Ll_transcript_386758

• Id Trinity: TRINITY_DN50903_c0_g2_i8
• Name Transcript: Ll_transcript_386758
• Sequence: CCCCCACTAGTGGATCGGTTTGGTGTGGGTATTCCTATTGGACCTGGACCCTTGGGCCTAAGGCCAGGATTTTTTCCTGAAGAAAATTCTCCGAAAAGAG GCACAGATACAACTCGTGACGATGACTGGAAGTGTCCAAAATGTGGCAATATCAACTTCTCATTCAGAAATGTTTGCAACATGAGAAAGTGCAACACCCC AAAGCCTGTATCCCAGCTGCAGGTCTCAAAATCTGACAAAAATTCCAAGCAAAAGATGCCTGAGGGAAGCTGGAAGTGTGAGAAATGTAATAATGTAAAC TATCCATTCAGAACCAAGTGCAACAGACAGAACTGTGGTGCAGAAAAGCCAGCTTTGTCAAGTAAATCTCCATCACCAGCCTCAGATCAAAATGACCAGT GAGTAATAGGACAGGTTTGAGGGTTGAGAAGGTCGAGATTTGTCATCCAACATTGCTCAATTTGGATGTCTGACTGTTGTTCATGTCGTCCTCTATGTTG CTGCAGTTGTCAAGTCACTCACTTTCTCATTATCTGTGTCATGTTGTAGTAACTGAGATGGTATTTGGTCTCTGAATCTTTCTCATTATCCGTGTCATGT TGTAGTAACTGAGATGGTATTTGGTCTCTTTGAATCTATGTTGCATGTGTCTGCCATCTTGCCCTGGCAAAGATTTTACAGACTGGTTGTGGTATTTCAT TGATAGCTACCTATGCTCTCAGAATCAACTCACTGCTCTAGTTGTTATGTATCATGTCTTTAGTTGAGGTACCACTGGCTAGAAAGGTTATTGCAGGTTC CTGTTTAGTTCTCTTTTGGTTCGATGGAACTATGGATGAATCAACATCATATAAAATAGATGAATTTGGTTTTTTCTTTTTAGCGATAACATGGTAATTG TTCAGCGCACCCTTTCACAAAAACCTACAGCTACAGGTCCTCCATCCTATCTTGCCTGCCTTAACTATCTAGTTAAGTATCTTTAGATGATTAGATGACT CTAGCATATGAACATTTCATGTTCTTAATAATTTTGGTTCTCATATTTCAAGTTCTTAACCATCTTCTAAGTCGCATTCAAAGACCATATTCTTTCGTGA TGTTGAGGGTGAGTCTCGGCGCAACAATAAAGTTAATGTTCAGTGACCAAGAGGTCATGAAGTCAAATCCTAGAAACAACATTGTCGCTTGCTAGAGTAA GGTTGCATATATCTATCCCCATATTCCACTTGGTGGGAGCCTTGTGTACTAGCCTGCTTATGTGAAGTACAGATTATTTATGGTTGATCAAAGATTTCTT TGATAATTTAATTCAGAACCACTGATAAAATTAGTAGCTGGAAGCATTTGTTAGAGCCTGCACTGCTTGTTGCTTTAAAAGTAAAGTTGCATTCTCATGC TTGTGGACCATCATTATCATTACCAAATACCAATACTAATGACAGTTTCTGAAATCTTAAACATATTTCAGTTTTATTTTTTTTAAATTTCATCAACTTA AATTATCTATAACTCAATTTTAAACCTTTTTCAAACTAATCAAATATTTAATTTTAGTGTTTTTAAAAGGAGAGGTTAACCAGTACTCATGGTTAAGGAT TCAAAAGTAGGAAGGTTTGTGTTGAAAATGTTGAATTCAATATATTAAACAATTTCTATTTTTAGATTAGGCACCAATTATTGATATAAATAGTTTTCTC GATTAATTGACTTATTTCTTATTCAAAAAATGATGTGCAAAACCAAATTCTCCTAAAATTGTTTCGTTCTAATTATCTCATGGTTGTATTTTGATGTAAA TATAGATTCCATGATAGTCTACTTTGAGAGATCCCATTATTTGCTAAGCAACTAATTCTTTTGAGGTTGAAATTAATTAATGATAGAAAAGCTGGTTTAC CGACTAGTTTAGTTTGTGAGGAGAGATTAAGTTACTTCAAGAGTAAGTTTAAAAAACTTAATCCTCATCTTAACTATCAATTAATTGGAAATCCAATGGT TTGAATTTGTGATAAATCTAAACCATTGAATTTCTAATGAATTGGTAGTTAAGATGAGGAGTAAGTCTAAACTTGATCTCTCTTGTGCCCGCAAATCAAA AGTGCGTGTGAACACTACCACTTACCATTTATTGGCAAATTTTCATGTGTGGGGAAATGGGCCGGTCAAATCAGACAGGCAAACTAAACTTATATGTCTT ACTAAAAAAACAAGCTTAGAACATGGTTGAAGCAATGTTATAAAACAATACCTGTCTTCAAATTGATCACTGTATTGATAGAATAGTATAACAGTTCGAT CGATGGTTCATTAATTAAACAATATATATAGGTAAAGTTAGATATACATATATAATATAGAAACATCAATGTTAAAAAATTAATAAAGAATATAATAACT ATTTTTGTTTATGTTATTTGTTAGTAAAATGTATTACTTGATGGTTGGGAGGAGTGTAAGCGGTTCTGGTTTAAACCGCGAAACCACTGGAACTAAATCA CAAAATATGGTTTGGTTCAGTTCTGCAATTCGGTTTATTTATTTTTTTTAAGGAACTATTTATGGTTTTGGAAATTTAAGAACCATTAGAATCGAATTGT ACATTAAAGAAATAGATACTAGAAATAATGTTTTATTATTGTTTAAATTTTTTAACTAGTTTTGTGTCTTAAATTATCGATTTTGGGTGAATTGTGGTGT TATATATGTTTAAATTATTATTATGTTTATATTATATATGTTATTAGTTACTAAATTGTTTCTTATTATCTTGATGATTTGGAATATAACTTCCAGCTTT TGTGGTATTGAGTTTAAAACTAACATAAATTGTAAGTTTATATATGCAATTAGTATATATTTTACTAGTTGATATACATGTTATTAATTAATCGTATTGT TATATATGTTAC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_180885;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_386758

FPKM

• PAB: 3.9
• PNAB: 1.3
• PS1: 1.3
• PS2: 2.4
• PS3: 1.9
• PW1: 1.7
• PW2: 1.6
• PW3: 3

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_386758

• Blastp: RanBP2-type zinc finger protein At1g67325 from Arabidopsis with 63.5% of identity
• Blastx: RanBP2-type zinc finger protein At1g67325 from Arabidopsis with 71.91% of identity
• Eggnog: Zinc finger, RAN-binding domain containing 2(ENOG4111QXA)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G67325)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019464618.1)
• Pfam: Zn-finger in Ran binding protein and others (PF00641.17)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;