| Id Trinity | TRINITY_DN50911_c0_g1_i10 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_386401 |
| Sequence | TCACTCCGGTGATAACATTGAAGGTGGTGTTAATTTCTCTATTGATTGATTCTCCTTGATTATATGATCATTCTTCATTGTTTAACTGGTTCTGATCATC TTTTTATGATGTTTTTATTATAGTGTTCTGTTTGAGAATGTTGAATTGTTTTTTCCTTATAGATTTGTTAATTTATGATGGGTTTTCTATTTATGGCATG GGTTTTCCTTATTATAGAATTGTTTTTTATGATGTTCATACATTGTATTGTCAGACCTTTGAAGAATTTTGGAACCATGGCTTAACTTGTGTTAGTAAAA AAGGTTTAGAAAATTGTACCCAAAAAATGTTTACAAAATATCATATTCTCCTACAATTATTTTTTCTAGCCTAAAATTAAGTGCTATTTATGCTTGATCG CACATGGCTTGCAAAGTTTATGTACTTTGCTTGATGATGCAACAAAGGATTGCCTGCATGTGTTGATCTAAGTCTTTTAGCTGGCAATTATGTGCTTTAC GAGGTAAAGTTAGAAAGCTTTTTAAGTTTATGATTTTTATGGCACTATGATTGTGGTAATTTGAATTATGATTTACATATATATATTGTTTAGTTATATG TTGAGACTTTGGGTGGAGACATCTTTGGTTGCCTGATTGCTATTTGATCGGCATTGCAGAAGCCATTCAGCGTTTGAAAATCAATGATAATCGGGACAGA GATGGTGCAGCTCAATCTTCCCCATTCCCGGAACGACCTGGTGAACCTGACTGCTTATATTATTTGAGGACTGGAATGTGTGGTTATGGGAGTAACTGCC GCTACAATCACCCGACTAATGTTTTACCGGGTACTCATTATGGTGAAGAACTTCCTGAGAGAATTGGGCAACCTGATTGTGAGGTGTGAATCTTTTCGTA ATTAAAATGCATCTGTTTCTCTATGCCTTTCTTATGTTGAATGTTGCTCCATGATGTGAATGCTGTTCCCCATGCTTCCTTTCTAAAATTTGATCTGGTC TATTATTAAAAATTGTAGCCATAGTGATTACCAGTGTGTTATTAGCAAATTAATACATGAAGAATTAAATGAGCTAGGTATCTCATGAGATGGACGGAAA GTTAATGTTTATGCTGTGCACAGTAAAAGAGGAAATAGATAATTGGGTTTTAGTTTCATGTCTGTTATTCTAGAAATCTCGATTTCAGGAGCTGGAGTAT AATCTGAAAATGTTCATAATTTGTTTATGGAAGATATTATATAGTCCATTATTGTGATCGATTTCATTGCAATTCCAATGCATAAATACATTTTGGGGTT ATACGACCCACACAAGTGGTAATTTAATATCTGGTTTGGAGTACACATTGCAGTATTTTCTTAAGACAGGGACATGCAAATATGGCTCAACATGTAAATA TCATCATCCAAGGTATAGGCAAGGTGCTGCTCCTGTATCATTCAATTCTCTAGGCCTTCCTGTCCGTCAGGAAGAAAAACCATGTCCATATTACATGAGA ACTGGGTCTTGTAAGTTCGGAGTCGCATGCAAGTTTCATCATCCACAGATTGGAGCTTCCCTTGTGACTGGATCTCCTACCTCAACAATCCTTCCCACAT CGGGCTTACCATATGTTGGTGGTATTTCTGCATGGCAATTACCAAGAATGTCATATTTATCTGGGCAGGGCATTCAATCTTATGTGCCACCTTTTCTGTC TTCTCCACAAGGCATTATACCTGCACAGAACTGGAACACCTACATGGTTAGTTAAGGCTGTTGAATTTCCTATTTCGTATATGCATTTGCCGTATGCTAT ATTCTTTATTATTTTCTTCCATACAATGGTATCCTATCATTGACTATGATGCTGACTGGTTGATTTCTGAGCATAAATGATTTCGAGGGCTGTATAGGTG GGCTAATTGTTAGTGTTAAAAAAGAGGAGTTCATTACTGTATAACCTTCTTACTGAAATGTTACCACGTATGGAAGTTTCGGACAAATGTATGTAGCATA TATCTAGATAAGTAGACATTGCAAGATACTTTAAAGAAAGTGATTTGTGCATGAAATTCCTCTTATTCCTTACACCCCCGTCATTTATTTTTATTAATTG CCAAGCGCATTTGACATCCATACTTGCATACACTTCATGACATTCATACATTATGTTCGGATTTGCTTATTACATAGTGTCAATTGTACTTTATGTAAAT TAAATTAAGATTTTTTTTATTTGACCGGTTTTGTCTCTCATATTAGGGAAGTATGAGCTCTGCAATGCCTACCACTTTTCTTGGATCTAATTTTGTCTAT GACACCATGAATCTGGGTGAATCGCTTCTTGGTGGTCAGGTAATAAGTCCAACTCTCCCTGAGAGACCTGATCAACCAGAATGTAGATACTTTATGAGCA CTGGTACCTGCAAATATGGATCTGATTGCAAGTATCATCATCCAAAAGAAAGAATCGCTCAATCATTGATGAATCCACTTGGTCTTCCTGTCAGACCTGT AAGTTCAGTTTGTAGTTGATGCTTACTTGCAATGCGAACGATTTTATTCATATTATGATCACTAATATGTTACCAAGATATTAGCATTTTCCATATTGGC TATAATAAGGCTATGGTTACTTTGATTCCAATCTTGGTTATTTGCAGGGGCATGCTATATGTTCATACTATAGACTCTACGGAATATGCAAGTTTGGTCC AACATGCAAATTTGATCATCCAGTTTTGGCAATTCCTCAGAACTACGGCTTAACCTCACCCGCTTTTCCTGTTCTTGACACATCTCTGATTAGTAATCCA ATAGGTTTTTCAACTGTCCAACCATCCGAGACATCTCCATCCAATGACAAGGTTCAACACTCTCATACAAAAGCTACTGAAGATTCATCCAAACAAGCTG ATACTACTACACCAGATTCCTTCCCAACCACCTCACAGTCTTAATTTACATGACCTGCTCCAAGTTTGATATTTTTTGGGGGCACTTTTCCATATTTGAA GAACAAACATATCATACATACCTCCTGTTCCCCCTTTTCACCTGCATTTATGTAGAGTTGGATAATTTGTTGAGAGGTTGTTGTGGCAACCACTTGCTTG TAGGGGGGATTGGAGGCATTTTTTGTGGTGAATAAGATGCAGGTTGAAAGTTTGTACCTTTTTTTCTTTTCCTTTCTTTTGGGGTCAATTTGGTACACCC TTGAAATGGAGCACACAATTCAGGGATGTATGGAAAACTCAACTGAATATTTACCCCATTTTAAGGGGTATCAAATTGAATGTTGACCTTTTTCTTCTTG TTTAGAGATCCATATACTTTTGTGTATCTTGGTTTCTTTGGTTGGAGAAATTATGCCCAATTGAACATACAAGAGTTTTTTTAGAATGGTAACTACTATG TGGTGTTTGTAAGTGCAAAAAGGTGGAGGATTTGTCTGGAAAAGAATATGAAAAGTAAAATAAAGTAAAACAAGGAAAAACCATGAGCAATACTTAATCA AATGGTTTCATTATTCTGTGCACAACTGGTGAAAATGACATCAAGTATTAAACTTCCTTGG BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_180932; |
| Additional information | - |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_386401
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Zinc finger CCCH domain-containing protein 3 from Arabidopsis with 52.9% of identity |
| Eggnog | zinc finger(COG5063) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT1G04990) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019461679.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |