Ll_transcript_527897

• Id Trinity: TRINITY_DN51004_c7_g1_i16
• Name Transcript: Ll_transcript_527897
• Sequence: AAAAAACCCTGATAGAATAAAATAAATATCCAAGTTTGAGAGTAGAGATAAACACACTGTGTTTGTTCTTTTTCTCCTTTCTCCTTTTTTTCCTTTCCTC TCTCTATAGGGTTTCTTTCAATGTTTTGAACTTCAAGTATCCAAAACATTTTCTCTATTTTTTCACTAATTTAGTTGCACTTGGGGTACTGACCCAGAAA AGAAGGATCATCAAGTACCAACCAAGAGAAAGAAACTATAATAAATAAGAAAATGGAAAAATTGAGTGAGGGTAGGGAATAGAAGAGGTTTGGGTTTGAA GTAGAAAGAAATATATAGAATTGAAATAATAAGTAATAATAAGAATATGGGTAGGGGAAGAGTGGAACTGAAAAGGATAGAGAACAAGATAAACAGACAA GTAACATTTGCAAAGAGAAGGAATGGACTTTTGAAGAAAGCTTATGAACTTTCAGTTCTTTGTGATGCTGAGGTTGCTCTCATCATCTTCTCCAATAGGG GAAAACTGTACGAGTTTTGCAGCAGTGCAAGCATGCTGAAGACACTAGAGAGGTACCAGAAATGTAACTATGGAGCTCCTGAGCCTAATGTATCTACACG GGAAGCTTTGGTAATGGTGAATAATTAATCCCATATTTAGTATTTTGATTACATTACTTGTTCATTAAACTTGCCTAATGCAATGTCCTGGTTGATCCAA GGTTTAGAAGAAGAAGTTCAAGGAGTTAAATATTATGGTGAAGAGGGGAATGAATACATGTCAATACTCTAGAACATAATCAATACTTTCTAGCAAATAA GACCTATACATTGTTGGTGATTCTGTGATTGGTAAAATCAAATCAATGTTCTAATGGCCACTATGAGTTTTACAAAAAATATTTGAATTAGTTAAATTAG CATCAAAACTCTTTGAGAAATTAAGGTGGTAGTTTATATTTTTGAACTCTTGGAATGTTTTAAATGCTTGCTTTCAAAAAATTTCCTATTCTTATATTGA GTAGGTGTGACAATTATTAAATTTCTTCTTCTTTATTAATTCTTGAGATTAAGTATATAGAAGTATTTCTTGTTCTCCTAATTTCTTTCTCTAGTTATTA ATAAATTTATTTGTTGATAGAAAAAAGTATGCCTTGTGAAGAATTATTAACTTGTTTTACCTTCTCAAAGTACTAGATGTTCAGTTCTAATAAATTAGTT CCTTCACCTTTTTGGGTAAGGAACTAATTCCTTTCGTGATTATCCCTCCTAAGAAGTATCACTCATAGGAATCGAACTCTCGACTTTAGAGATCCAGTGA TATCTTACACCACTAGACCAATGACTTATTGATATTTTAACATTTTGTTAGACAAAACTCTCAAGGTGATATAAATTGTTAAGTGTGAAAGGTCACATAT TGAATTAGAATGAGTTAATAGTCTTTTAATATGATGTGAACAATCTCTCATGTGAGGTAGTTTCAATATAATTAAGGTCCAATTATTCTAATAATTTATT ACAGTCTAATACAAATATTGTGTCCACCTAAAACCTTTAGAAATTAGAACTTGTTCACAAAAACCCAATAAAACATTAGTCTTACACTGGCTGGTAATCT ATGAGAGAGCTGCATTATATGACTTTGTACAAACACAAGACAGTAATTTACATGTTACTGAATCTGACACAAAAAGCTTCCCATCCTTTGGGACAGAATT TTTTTTCAAGGACAACATCAAAGGTACTTCGAAATTATTACCTATGTTTTGTCCTTTTTCCAAAATATTTGTCAAAGTTCTCCTTAGTATTCTGTTGCAT TTAGCTCATCTTTCACCCAAAAGCTTGCTGAATCTGTATCTGGACCTCAGGGTTTCTGCTCAAACAATCCTCCATGGACCACAGTTTTGGTGATATTGTT ATTAAGATAACATTGATTTTTATGGAATTTTTTGCTGCCTTTTCATATGTTCATAGAAAATTTAAATGAGATATCATCTGCCTTCAATTTATTTTCCTAG TTAAACTGTTTCCAACATGTTGTTAAGATTATTCACAACACTAGTTGTTGATTCTTTACCAATTAGTTGCCTATACAAGAAGTGTTCATGAATTAGGGCC TTACAGTGTTAAAGGCCTGGAAAGTCTACTAACTTCTATATGATAAGTTTCAACTCATTTTATACCTCTGCACAGTGATAAGGATCTGAATTGGACTTTA ATTGATTTATGGGAGTATTATGGTATATTGGACAGAGAATTTGGAGAGGTTTTCTGATCTGACTTTATATATATTCTGGTCTTTTTTGGCTTGTGAAACT TCATATATTTAAGCTTACCCTTCTTTATAAATGAATTGGGATTTATAAGTTACAATAAACATTTTAATGTATTTAAATAAACTCTAGTTCATGCATATGT AGTGCCTGGATTCATGTATGTATGCATATTGCAGAGTGTAAGGTGAACCTTGAATATGCCTTATTGTTGTCATGAATATGGATATGATGAGGATATATAT TTTCGTAAGTAGGATAATAATATCAAGATATATATTTTCATAAGTAGGATATGAATATGACAATAATTTTTTAATGTATGATTTGAAATTTTGAAACACC TGATATGACCTTTTTCTTAGAGGTACACCATGCACATTTTTGCTACACACATCCTTAATTTAATATTGTATACTATCATCCCTTAATTAAGTGAGTGCAT TCATTGATTTTGGTGGGATGAGTGTAGGAGTTGAGTAGTCAACAAGAATACTTGAAGCTGAAGGCACGTTATGAAGCCCTC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_181685;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_527897

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 5
• PS1: 8.9
• PS2: 4.8
• PS3: 11.7
• PW1: 2
• PW2: 3.5
• PW3: 4

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_527897

• Blastp: -
• Blastx: Agamous-like MADS-box protein AGL9 homolog from Lycopersicon with 96.59% of identity
• Eggnog: Transcription factor(COG5068)
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019434306.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;