Ll_transcript_388890

• Id Trinity: TRINITY_DN50921_c5_g2_i3
• Name Transcript: Ll_transcript_388890
• Sequence: GTATGTCATGTGAAGGATGTGTTGGAGCAGTGAAGAGGGTTCTTGGAAAATTGGATGGTATGTTTGATCTCCCTTGAATTTAAGTTGCCATTATATTGTG TTTAACCTCACTTTAATTATAACTTCCTGGTGCAAACTTCCACTGCTATCAAATACCAATATGAAAGTGATTTAGTCATCTTGCACTATCCACTTTATAG TTTGTAGTTGCATGCTTTTGGTCAATTTTATCAATCAGGATATTTTGTTTGCTTGACATCCGAACTCACGAAAAAATGGTGAATGAGTGTCAGCTGGTTT TTAATTCTGAAGTTTCCTTTCTGAACTTTATTTCCTTCCCCTTCTTTCCTTTCTAATCTCGTTTAAAGCTGTGACTTATGGCCTTACATAACCTAAGTTA TTAGAACCCATTAACGTAAATTGTAATGTTTAAAAGCTCAAAATTCTTGTTAATGCTCTTCTCCCTTAAAATTCTTGTTAATGCTCTTCTCCCTTAAAAT TCTTTCTCTTTCCTGTTGGACTGTGATTGTATGATCATGTGAGTTTTATGTAAGTGATTAGTTCTTGAACATCATGAATGATATTCTTCATAGATTGTTA ATGTCCTCGTGCTAATGTGGTTATTATAATGTTATCTGAATTTGATGTGGTTTCTGCATAGAGTCATTGACAGTCTTCTTTAGATGATCCCTTACCATAA TTTATTCTATCTTTTGACCAGTAGGTTGCAGGCTTGATGTTTTGATCCCATTTTTCACTTTGTATCCATGAACTTGTCTTTGGGTATTACGTCTTTTTTT TGTATAACCAAGGGTATCCCCTCACTTTATGGGTAAGGAACTAATCCCTTTTGCGGTGCGTGGTTGCCCATCTCAACAAGTGTTGTTCCTAGAATCGAAT CTTTGACCTTTCAGTCTATCTGGGGATCTAGTTGGGCCTTACACCACTAGACCAACACCTTATTGGTTTGATATTATGCTTTAGTGCAACTTTGAAGTGA TTTTCTTCAACTTCTCTTCATAGCATGTCAATATGTATGTTCCTTTTCGTATCATTATTTCAAGTGTCAACATATATAATAACAATCCCTTCAATCATTT TGGAAACATGTTCTTAGTAATCAAAACCTTTCAATTTTAGTTCCAGGATCATGTGCCAATTAAATGTGTCTTAGGTTTGTTAGGTGTTGGAAATAACCTT GGTTGTACTTCTATTATAGTACTATGGACTGTAGTGATGCCAAGCATAACTTTGTTCATAGTCCATTTTTGGCTTTAGCATACATGAAAAATAAAAATTC TATCCTGTTCGTTTGCAAGTTAGGTTTTGAAGGGAAGAAAGGGAAATTGAAGACTTCATAGTCACTTTACAATTGTATTTCATGGCTCTGAAGACTTCTT TTTTGCTTTATTCCCTTCCAAAACCCAACTTACAAAGAGATCCTAACTCTACTCCAATTCTATCCCACCTTCTATTATCCCCTTAAACTGGTTTTCAGCT CGGACTATTGTACTTTGCTCTTGATTGCTCTCCACCCCCGGAGTAGTTTAAGGCTTCTCAACATTCTTTTGAATATGCTCATACTATCAGGTGTCTGATT CCTGGAATTGTGCGTGCCATTTAAGCAATTAAAGTGCATTGATGGATGATGTATTGCACAAAGCAAAGAGAATGTAATCTTTACATGTATAGTTTTGTTA TCCTCACTTTCATGAATCTACTCTTAACTTTGAGGGCGAGATTCAACACAATGGTAAGGTTGTTGCCTTTTGAACTAAAAGTCGAATGTTCAAATCCTGA CAACTGTCTCTCTGCTTAAGATTACGTACATTTATCATCCCTAAACCCGTACTATGTGGGAGCATCGTGTACTAGTTCTCCTTTATGTATATATGTATTT TTGATATCCGCTCTATATGTTTCATCGTTACTGGTTTCAAATTAGGGTTCTTGATGCCTAATCCAGTTAAGATTTGGCCTTGTTTGTTGATCACAGGTGA TGTTGTAATCCATATTTTTCTTCCCCCACAGAGAGCTTTCTACAATTTGGAAGAGTTTTACGCTAATGCGACACTGGTAGATCTGCCTTTTGAAAATCAA TCACCATTCCGTGGTTGACGTGACCTTTTATTCGTTGGTCAGTGAAATAGCTCAAAGATTATGCAGACAGTCATGGCCAGCTTAAAGAAGACCAATAATC ACTGCCGCATTCAATTCGGATATCAACACGAGACTGTGAGCTCTTTGATTATGACGGGAATGCAAGATCATTCAATGATGGAAAGGAAAAGAACAATTTC TATGTATTCGGAAGTATTTTTGTCTTCCTGTAGGTTAGATCATTAGAGAGGTAATTACTCTCACAGAACTGCAACAAATGGGGTTGAGAGTTTGTTTGAG TTATAATTATGTTCTGCAATTATGTGTGCATTTGTTTCCAACTGGTTTAATAATAGAGTTTAGGTGCAGTTTTTATAACAAAACTGTTGATTTAAAGTTT ACCAATAAAAAAACAACAGTGAGGAATAAATTTGCACTGCATGAATATGGATAATGGCCAAGCTCAATAAAGTTTTTAATATTTAAC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_181015;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_388890

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 0.1
• PS1: 0.1
• PS2: 0
• PS3: 0.2
• PW1: 0
• PW2: 0
• PW3: 0.1

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_388890

• Blastp: -
• Blastx: Protein Iojap, chloroplastic from Arabidopsis with 60.71% of identity
• Eggnog: Functions as a ribosomal silencing factor. Interacts with ribosomal protein L14 (rplN), blocking formation of intersubunit bridge B8. Prevents association of the 30S and 50S ribosomal subunits and the formation of functional ribosomes, thus repressing translation (By similarity)(COG0799)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G12930)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019425515.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;