Ll_transcript_387912

• Id Trinity: TRINITY_DN50986_c2_g1_i4
• Name Transcript: Ll_transcript_387912
• Sequence: GAATAAAATATCTCCTTACACAATGAGATAATTTATCTCCTTAAATCCATTCATTGCTTGACATGTGTCTTTTATTATATATTTTAAAATGAAAACTTTT TGAAGGAAGAAAAAATAAGACATATATCAAACACTATATGAAGTTAAGGAGATACCTTGTCTCTTTGTACAGGGAAATACTTTATTTTCATTTATATTTC AAGGACAATTTTTTGAAAATTTCTGGATCATTGTCAAATAACTGCTTCCGTTGATCCTAATCCCGGTTTTTCACCCATGTATGTGTGTGGTTTTGATTTC ACTTGTGTGGTTAACTGATAAGGGTGAAGAATGACAACTAAGAATCCTACGAATTCTAATGAATCAGAAATTCAGAATAACTTAGAACAAGGAGAGTTCA GAAAAAAAACCCTGACATTCACTTACTGATGAAGATATGAATGAATTAAGGAAGATATTGAAAAATGATCATAACCGTCCAACAGAATGGGCGGTGAAAA AGAGCTTTACAAGAGAACAGGACAGCCAGCACACCACATGGCTCGGGTTGTACAGGGCATAACCAGTGTTTTATATTATGGTCGTGATTGTGGCGATTAT TGCGATTCCTATTGTTTTGGCCACTACGATGCGGATTGTGTCCATTTCAATGCAGCCTGTTACTGCTCAAATGCAGTTTGATGCGATTGTGTTGCAAGAT GCAATCGCATCATCATGATTTGGTGTCACACTACAATTGCAGTGTGATGCGATTGCGGCGGTTACCATAACCGCAATAGTATAGTCGCATCATATGACGT GGTTTGCAATTTAAATCACTGATCATAACTCAATATTCAATTAAAACTAAACATTTAACTCCTTATCATGAATCCCTGCTAAGTGTAATATTTACTAAAG CTACGGCCAACTGTTTATATAAAAAAAGTGGTTCTATGAATGTTATTTTGGAAAATTAAATTGGGTTTATGTATAAAGCAGCTCTATTTTGGAATTCTGT GAACATTAGGTTTTTAAGTTGCAATGATTACTGTTTCCGTGGTTTGCTCCGTGACAGAAAATTAAGGGCTACATACTTCGATAATGATTGCGATTGCATT GTAATGCAGAAAAATACTGCTCTTGCAGCTCCAATTGTAGTTGTGTTATGGTTCCCAAAAGGCCAAAACAGCAATCACATACTTCGATTCAAAACATCAT ATTGTAGGGGAGGGTTTGTGGGGTTGATTTCATATATTATCTGAAATCTGTCAATTACCCTTGTTGCCATGTAGTTCTGGTTGTGATTTGTTCATTTCTT GGTATATCACACTCTACAGAATACAGATTATGCATATGAATCATATGATGCATTGAGATAAAACTGTACTATTACAATTTTAAATCAATGTTTATGGAAT ATGCAGTATGGATACACTGTTCTGCCGATTTGTCACCGTTCTCTTATTTTTAAGACTTTCAATACGGTGAATTCGTTAAATGGTAAACGAGAGAATCTAG TAACTATGTTTTAAATCAATAATAAAAGTTTTCGTGTGTGTTTTGTTATGGGGAAGGTTAACATAAGCATTATTCCCTCCTCTGATTTTGTGGTGTCTTT TTTACATTTTAGTAATGAGATGAAGATGCATTTTCCTGCTGCCTCATGTTAAGCAGCATCAAATTTATAGTAGATTTTCTATAGAGAGATATTAGGTGAT TCCTCTGTTATTGTGGTAGAGGGTGGCTAAAGGGGTATTGGTTTCTATTGAGTAGTACTATATACTTTCTATAGAGAGATTCTAGCCGACTTTCTATTAA GATGCATTTTCGTGATGCGTTGCTGTGTTGCTGACATGAATCGAACTCTTAACCTTTTGATCTTTCTGGGGACCTAGCAAGACCTTATACAGTTACACCA CTAAACCAATGTCTTGTTGGCATTTTTAAGTAGTTATTAAACATTAGCAACATGTTTTGAATCAGGGATTCTTTGTCACAACACAAGAAATTGCAGTTGA ATAGTTATTTTCTAAATAATTAAATCACATAATTATTTCATGACTTCATGGTAAGCTATTCACAATCATGGAATTAACTGGTAAATGGATTTCCTTTTGT TCAGAAATTGCTTCTACCATATTTTATGACTTTCGGTGATTCCTTCTTGGTATAGTTTTGTATGTGAAAACTTAAAACTTAACCCAACTGGTTGAACATT ATGCAGCTGATGGAAAAGAGATCCAAGCTGCATTAGCTGAGTGGACCGGTCAGCGGACTGTGCCAAATGTGTTCATCGGCGGAAACCACATTGGTGGCTG CGACTGTAAGCTTGATGTCTTATATTTTTTATAGATCTTTACAAATTTCTTCCTCACGGGGTTTCATTGCATAAAGTAAATCTCTCGTATTCTTTGACGT TACCAGTTTGGTCTTTCAAAAATTGACTATGAAGTACTGAAATAAGTATGTATTCTATATTTTATTCAATTGTTAACTCCATCCTTTCTGTTTCTATGCA GCAATTACTGGCTTGCATGGCCAGGGTAAGCTGGTACCTCTGCTTAATGAAGCTGGAGTTAAGACTGCTTGAAGGAGCTCAATTTGTGTTTATCTAGCAT AATAAAATTTCTCAAATTTTTGGGAAGATGTAATTCAAAGCTATATTCCTCCTCTTAATTGTGTGATTCTCTTTAAAGTACAACTCTATCAATAATTCCA TTGCTGAAGTAAGTGTTGTTGAAAATTTATCCTCTCATATAATTACTCTGATCCTGAGTATCCAATGGTCATTCTTACAACATTGTGTTGAAATAAAAAT ATTTTTCTCTTATTTACTAAAAA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_181509;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_387912

FPKM

• PAB: 0.4
• PNAB: 0.5
• PS1: 0.4
• PS2: 0.2
• PS3: 0.5
• PW1: 0.8
• PW2: 0.4
• PW3: 0.4

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_387912

• Blastp: -
• Blastx: Glutaredoxin from Ricinus with 87.88% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: Link to kegg annotations (8289824)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019454824.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;