Id Trinity | TRINITY_DN51004_c7_g1_i2 |
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Name Transcript | Ll_transcript_527879 |
Sequence | AAAAAACCCTGATAGAATAAAATAAATATCCAAGTTTGAGAGTAGAGATAAACACACTGTGTTTGTTCTTTTTCTCCTTTCTCCTTTTTTTCCTTTCCTC TCTCTATAGGGTTTCTTTCAATGTTTTGAACTTCAAGTATCCAAAACATTTTCTCTATTTTTTCACTAATTTAGTTGCACTTGGGGTACTGACCCAGAAA AGAAGGATCATCAAGTACCAACCAAGAGAAAGAAACTATAATAAATAAGAAAATGGAAAAATTGAGTGAGGGTAGGGAATAGAAGAGGTTTGGGTTTGAA GTAGAAAGAAATATATAGAATTGAAATAATAAGTAATAATAAGAATATGGGTAGGGGAAGAGTGGAACTGAAAAGGATAGAGAACAAGATAAACAGACAA GTAACATTTGCAAAGAGAAGGAATGGACTTTTGAAGAAAGCTTATGAACTTTCAGTTCTTTGTGATGCTGAGGTTGCCCTTATCATCTTCTCCACACGTG GAAAACTCTATGAGTTTTGTAGCTGCACCTCTGGGTATGTATAATATATATTTATTACTTATTCATGTATTGTTTGTGTTTGATCTTATATGCTGCATAT TACATATATTCTTATATGTATTTTAATGGAGTTTTTTATTTGGTTATTTGCATTCATATCTATGTATAACTCATTTTCTTATTGTGCATCTACTATATAT GTTATATGTGGGAGATCTACTTACTTATTTTTTATATTTGGTGCCTCTCTTTGGATTTGTTTGCTTCAACAAATTAAAGAAAGCTATTTCATTTTTCAAT TTCCATTTTTTAATATTTCATTCATACACAAAGTTGAATGAAATTCTTTGATCTACATCTCTTTTTCTTATTTTGTAGCTACTTTCTCTTTATAAATGGG AGATCTATCTGATTCTTTTTTTTCTTGTTTGGTGTATCTCTCCTTGGATTTGTTTACTTCAATTTTTTCCTTCAAAGAATGCTATTTCTCCTATTTTATA TTTAATTTCCACTATTTTTTATTATCATCCACACACACTGCTTCAATCCTCTTTCTTACTATCTGATTTAATGGATTCTTTGAGCTATATTAGCTTGAGA GAAGCTTTGTACTTTTCTTTAATTCCTTTTGGTTGCAGTTGATGATGTAATGAAGTTTCAATCTTGATTTGATCTTTGTATATAAAGTTGTTGTATGGTG AGATCTGAGGATGTGCCTACATGACCTATGGTCAAATGTCTGATCCTTTGATTATTTTGACTAGCTTTCTCTAATTTGTTTTCTCCCTAGTCTTGTTTTT GTGGAATTCTGCTTAATTTTTATGTATCCTCTTTCTATTCATGCATAATGTTATTAGCACTCCCAAGTGTCTATTAACACTCCTAAATCCAAATTTACAA ATAAAAATTTCAGCTTTTTATTTTATAAAATTATAATCTTTCAATGGGTATGTAAATAAGCAAAAGTTCAATATCTAAACCCTTTATATACCTGACTCTT GTTTGTGTTCTATGGTATGAAGTATTTTGCTTTCTATATTTTCCTAAGAAATTTGGATAAGTGTGTTGTTGACAACTTAAGAGTTGTTAGCAGAATACTA GATTATGTTGAAATGAAGTTCTTACCTTTGAACACATCTTCCTATGATGCAAGGACAATATGTGATTGAGCATGATGATCATCCAATGTTTTGCAACAAA AAATAAATAAATCTATATTCTTTTATCCTAAAACCAATAACTCTGTATTTGGGAAACATTTAAGAGTGATTATATGTAACTCTATGAAGAGAAGTTTTTA TATTTGCATAAGTTATTTCAATTTATAATATCATTTTGGTACCCATGCAAAAATTATATTTCTATTCACTCGGTAATAATCTTTTCTTTCTGTACATAGT GACTAATTATTCTTTCTCATTTTGGTACCAAAACATTATGATGTCATTGAATCTATGTAGCCGATCTCGCCTTAATAAAATTAAAGTTGTGATATTGTTA TATTTATATACACTCCTATGTCTTGTCATCTAAATTCTTTCTTTCATATTTTAGATTGTAAATAATAGTTCTATATCTGAATACTCTCAAATGATTGAAT GATCATTCTTATTGTATCATGCTTCCTTTGGAAACTCACCTTTTCGGGATCTTGAAGGTATCATGTTTGTGAGACCGGTTGCAATCTTTGTTGCTTCTCC CGAAAAAGACCTAAGGAGATTAACATCTTGCAACATGTGTTTGATTTTCTTTTAGATTGTGTAGTTTATCCTCCGAGCTAATCAATTCAATTGAGGTGTC TTTGGTGTTGTCTTCCCTAGTCAATTACCATAAGCTTTGCAATATGTCTTAATGGACCATGATACACTCTATTATTTCATACACTTCATATTCTTCCCCA ACTAATGCTCAATTAGAGCATGAATTTTTTTAATGTTGATGGTACTTGATCTTTGCTTTTCAACAACTACATCCATACTCTTCTCGAGTGATCATCAACG AATGTTACAAAGTAGTAGGTTCCTCCGGGGGATATTTTTATATGATTTACATACATCTAAATGCACAAGTTCAAGTTGATACCCTTTTACAAACTTGGTG TATGTACACACCATACATCATCAATTTAATGGTTCTTCTATTATTTTCCTACAATCAGCATGCTCAAAACACTTGAAAGGTACCAAAAATGTAGCTATGG TGCAGTTGAAGTTAACAAACCTTCCAAAGAGCTTGAGAGCAGCTACCGTGAGTACTTGAAGCTGAAAGCAAGATTTGAGTCTCTTCAAAGAACCCAGAGA AACCTTCTAGGTGAAGACTTGGGTCCATTAAATACCAAAGATCTTGAGCAGCTTGAAAGGCAACTGGATTCATCTCTCAAGCATGTCAGGTCCACTAAGG TAATCAAATGCTAGTTTTTTCCATAGTTATGGAAACTATATTATATCGGTTCAATCGGAAAATCGATCTCTATATTAGTATAATATGATAACTATACTAG TGATGTAATTATAATGATCAAAACAGGTTGTATCGATCAGTTTTCATTTAAACCATACCGATCATGTTTACCGATTTTCATTAAAATTTTAATTTTCAAC ATCATTTTTGCAGACCCAATTCATGCTGGACCAATTATCTGATCTTCAAAATAAGGTACAGAGTGTGTGCATTAACTAGGAGAATAACACAACTTCATGT GTGCTGTGCCTAACACTTCTAAGCTATTACTTTGATACAGGAGCAAATGCTGGTAGAAACAAATAGAGGTTTGGCCATGAAGGTAACATTATACACAAAA AAGATTAGCAACCTTGCAACTCTTGCTTCTCTTTAGCTGCATAAATTTTATACAAAATCTAGTCTCATTTAGTGGAGTCTCGGGAGGTAGATGTATGGAG CTTTACTCCCGTAATATAAGCGGAGAAGTTGTTCAAATCCTATATACAATCTCTCCCCTTGCAAGGGTAAAGTTATATATACATCTATCCTTCCAAGATC CTATTAAGCTGGAGCCTCGTATAAGTCGGACCCTTGTATACTGGACCGTCTTTTTTTTATATATATACATCTGACCTTGTGTGAGAACTTTTGGTAGTTA TATTTATCCTACAAATGTTTAAGAAAACAACCTTGTATCTCTATATTCTTGTCCAACCTGATTGGAATTGCATTATTGAAAGTTAAATTTTTCTACAAAT CCTTTATTTTCTCCACATTCAACACCAGTATATGTATATGTATTAATATTATTGTCATATTTTCCCTGTGCCATAATATGATTGTGCACTTGCCTTTGTA CTTATGGCATGGAAATACTATTCTGCATTGTTTAATGTATTATTCTTCCTTTCAAATTAAGCTCTTTTGGTAATAACTTGATGAATGAAAAATGTTTATT GGGTAGCTGGAAGAAATCAATTCAAGAAACCAATACAGACAATGGGATGATGGTGAACAAAGTATGCAATATGATACACAGAATGCTCACTCTCAAGGCT TCTTCCAACCTTTGGAATGCAATCCTACATTGCAGATAGGTACTGATTACAGGTATCATCATGTAGCCCAAGATCAGCTAAATGCAACAACTCAAGCTCA ACAAGTGAATGGATTTATACCTGGATGGATGCTTTGAACTAAGCTCAGCATTTTGCTACCTACATAATGATAAAAGCCTAATATGATTGTTAATGTTGGC AATGAATGTGTAAATGCTACATTTGCTTCTGTTATTTGTTTTGGTATAAAAACAGCAGTGACTGACTTAAAACTATTAAAACTTTAGCCATTGTGATATG GCATTGGCATGTAAGAAGTTTATTGTATTTTGAATAACTTTTCCATTAGAACTTAAGCATGGTTTTCTCATCAAGATTGCATTTTTTGCAATGTTCCTAC ATCATCTTTCATTGTTTAGTTCTTATTGATTCTTAAATAAAAGTAATACAAATGAACGGTAGATGATACATTGGCTA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_181685; |
Additional information | - |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_527879
Blastp | - |
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Blastx | Developmental protein SEPALLATA 2 from Arabidopsis with 73.63% of identity |
Eggnog | Transcription factor(COG5068) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT3G02310) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019426553.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |