| Id Trinity | TRINITY_DN51004_c7_g1_i15 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_527896 |
| Sequence | AAAAAACCCTGATAGAATAAAATAAATATCCAAGTTTGAGAGTAGAGATAAACACACTGTGTTTGTTCTTTTTCTCCTTTCTCCTTTTTTTCCTTTCCTC TCTCTATAGGGTTTCTTTCAATGTTTTGAACTTCAAGTATCCAAAACATTTTCTCTATTTTTTCACTAATTTAGTTGCACTTGGGGTACTGACCCAGAAA AGAAGGATCATCAAGTACCAACCAAGAGAAAGAAACTATAATAAATAAGAAAATGGAAAAATTGAGTGAGGGTAGGGAATAGAAGAGGTTTGGGTTTGAA GTAGAAAGAAATATATAGAATTGAAATAATAAGTAATAATAAGAATATGGGTAGGGGAAGAGTGGAACTGAAAAGGATAGAGAACAAGATAAACAGACAA GTAACATTTGCAAAGAGAAGGAATGGACTTTTGAAGAAAGCTTATGAACTTTCAGTTCTTTGTGATGCTGAGGTTGCCCTTATCATCTTCTCCACACGTG GAAAACTCTATGAGTTTTGTAGCTGCACCTCTGGGTATGTATAATATATATTTATTACTTATTCATGTATTGTTTGTGTTTGATCTTATATGCTGCATAT TACATATATTCTTATATGTATTTTAATGGAGTTTTTTATTTGGTTATTTGCATTCATATCTATGTATAACTCATTTTCTTATTGTGCATCTACTATATAT GTTATATGTGGGAGATCTACTTACTTATTTTTTATATTTGGTGCCTCTCTTTGGATTTGTTTGCTTCAACAAATTAAAGAAAGCTATTTCATTTTTCAAT TTCCATTTTTTAATATTTCATTCATACACAAAGTTGAATGAAATTCTTTGATCTACATCTCTTTTTCTTATTTTGTAGCTACTTTCTCTTTATAAATGGG AGATCTATCTGATTCTTTTTTTTCTTGTTTGGTGTATCTCTCCTTGGATTTGTTTACTTCAATTTTTTCCTTCAAAGAATGCTATTTCTCCTATTTTATA TTTAATTTCCACTATTTTTTATTATCATCCACACACACTGCTTCAATCCTCTTTCTTACTATCTGATTTAATGGATTCTTTGAGCTATATTAGCTTGAGA GAAGCTTTGTACTTTTCTTTAATTCCTTTTGGTTGCAGTTGATGATGTAATGAAGTTTCAATCTTGATTTGATCTTTGTATATAAAGTTGTTGTATGGTG AGATCTGAGGATGTGCCTACATGACCTATGGTCAAATGTCTGATCCTTTGATTATTTTGACTAGCTTTCTCTAATTTGTTTTCTCCCTAGTCTTGTTTTT GTGGAATTCTGCTTAATTTTTATGTATCCTCTTTCTATTCATGCATAATGTTATTAGCACTCCCAAGTGTCTATTAACACTCCTAAATCCAAATTTACAA ATAAAAATTTCAGCTTTTTATTTTATAAAATTATAATCTTTCAATGGGTATGTAAATAAGCAAAAGTTCAATATCTAAACCCTTTATATACCTGACTCTT GTTTGTGTTCTATGGTATGAAGTATTTTGCTTTCTATATTTTCCTAAGAAATTTGGATAAGTGTGTTGTTGACAACTTAAGAGTTGTTAGCAGAATACTA GATTATGTTGAAATGAAGTTCTTACCTTTGAACACATCTTCCTATGATGCAAGGACAATATGTGATTGAGCATGATGATCATCCAATGTTTTGCAACAAA AAATAAATAAATCTATATTCTTTTATCCTAAAACCAATAACTCTGTATTTGGGAAACATTTAAGAGTGATTATATGTAACTCTATGAAGAGAAGTTTTTA TATTTGCATAAGTTATTTCAATTTATAATATCATTTTGGTACCCATGCAAAAATTATATTTCTATTCACTCGGTAATAATCTTTTCTTTCTGTACATAGT GACTAATTATTCTTTCTCATTTTGGTACCAAAACATTATGATGTCATTGAATCTATGTAGCCGATCTCGCCTTAATAAAATTAAAGTTGTGATATTGTTA TATTTATATACACTCCTATGTCTTGTCATCTAAATTCTTTCTTTCATATTTTAGATTGTAAATAATAGTTCTATATCTGAATACTCTCAAATGATTGAAT GATCATTCTTATTGTATCATGCTTCCTTTGGAAACTCACCTTTTCGGGATCTTGAAGGTATCATGTTTGTGAGACCGGTTGCAATCTTTGTTGCTTCTCC CGAAAAAGACCTAAGGAGATTAACATCTTGCAACATGTGTTTGATTTTCTTTTAGATTGTGTAGTTTATCCTCCGAGCTAATCAATTCAATTGAGGTGTC TTTGGTGTTGTCTTCCCTAGTCAATTACCATAAGCTTTGCAATATGTCTTAATGGACCATGATACACTCTATTATTTCATACACTTCATATTCTTCCCCA ACTAATGCTCAATTAGAGCATGAATTTTTTTAATGTTGATGGTACTTGATCTTTGCTTTTCAACAACTACATCCATACTCTTCTCGAGTGATCATCAACG AATGTTACAAAGTAGTAGGTTCCTCCGGGGGATATTTTTATATGATTTACATACATCTAAATGCACAAGTTCAAGTTGATACCCTTTTACAAACTTGGTG TATGTACACACCATACATCATCAATTTAATGGTTCTTCTATTATTTTCCTACAATCAGCATGCTCAAAACACTTGAAAGGTACCAAAAATGTAGCTATGG TGCAGTTGAAGTTAACAAACCTTCCAAAGAGCTTGAGAGCAGCTACCGTGAGTACTTGAAGCTGAAAGCAAGATTTGAGTCTCTTCAAAGAACCCAGAGA AACCTTCTAGGTGAAGACTTGGGTCCATTAAATACCAAAGATCTTGAGCAGCTTGAAAGGCAACTGGATTCATCTCTCAAGCATGTCAGGTCCACTAAGG TAATCAAATGCTAGTTTTTTCCATAGTTATGGAAACTATATTATATCGGTTCAATCGGAAAATCGATCTCTATATTAGTATAATATGATAACTATACTAG TGATGTAATTATAATGATCAAAACAGGTTGTATCGATCAGTTTTCATTTAAACCATACCGATCATGTTTACCGATTTTCATTAAAATTTTAATTTTCAAC ATCATTTTTGCAGACCCAATTCATGCTGGACCAATTATCTGATCTTCAAAATAAGGTACAGAGTGTGTGCATTAACTAGGAGAATAACACAACTTCATGT GTGCTGTGCCTAACACTTCTAAGCTATTACTTTGATACAGGAGCAAATGCTGGTAGAAACAAATAGAGGTTTGGCCATGAAGGTAACATTATACACAAAA AAGATTAGCAACCTTGCAACTCTTGCTTCTCTTTAGCTGCATAAATTTTATACAAAATCTAGTCTCATTTAGTGGAGTCTCGGGAGGTAGATGTATGGAG CTTTACTCCCGTAATATAAGCGGAGAAGTTGTTCAAATCCTATATACAATCTCTCCCCTTGCAAGGGTAAAGTTATATATACATCTATCCTTCCAAGATC CTATTAAGCTGGAGCCTCGTATAAGTCGGACCCTTGTATACTGGACCGTCTTTTTTTTATATATATACATCTGACCTTGTGTGAGAACTTTTGGTAGTTA TATTTATCCTACAAATGTTTAAGAAAACAACCTTGTATCTCTATATTCTTGTCCAACCTGATTGGAATTGCATTATTGAAAGTTAAATTTTTCTACAAAT CCTTTATTTTCTCCACATTCAACACCAGTATATGTATATGTATTAATATTATTGTCATATTTTCCCTGTGCCATAATATGATTGTGCACTTGCCTTTGTA CTTATGGCATGGAAATACTATTCTGCATTGTTTAATGTATTATTCTTCCTTTCAAATTAAGCTCTTTTGGTAATAACTTGATGAATGAAAAATGTTTATT GGGTAGCTGGAAGAAATCAATTCAAGAAACCAATACAGACAATGGGATGATGGTGAACAAAGTATGCAATATGATACACAGAATGCTCACTCTCAAGGCT TCTTCCAACCTTTGGAATGCAATCCTACATTGCAGATAGGGTAAATATATACTCAATTTCTTGTCTGTTTTTTTGTATTTAAGTTTTGAGCGTAATACGT ATACACTGTCCGTAAAGATTTATACACAATCAATACATCATCCGTCATTCATTTGCATTGAATGGTGGATGATATAGTGATAGGGTATAAAACTCGTATT GTTAGGACATGCATTTTTTTCTCGTAAGTTATTAACACTAATCCCTTTGATTCAGTACTGATTACAGGTATCATCATGTAGCCCAAGATCAGCTAAATGC AACAACTCAAGCTCAACAAGTGAATGGATTTATACCTGGATGGATGCTTTGAACTAAGCTCAGCATTTTGCTACCTACATAATGATAAAAGCCTAATATG ATTGTTAATGTTGGCAATGAATGTGTAAATGCTACATTTGCTTCTGTTATTTGTTTTGGTATAAAAACAGCAGTGACTGACTTAAAACTATTAAAACTTT AGCCATTGTGATATGGCATTGGCATGTAAGAAGTTTATTGTATTTTGAATAACTTTTCCATTAGAACTTAAGCATGGTTTTCTCATCAAGATTGCATTTT TTGCAATGTTCCTACATCATCTTTCATTGTTTAGTTCTTATTGATTCTTAAATAAAAGTAATACAAATGAACGGTAGATGATACATTGGCTA BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_181685; |
| Additional information | - |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_527896
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Developmental protein SEPALLATA 2 from Arabidopsis with 73.63% of identity |
| Eggnog | Transcription factor(COG5068) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT3G02310) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019451192.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |