Id Trinity | TRINITY_DN51004_c7_g1_i1 |
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Name Transcript | Ll_transcript_527878 |
Sequence | AAAAAACCCTGATAGAATAAAATAAATATCCAAGTTTGAGAGTAGAGATAAACACACTGTGTTTGTTCTTTTTCTCCTTTCTCCTTTTTTTCCTTTCCTC TCTCTATAGGGTTTCTTTCAATGTTTTGAACTTCAAGTATCCAAAACATTTTCTCTATTTTTTCACTAATTTAGTTGCACTTGGGGTACTGACCCAGAAA AGAAGGATCATCAAGTACCAACCAAGAGAAAGAAACTATAATAAATAAGAAAATGGAAAAATTGAGTGAGGGTAGGGAATAGAAGAGGTTTGGGTTTGAA GTAGAAAGAAATATATAGAATTGAAATAATAAGTAATAATAAGAATATGGGTAGGGGAAGAGTGGAACTGAAAAGGATAGAGAACAAGATAAACAGACAA GTAACATTTGCAAAGAGAAGGAATGGACTTTTGAAGAAAGCTTATGAACTTTCAGTTCTTTGTGATGCTGAGGTTGCCCTTATCATCTTCTCCACACGTG GAAAACTCTATGAGTTTTGTAGCTGCACCTCTGGGTATGTATAATATATATTTATTACTTATTCATGTATTGTTTGTGTTTGATCTTATATGCTGCATAT TACATATATTCTTATATGTATTTTAATGGAGTTTTTTATTTGGTTATTTGCATTCATATCTATGTATAACTCATTTTCTTATTGTGCATCTACTATATAT GTTATATGTGGGAGATCTACTTACTTATTTTTTATATTTGGTGCCTCTCTTTGGATTTGTTTGCTTCAACAAATTAAAGAAAGCTATTTCATTTTTCAAT TTCCATTTTTTAATATTTCATTCATACACAAAGTTGAATGAAATTCTTTGATCTACATCTCTTTTTCTTATTTTGTAGCTACTTTCTCTTTATAAATGGG AGATCTATCTGATTCTTTTTTTTCTTGTTTGGTGTATCTCTCCTTGGATTTGTTTACTTCAATTTTTTCCTTCAAAGAATGCTATTTCTCCTATTTTATA TTTAATTTCCACTATTTTTTATTATCATCCACACACACTGCTTCAATCCTCTTTCTTACTATCTGATTTAATGGATTCTTTGAGCTATATTAGCTTGAGA GAAGCTTTGTACTTTTCTTTAATTCCTTTTGGTTGCAGTTGATGATGTAATGAAGTTTCAATCTTGATTTGATCTTTGTATATAAAGTTGTTGTATGGTG AGATCTGAGGATGTGCCTACATGACCTATGGTCAAATGTCTGATCCTTTGATTATTTTGACTAGCTTTCTCTAATTTGTTTTCTCCCTAGTCTTGTTTTT GTGGAATTCTGCTTAATTTTTATGTATCCTCTTTCTATTCATGCATAATGTTATTAGCACTCCCAAGTGTCTATTAACACTCCTAAATCCAAATTTACAA ATAAAAATTTCAGCTTTTTATTTTATAAAATTATAATCTTTCAATGGGTATGTAAATAAGCAAAAGTTCAATATCTAAACCCTTTATATACCTGACTCTT GTTTGTGTTCTATGGTATGAAGTATTTTGCTTTCTATATTTTCCTAAGAAATTTGGATAAGTGTGTTGTTGACAACTTAAGAGTTGTTAGCAGAATACTA GATTATGTTGAAATGAAGTTCTTACCTTTGAACACATCTTCCTATGATGCAAGGACAATATGTGATTGAGCATGATGATCATCCAATGTTTTGCAACAAA AAATAAATAAATCTATATTCTTTTATCCTAAAACCAATAACTCTGTATTTGGGAAACATTTAAGAGTGATTATATGTAACTCTATGAAGAGAAGTTTTTA TATTTGCATAAGTTATTTCAATTTATAATATCATTTTGGTACCCATGCAAAAATTATATTTCTATTCACTCGGTAATAATCTTTTCTTTCTGTACATAGT GACTAATTATTCTTTCTCATTTTGGTACCAAAACATTATGATGTCATTGAATCTATGTAGCCGATCTCGCCTTAATAAAATTAAAGTTGTGATATTGTTA TATTTATATACACTCCTATGTCTTGTCATCTAAATTCTTTCTTTCATATTTTAGATTGTAAATAATAGTTCTATATCTGAATACTCTCAAATGATTGAAT GATCATTCTTATTGTATCATGCTTCCTTTGGAAACTCACCTTTTCGGGATCTTGAAGGTATCATGTTTGTGAGACCGGTTGCAATCTTTGTTGCTTCTCC CGAAAAAGACCTAAGGAGATTAACATCTTGCAACATGTGTTTGATTTTCTTTTAGATTGTGTAGTTTATCCTCCGAGCTAATCAATTCAATTGAGGTGTC TTTGGTGTTGTCTTCCCTAGTCAATTACCATAAGCTTTGCAATATGTCTTAATGGACCATGATACACTCTATTATTTCATACACTTCATATTCTTCCCCA ACTAATGCTCAATTAGAGCATGAATTTTTTTAATGTTGATGGTACTTGATCTTTGCTTTTCAACAACTACATCCATACTCTTCTCGAGTGATCATCAACG AATGTTACAAAGTAGTAGGTTCCTCCGGGGGATATTTTTATATGATTTACATACATCTAAATGCACAAGTTCAAGTTGATACCCTTTTACAAACTTGGTG TATGTACACACCATACATCATCAATTTAATGGTTCTTCTATTATTTTCCTACAATCAGCATGCTCAAAACACTTGAAAGGTACCAAAAATGTAGCTATGG TGCAGTTGAAGTTAACAAGCCTTCCAAAGAGCTTGAGCAGAGTAGCTACCGTGAGTACTTGAAGCTGAAAGCAAGATTTGAGAGTCTTCAAAGGACCCAG AGAAACCTTCTAGGTGAAGACTTGGGCCCATTAAACACCAAAGATCTTGAACAGCTTGAGAGGCAACTGGATTCATCTCTCAAACATGTCAGGTCCACTA AGACCCAATTCATGCTGGACCAATTATCTGATCTTCAAAATAAGGAGCAAATGCTGGTAGAAACAAATAGAGGTTTGGCCATGAAGGTAACATTATACAC AAAAAAGATTAGCAACCTTGCAACTCTTGCTTCTCTTTAGCTGCATAAATTTTATACAAAATCTAGTCTCATTTAGTGGAGTCTCGGGAGGTAGATGTAT GGAGCTTTACTCCCGTAATATAAGCGGAGAAGTTGTTCAAATCCTATATACAATCTCTCCCCTTGCAAGGGTAAAGTTATATATACATCTATCCTTCCAA GATCCTATTAAGCTGGAGCCTCGTATAAGTCGGACCCTTGTATACTGGACCGTCTTTTTTTTATATATATACATCTGACCTTGTGTGAGAACTTTTGGTA GTTATATTTATCCTACAAATGTTTAAGAAAACAACCTTGTATCTCTATATTCTTGTCCAACCTGATTGGAATTGCATTATTGAAAGTTAAATTTTTCTAC AAATCCTTTATTTTCTCCACATTCAACACCAGTATATGTATATGTATTAATATTATTGTCATATTTTCCCTGTGCCATAATATGATTGTGCACTTGCCTT TGTACTTATGGCATGGAAATACTATTCTGCATTGTTTAATGTATTATTCTTCCTTTCAAATTAAGCTCTTTTGGTAATAACTTGATGAATGAAAAATGTT TATTGGGTAGCTGGAAGAAATCAATTCAAGAAACCAATACAGACAATGGGATGATGGTGAACAAAGTATGCAATATGATACACAGAATGCTCACTCTCAA GGCTTCTTCCAACCTTTGGAATGCAATCCTACATTGCAGATAGGGTATCATCATGTAGCCCAAGATCAGCTAAATGCAACAACTCAAGCTCAACAAGTGA ATGGATTTATACCTGGATGGATGCTTTGAACTAAGCTCAGCATTTTGCTACCTACATAATGATAAAAGCCTAATATGATTGTTAATGTTGGCAATGAATG TGTAAATGCTACATTTGCTTCTGTTATTTGTTTTGGTATAAAAACAGCAGTGACTGACTTAAAACTATTAAAACTTTAGCCATTGTGATATGGCATTGGC ATGTAAGAAGTTTATTGTATTTTGAATAACTTTTCCATTAGAACTTAAGCATGGTTTTCTCATCAAGATTGCATTTTTTGCAATGTTCCTACATCATCTT TCATTGTTTAGTTCTTATTGATTCTTAAATAAAAGTAATACAAATGAACGGTAGATGATACATTGGCTA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_181685; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_527878
Blastp | Developmental protein SEPALLATA 1 from Arabidopsis with 81.98% of identity |
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Blastx | Developmental protein SEPALLATA 1 from Arabidopsis with 75.83% of identity |
Eggnog | Transcription factor(COG5068) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT5G15800) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019426557.1) |
Pfam | K-box region (PF01486.16) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |