Ll_transcript_388141

• Id Trinity: TRINITY_DN50946_c0_g1_i10
• Name Transcript: Ll_transcript_388141
• Sequence: CCCAGTTGATTTATCTTGTGTGACTGCAACCTCAGCATAACACTTTCTCTCTCTAAAATTTACAAGTGAAGGAGGCTGTGGCACCTTCCATTCCAGAAAG GGAGAGAGAGCTGTGTTTATAAGTGAATGCTGTAGACTTGTCACTTGTGTTCGGGGACGCTATTGCCAGTTGCATTAGTATAAGAAGCTAAATATCGTTG TCTATTTCAGAATGGGTGCTGCTTGTTGTGTTGCAGCCAAAGATAAAACTGTACAAGGTGGATCTACCCGTGAAATCTTACATCGTAATGTTCGTTGTTC TCCAACATGGAGCTTCCGGTGGGATCATCCAGGTCGTGTAGCTGGTGAAGATGCTTCTATAACTTGGGTTTCTGATGGTATTAGCAGGAACGATGGATCG GAAAATAAAAATGAATCATCATATGTATCAGAGGATGGAAGTCCATTGCAGAGTGATCAAAGGAATATATGCCAAAAATACCCGATTTCTGAAGAAAGTG TTGGACATGCAATAAATTCTACTTCAGGTAACTTTCATTGATTCAGCATTCTGGTTTTAACCATGTACCTACTTGGGTTGGAACTTTTTTATTTGGATTT TTTGTCATTCACTTCATTTCCCTGATATTTACCATCTGATATGAGACAAATGAGGAACCTAGTATTAAATAGAACAAAACCTAAGTAGTCAATCCCTAAT AGTAGTCCAGCTGACCCCAGATGGATGGAATCTATTAGGAGATGACCACGAATTCCACTCAGTTGTAGAAGAAGAATGCCGTGTCTTTGAGACATTGATT CCTTGTGCCACTAAGAAGGAGGATCCAGAACAGATGTGGTCTCTGCAATGAATTCGGCGAGGATGAAAGAAAAGAACGAAGCAGAAGAAGTTCGAAAAAA TAAATAGAGGAAGGAAAAACAAATTAACCAGTAGAAGGTCTGGGTGGAAGAGTAATAGTAATGGTTAAATAGAGATTTATTGAGTCTAAGTGAGGGTAAA GAAGACATTTAAAAATATTAAGAAGAGTCGCCGAGTTAAAGAGGGTAAAATAGAACATTGACAAGTGAGGGTGAATTTGTAAAAATAAAAGCAAGGAACA TGAAATGTGAAAATTAAAACCCTAATCCAATCGGGAAAGAAGACTGCTGCTGCCAGGAAGAATTAACCCCAACCACTATATGCTGTCACAGCCACTATAG GGTGTAACTCTCGCTGTGTGGGGAACCTATAATTGACATCGTTATTCCGCTATAGCATGCAATAGCACTGCTATTGACTACCTAGAGTGAAACATAATAA CAAGCCAATTTGAAAGATATAATATTATTCCTTCTGCTACATTAAATTTGGAAACATGATGTCTTCTCACATGTTTCTTTTTCTTTAGCTTTCAGAATTT AAACACAAGAAAAATTGAAAATTAGTGATAAATATGGTTAGAATTTGGAGTAATAATTCCATAAATGGAACAAATTAATTTTTATCACATTATCGCACTT ACCAATTCCAGAGATAATTAGATGATAATTTTGAATATGGTAGACAAACTCTAATCAAGCGGGCTTGTTTGTCCTAAACCTTTGGGATCACAATACAATT TTCTCTTGGAGATACTAAAATATTGAAAACACTGTTGTAAAGTATCTCTGCTTATGCTCCCAATCAAATAATAGTTGTGGCTCTTTATTTGTAATCCTTC TGTGGTTTAGAAAAATTAGACCATCAGGACATCAATATGTTTGATAAGTTTTCTACGTTCTTAGTTCTTACAGATATTTTATTCCCATTTCTTCTGGAAG CTCAACCAAACAATATAATTTTTCCCTCTATCCTGCATTCTGTCTTAAAATTGGTGAATCGGTAGAAAAGGCGGGATATATAGTACTTAGTAGAGCTTAG TTAGATATTATCATCCAAAAAGTTCAAGATTCTACAAGTGTTTTGATGTTCCTTACTTCCTGCATCTACTCTGTGCATATTGTAGCACGATGCACGTTAT TTGAACATGTAATGTTCTCCATTCTTAAATTAACAGTGCCCCGAATTTTCTAATTTCTCTATCAGTTGCACTGCACCCTATTGGTTTTCCATTGCTGTAT ACAAAGCAATAACTGCCCTTAGCCCTATGCCTCTTATCTTGAATATAAAACTCAACAGAATATTTCGTGAAAGTCTGTTTCAAGTCAAGTGGAATAGAAA GGTTTGCCTCTTTGTTTGAATAGATTATTGAATCTTTTTGTTGACTTTTGGCATTTGATATGGAGATAGTTGTATTTTTTAGTGTTGAATGGTTCATTGC GGTCCAGTATGTGGTTCTTTAAACATAAAAGAAAATCCTCTAAAACATGGTCATGGAAGTTTCGCTTATAAACACACAATCTTGGAGATGGTCTAGATGA GACTTTTTTGTGATAACTACAAGTTTAGGGTGACAAGAGGCTCTCCCCATTCAAAGCTCACCAACCTCAGGTATGATTTTACAGTGGCATTACAGATCGC TTAACAATGAGGATCCCTGGATGAAGACTTCAGTGTTGGTTGTTTTATAGATCTGCAAGTTGTGTACCTTGCATGAGGGCTAACCAATGACTATATATTG TGAAGCTAGATTCATATGAATTGTTTCTGCATAGGTGCATCCTGTGTGCCCATGCGTCACATTATCCTGCTGTTTGCAATATGTAAACTGATCCTGTTTT TGATGCCGTGGTAAATTATTATTCACTCAACTGCTTGATTTATAGTATCTCACATGTTTGTTTCAGATCAATCTATTTCTACTAATGTCTCAATGGATGT GAATGTGGAACAGGTGAGGTTATAATAGTGGAGGAATCTAGTCTTGTTTTATGTTTTTGCTAGTTCTTGATGTGTGATTTCTTTGACACGCTTCCTACTT ATTAATCTCTTTGAAGGTGAAGGGGATAGAAGAATCATCAACAGTATCGTGTCCATCGACAAAACTGTCATCCTCATTACCTTCTACTTCACTGTCGGCA TCTCCTTTGCCATCTCAAAGTCACCTAGCTCCCTCCAGCTCAACCCCATCAAGGTGGTCCTACCATTCCCCTGGAGACCAACTATTACGGCAAGTGTCTG ACAGCCAAGTCCCAGGATTCAAGTCACCAAAATGCTTCTATGTGACTGCAGAAAGGCCGGTGCTTCCTTCATGGAGCAACGAATCGGGTATGCGCTCTTG TGATGGATCTTCAGATGGTTGGTCTGTGCCTGGCTTATCTGAGCTGATGGGAACTTCCAATAAAGAAAGATGGTCTTTTGATAGTGAATCTTTTGGTTTT AATCGGGAAAGGTTACTTAGATCAAGTAGTCGGTTTTCAACATCTCCAGTTGATTTGCAAACATGTGGTGTTTGCTCAAAACTTTTAACTGAGAAGTCTT CTTGGAGCTCCCAAAAGATAATTGTTGCAAGTAATGACCTTGCTGTAGTTTCTGTTCTTATTTGTGGCCATGTCTATCATGCTGAATGTTTGGAGAGTAT GACACCTGAAATCAATAAGTATGATCCAGCTTGCCCAGTTTGCACTTTTGGTGAGAAACAAACTCTTAAGTTGTCCCAAAAAGCTCTGAAAGCTGAAATG GATTTAAAGACTAGAAACAAGAAATCAAAGAACCGAATTGTGGACAGTGAAATTGGTGATGATTTTGTGTTTGATCATTTTAAAGATGGAAGCCATCAAG GTAAAGGTCCTAGGATGGGATCTAGTTCTAGTGGGAGAAGCTCCTTTGGAAAACCTTTTCTGAGGAGACACTTCTCATTTGGCTCAAAGAGTTCCAAATC CATGTTAGATAGTCACCCTACAAGAAAGAAGGGATTCTTTTGGGCAAAATCTAGCAAGCAATAATCTGCTTCTTAGTTGTTTGGAGGTTCTATTATCTGC TCTGCAACCTAAGATAAACAACTGAAGAAAGAGCAAAATGTGATTCATTCATCAAGCTTAGACTTTTTAGCATCTGCATACACTAAACCTTGATTTCAAC AGGACTAGAAGCTGAAATTACTCTGTAAAGATGAAAAGTGGAAAGCATACAGAAGGATATGAAGAAGACAAACATAGTGTTTGAATAACAAGGGTCTTTT TATGTTGTACAGATCAATTTGTTTATTGAATGGATTTAATTCATGTACCCAGATGATGTTCTGTTGTCTATGGTTCTGCTGATATGTATTGAGTACATGC CATTAGCCCTTAGGATTTCTTGGTGTTTGGGCAATGGTCTTCACAAATTATTAGGCAATACCAATTATTTTGGTTGACTTCACTTGCATTTAGCCAAAGA ATAGTTTCAATTCAGAAGAACCTTATGTCAAATAAATGACTTTGTTGGTAGAAGATTGAATTATGCTTTTTCATGCATGGATTGTAGGAGTTGAGGGTTT AGTTTGTTGTTTGCTGACTATATGTTCCTTCAATTTTTCATTACTTATGTATTACTATTATGGTCCAATGATATCAGTTGATATTTTCTGCTAATTATTG GCGACAAAAAGGAATACATTATTGACTCAGAAAAG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_181219;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_388141

FPKM

• PAB: 7.6
• PNAB: 3.8
• PS1: 3.5
• PS2: 3.5
• PS3: 4.9
• PW1: 3.3
• PW2: 5.1
• PW3: 6.8

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_388141

• Blastp: -
• Blastx: -
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019449398.1)
• Pfam: RING-type zinc-finger (PF13445.5)
• Rfam: -
• GO: -