTGACTATCATTTATATTCAACATTGTTTGATTTGAATTTTCAGCTGCAGGTCTC AAAATCTGACAAAAATTCCAAGCAAAAGATGCCTGAGGGAAGCTGGAAGTGTGAGAAATGTAATAATGTAAACTATCCATTCAGAACCAAGTGCAACAGA CAGAACTGTGGTGCAGAAAAGCCAGCTTTGTCAAGTAAATCTCCATCACCAGCCTCAGATCAAAATGACCAGTGAGTAATAGGACAGGTTTGAGGGTTGA GAAGGTCGAGATTTGTCATCCAACATTGCTCAATTTGGATGTCTGACTGTTGTTCATGTCGTCCTCTATGTTGCTGCAGTTGTCAAGTCACTCACTTTCT CATTATCTGTGTCATGTTGTAGTAACTGAGATGGTATTTGGTCTCTGAATCTTTCTCATTATCCGTGTCATGTTGTAGTAACTGAGATGGTATTTGGTCT CTTTGAATCTATGTTGCATGTGTCTGCCATCTTGCCCTGGCAAAGATTTTACAGACTGGTTGTGGTATTTCATTGATAGCTACCTATGCTCTCAGAATCA ACTCACTGCTCTAGTTGTTATGTATCATGTCTTTAGTTGAGGTACCACTGGCTAGAAAGGTTATTGCAGGTTCCTGTTTAGTTCTCTTTTGGTTCGATGG AACTATGGATGAATCAACATCATATAAAATAGATGAATTTGGTTTTTTCTTTTTAGCGATAACATGGTAATTGTTCAGCGCACCCTTTCACAAAAACCTA CAGCTACAGGTCCTCCATCCTATCTTGCCTGCCTTAACTATCTAGTTAAGTATCTTTAGATGATTAGATGACTCTAGCATATGAACATTTCATGTTCTTA ATAATTTTGGTTCTCATATTTCAAGTTCTTAACCATCTTCTAAGTCGCATTCAAAGACCATATTCTTTCGTGATGTTGAGGGTGAGTCTCGGCGCAACAA TAAAGTTAATGTTCAGTGACCAAGAGGTCATGAAGTCAAATCCTAGAAACAACATTGTCGCTTGCTAGAGTAAGGTTGCATATATCTATCCCCATATTCC ACTTGGTGGGAGCCTTGTGTACTAGCCTGCTTATGTGAAGTACAGATTATTTATGGTTGATCAAAGATTTCTTTGATAATTTAATTCAGAACCACTGATA AAATTAGTAGCTGGAAGCATTTGTTAGAGCCTGCACTGCTTGTTGCTTTAAAAGTAAAGTTGCATTCTCATGCTTGTGGACCATCATTATCATTACCAAA TACCAATACTAATGACAGTTTCTGAAATCTTAAACATATTTCAGTTTTATTTTTTTTAAATTTCATCAACTTAAATTATCTATAACTCAATTTTAAACCT TTTTCAAACTAATCAAATATTTAATTTTAGTGTTTTTAAAAGGAGAGGTTAACCAGTACTCATGGTTAAGGATTCAAAAGTAGGAAGGTTTGTGTTGAAA ATGTTGAATTCAATATATTAAACAATTTCTATTTTTAGATTAGGCACCAATTATTGATATAAATAGTTTTCTCGATTAATTGACTTATTTCTTATTCAAA AAATGATGTGCAAAACCAAATTCTCCTAAAATTGTTTCGTTCTAATTATCTCATGGTTGTATTTTGATGTAAATATAGATTCCATGATAGTCTACTTTGA GAGATCCCATTATTTGCTAAGCAACTAATTCTTTTGAGGTTGAAATTAATTAATGATAGAAAAGCTGGTTTACCGACTAGTTTAGTTTGTGAGGAGAGAT TAAGTTACTTCAAGAGTAAGTTTAAAAAACTTAATCCTCATCTTAACTATCAATTAATTGGAAATCCAATGGTTTGAATTTGTGATAAATCTAAACCATT GAATTTCTAATGAATTGGTAGTTAAGATGAGGAGTAAGTCTAAACTTGATCTCTCTTGTGCCCGCAAATCAAAAGTGCGTGTGAACACTACCACTTACCA TTTATTGGCAAATTTTCATGTGTGGGGAAATGGGCCGGTCAAATCAGACAGGCAAACTAAACTTATATGTCTTACTAAAAAAACAAGCTTAGAACATGGT TGAAGCAATGTTATAAAACAATACCTGTCTTCAAATTGATCACTGTATTGATAGAATAGTATAACAGTTCGATCGATGGTTCATTAATTAAACAATATAT ATAGGTAAAGTTAGATATACATATATAATATAGAAACATCAATGTTAAAAAATTAATAAAGAATATAATAACTATTTTTGTTTATGTTATTTGTTAGTAA AATGTATTACTTGATGGTTGGGAGGAGTGTAAGCGGTTCTGGTTTAAACCGCGAAACCACTGGAACTAAATCACAAAATATGGTTTGGTTCAGTTCTGCA ATTCGGTTTATTTATTTTTTTTAAGGAACTATTTATGGTTTTGGAAATTTAAGAACCATTAGAATCGAATTGTACATTAAAGAAATAGATACTAGAAATA ATGTTTTATTATTGTTTAAATTTTTTAACTAGTTTTGTGTCTTAAATTATCGATTTTGGGTGAATTGTGGTGTTATATATGTTTAAATTATTATTATGTT TATATTATATATGTTATTAGTTACTAAATTGTTTCTTATTATCTTGATGATTTGGAATATAACTTCCAGCTTTTGTGGTATTGAGTTTAAAACTAACATA AATTGTAAGTTTATATATGCAATTAGTATATATTTTACTAGTTGATATACATGTTATTAATTAATCGTATTGTTATATATGTTAC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_180885;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_386736

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 0.6
• PS1: 0.3
• PS2: 0.1
• PS3: 0.7
• PW1: 0.5
• PW2: 0.3
• PW3: 0.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_386736

• Blastp: -
• Blastx: RanBP2-type zinc finger protein At1g67325 from Arabidopsis with 73.91% of identity
• Eggnog: Zinc finger, RAN-binding domain containing 2(ENOG4111QXA)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G67325)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019464618.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;