| Id Trinity | TRINITY_DN50946_c0_g1_i20 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_388151 |
| Sequence | TTTTGTTTTTCTATATTTGGTTGCTTCCTTCGATCATATCCATCACCCTTTTTTATTTTTATTTTAAATAATTCTTTTGCTGCTTTTTGTTCCATTTATT AGGTTCATGTTGTTATTTTTGTTCTTCAGTTTTCTTTGATTTGAGGGAGAGAGAGCTGTGTTTATAAGTGAATGCTGTAGACTTGTCACTTGTGTTCGGG GACGCTATTGCCAGTTGCATTAGTATAAGAAGCTAAATATCGTTGTCTATTTCAGAATGGGTGCTGCTTGTTGTGTTGCAGCCAAAGATAAAACTGTACA AGGTGGATCTACCCGTGAAATCTTACATCGTAATGTTCGTTGTTCTCCAACATGGAGCTTCCGGTGGGATCATCCAGGTCGTGTAGCTGGTGAAGATGCT TCTATAACTTGGGTTTCTGATGGTATTAGCAGGAACGATGGATCGGAAAATAAAAATGAATCATCATATGTATCAGAGGATGGAAGTCCATTGCAGAGTG ATCAAAGGAATATATGCCAAAAATACCCGATTTCTGAAGAAAGTGTTGGACATGCAATAAATTCTACTTCAGGTAACTTTCATTGATTCAGCATTCTGGT TTTAACCATGTACCTACTTGGGTTGGAACTTTTTTATTTGGATTTTTTGTCATTCACTTCATTTCCCTGATATTTACCATCTGATATGAGACAAATGAGG AACCTAGTATTAAATAGAACAAAACCTAAGTAGTCAATCCCTAATAGTAGTCCAGCTGACCCCAGATGGATGGAATCTATTAGGAGATGACCACGAATTC CACTCAGTTGTAGAAGAAGAATGCCGTGTCTTTGAGACATTGATTCCTTGTGCCACTAAGAAGGAGGATCCAGAACAGATGTGGTCTCTGCAATGAATTC GGCGAGGATGAAAGAAAAGAACGAAGCAGAAGAAGTTCGAAAAAATAAATAGAGGAAGGAAAAACAAATTAACCAGTAGAAGGTCTGGGTGGAAGAGTAA TAGTAATGGTTAAATAGAGATTTATTGAGTCTAAGTGAGGGTAAAGAAGACATTTAAAAATATTAAGAAGAGTCGCCGAGTTAAAGAGGGTAAAATAGAA CATTGACAAGTGAGGGTGAATTTGTAAAAATAAAAGCAAGGAACATGAAATGTGAAAATTAAAACCCTAATCCAATCGGGAAAGAAGACTGCTGCTGCCA GGAAGAATTAACCCCAACCACTATATGCTGTCACAGCCACTATAGGGTGTAACTCTCGCTGTGTGGGGAACCTATAATTGACATCGTTATTCCGCTATAG CATGCAATAGCACTGCTATTGACTACCTAGAGTGAAACATAATAACAAGCCAATTTGAAAGATATAATATTATTCCTTCTGCTACATTAAATTTGGAAAC ATGATGTCTTCTCACATGTTTCTTTTTCTTTAGCTTTCAGAATTTAAACACAAGAAAAATTGAAAATTAGTGATAAATATGGTTAGAATTTGGAGTAATA ATTCCATAAATGGAACAAATTAATTTTTATCACATTATCGCACTTACCAATTCCAGAGATAATTAGATGATAATTTTGAATATGGTAGACAAACTCTAAT CAAGCGGGCTTGTTTGTCCTAAACCTTTGGGATCACAATACAATTTTCTCTTGGAGATACTAAAATATTGAAAACACTGTTGTAAAGTATCTCTGCTTAT GCTCCCAATCAAATAATAGTTGTGGCTCTTTATTTGTAATCCTTCTGTGGTTTAGAAAAATTAGACCATCAGGACATCAATATGTTTGATAAGTTTTCTA CGTTCTTAGTTCTTACAGATATTTTATTCCCATTTCTTCTGGAAGCTCAACCAAACAATATAATTTTTCCCTCTATCCTGCATTCTGTCTTAAAATTGGT GAATCGGTAGAAAAGGCGGGATATATAGTACTTAGTAGAGCTTAGTTAGATATTATCATCCAAAAAGTTCAAGATTCTACAAGTGTTTTGATGTTCCTTA CTTCCTGCATCTACTCTGTGCATATTGTAGCACGATGCACGTTATTTGAACATGTAATGTTCTCCATTCTTAAATTAACAGTGCCCCGAATTTTCTAATT TCTCTATCAGTTGCACTGCACCCTATTGGTTTTCCATTGCTGTATACAAAGCAATAACTGCCCTTAGCCCTATGCCTCTTATCTTGAATATAAAACTCAA CAGAATATTTCGTGAAAGTCTGTTTCAAGTCAAGTGGAATAGAAAGGTTTGCCTCTTTGTTTGAATAGATTATTGAATCTTTTTGTTGACTTTTGGCATT TGATATGGAGATAGTTGTATTTTTTAGTGTTGAATGGTTCATTGCGGTCCAGTATGTGGTTCTTTAAACATAAAAGAAAATCCTCTAAAACATGGTCATG GAAGTTTCGCTTATAAACACACAATCTTGGAGATGGTCTAGATGAGACTTTTTTGTGATAACTACAAGTTTAGGGTGACAAGAGGCTCTCCCCATTCAAA GCTCACCAACCTCAGGTATGATTTTACAGTGGCATTACAGATCGCTTAACAATGAGGATCCCTGGATGAAGACTTCAGTGTTGGTTGTTTTATAGATCTG CAAGTTGTGTACCTTGCATGAGGGCTAACCAATGACTATATATTGTGAAGCTAGATTCATATGAATTGTTTCTGCATAGGTGCATCCTGTGTGCCCATGC GTCACATTATCCTGCTGTTTGCAATATGTAAACTGATCCTGTTTTTGATGCCGTGGTAAATTATTATTCACTCAACTGCTTGATTTATAGTATCTCACAT GTTTGTTTCAGATCAATCTATTTCTACTAATGTCTCAATGGATGTGAATGTGGAACAGGTGAGGTTATAATAGTGGAGGAATCTAGTCTTGTTTTATGTT TTTGCTAGTTCTTGATGTGTGATTTCTTTGACACGCTTCCTACTTATTAATCTCTTTGAAGGTGAAGGGGATAGAAGAATCATCAACAGTATCGTGTCCA TCGACAAAACTGTCATCCTCATTACCTTCTACTTCACTGTCGGCATCTCCTTTGCCATCTCAAAGTCACCTAGCTCCCTCCAGCTCAACCCCATCAAGGT GGTCCTACCATTCCCCTGGAGACCAACTATTACGGCAAGTGTCTGACAGCCAAGTCCCAGGATTCAAGTCACCAAAATGCTTCTATGTGACTGCAGAAAG GCCGGTGCTTCCTTCATGGAGCAACGAATCGGGTATGCGCTCTTGTGATGGATCTTCAGATGGTTGGTCTGTGCCTGGCTTATCTGAGCTGATGGGAACT TCCAATAAAGAAAGATGGTCTTTTGATAGTGAATCTTTTGGTTTTAATCGGGAAAGGTTACTTAGATCAAGTAGTCGGTTTTCAACATCTCCAGTTGATT TGCAAACATGTGGTGTTTGCTCAAAACTTTTAACTGAGAAGTCTTCTTGGAGCTCCCAAAAGATAATTGTTGCAAGTAATGACCTTGCTGTAGTTTCTGT TCTTATTTGTGGCCATGTCTATCATGCTGAATGTTTGGAGAGTATGACACCTGAAATCAATAAGTATGATCCAGCTTGCCCAGTTTGCACTTTTGGTGAG AAACAAACTCTTAAGTTGTCCCAAAAAGCTCTGAAAGCTGAAATGGATTTAAAGACTAGAAACAAGAAATCAAAGAACCGAATTGTGGACAGTGAAATTG GTGATGATTTTGTGTTTGATCATTTTAAAGATGGAAGCCATCAAGGTAAAGGTCCTAGGATGGGATCTAGTTCTAGTGGGAGAAGCTCCTTTGGAAAACC TTTTCTGAGGAGACACTTCTCATTTGGCTCAAAGAGTTCCAAATCCATGTTAGATAGTCACCCTACAAGAAAGAAGGGATTCTTTTGGGCAAAATCTAGC AAGCAATAATCTGCTTCTTAGTTGTTTGGAGGTTCTATTATCTGCTCTGCAACCTAAGATAAACAACTGAAGAAAGAGCAAAATGTGATTCATTCATCAA GCTTAGACTTTTTAGCATCTGCATACACTAAACCTTGATTTCAACAGGACTAGAAGCTGAAATTACTCTGTAAAGATGAAAAGTGGAAAGCATACAGAAG GATATGAAGAAGACAAACATAGTGTTTGAATAACAAGGGTCTTTTTATGTTGTACAGATCAATTTGTTTATTGAATGGATTTAATTCATGTACCCAGATG ATGTTCTGTTGTCTATGGTTCTGCTGATATGTATTGAGTACATGCCATTAGCCCTTAGGATTTCTTGGTGTTTGGGCAATGGTCTTCACAAATTATTAGG CAATACCAATTATTTTGGTTGACTTCACTTGCATTTAGCCAAAGAATAGTTTCAATTCAGAAGAACCTTATGTCAAATAAATGACTTTGTTGGTAGAAGA TTGAATTATGCTTTTTCATGCATGGATTGTAGGAGTTGAGGGTTTAGTTTGTTGTTTGCTGACTATATGTTCCTTCAATTTTTCATTACTTATGTATTAC TATTATGGTCCAATGATATCAGTTGATATTTTCTGCTAATTATTGGCGACAAAAAGGAATACATTATTGACTCAGAAAAG BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_181219; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_388151
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | - |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019449398.1) |
| Pfam | RING-type zinc-finger (PF13445.5) |
| Rfam | - |
| GO | - |