Ll_transcript_529209

• Id Trinity: TRINITY_DN51025_c0_g1_i11
• Name Transcript: Ll_transcript_529209
• Sequence: CGAACGGCTCCTATTCACGCCCTCTCCAGAAACCCACAACCTCTAACCGTGGTTACTTTCTAACCACACCATTCACAACATAAAACTCTTATCCTTTCTC TCTCCTTCATTTCCCTCACACTCTCTCTTCTTTCTATAATGGTCTCTCAGATCTAACACTATCATTAGTTCATTACCTCTAAACGACATCGTTTCACCAC CGAATCAACCAGCATGCAGAAAGTAGCGTATTCGTTCCCAGAAGAAGTTCTAGAACACGTGTTCTCCTTCATTCACTGCGACAAGGACCGCAACGCAATC TCACTAGTGTGCAAATCATGGTACGAGATCGAACGGTGGTGCCGGAAGAGGGTTTTCATCGGAAACTGCTACGCCGTGAGTCCTACGACGTTGATTAAAA GGTTCCCGGAAGTTAGATCTATAGAACTGAAGGGGAAACCACACTTTGCGGATTTCAATTTGGTTCCTGAAGGTTGGGGTGGTTATGTTTGTCACTGGAT CGATGCTATGGCAAGTGGATATCCATGGCTTGAAGAGATCAGGCTCAAGAGGATGGTTGTAACGGATGAAAGTTTGGAACTTGTTGCCAAATCGTTTAAG AATTTCAAGGTTTTGGTTCTCACTTCGTGTGAGGGTTTCACTAATCATGGACTTGCTGCCATTGCTTCAAATTGCAGGTTAATCTTTTTTTAAGTTTTAA ATTTATTAGTGACGGAGTTCCGTTTGATCCATGTAGCCGACCCCATGTCTTGTTTCTTCGATAAAAGTTACAGATGTTAGTCAGACTAAAGATTTGATTT TTATGAGTAATTATTGTCAGATTTGGCTTATTTATTTTCGTTATGAACTTATGATGGTGATGATTCGGTCGTTTTCCTTTTGATAATGATGCTGTAATGA AAACTAAGAAAATTTGTTTTCATTTTTATCTTTCATATAGAAAGTACAATAAGTGAAAAAGGTGGTTTTTTTGTAGTAATTATTACTGAAATTATATTAA TGTGTAAGGAAAACAGGTAACAAATCCAACAGCTGTAAATGTTTTGTTTTTTTTGCATTTTATTCCACATTCTCTGGGCTTTAGTTTTGATTGAAAAATT TAAAATAGAAATTGTATTGTATGTGGTGTAGTTTGAGTTATTCTGGCATGGTGGATTCGACATGCTTGCTGTTATGTTCAGTTATTGCTTTGGAGTTTAG ATGTTACCTTTCTTTCCGAGTCAAATCATTATTGGAAATGTTTTGCAATGTGTATGTTTTTCTTTATTTTGGTATTATTTAATAAAATAATAAGTCTGAA ACTTTGATACCTTGAAACATAAAAAATTGTTTTTGGTTGTGTATGATTTGATTCTGGGGTTTTTTGTTTTTGAAAACTCGAAATGAAATGCTTTATGGTG ATTTTTATATGTTTATAATGTTCGAAGGTTTGTAATTTCACTCACCCCCCTTCTAGTTGTTCAAGTTTGGGTAGTTTACATGATTAAAATTTGAACTTTC CTAATATTTCTTGTTTGATTTCACTGTGATTTGTCTCCCCCCTATTCGTAGTGGGAAACTTGTGGGATTGTATTGAATTGTACCCAGTGTGGTTCAATTT ACTCTATTATCTATTAAGTTTAATGCAAATCTTGAGGATCCCCATGTCTGAATTGAAGTGTCTTGAAACTGTCATTGATAAATCCAGTGTCTTTGAATGC ATTACAGGGGTTTGAGGATGTTAGACTTGCAGGAGAGTGGAGATGAGGACCTCAATGGGAATTGGCTTAGTCATTTTCCTGATTCATACACATCATTAGT GTCACTTAACATCTCTTGCCTAAGCAATGAGGTGAGTTTGTCTGCACTAGAGCGCCTGCTTGGTAGGTGTCCCAATCTGCAGTCTCTACGCCTGAATCGC CCGGTGCCCCTTGATAGGCTAGCCAACCTTCTACGTTGGTGTCCTCAGCTAGTGGAGTTAGGCACAGGAGTCTGCTCGACTGAGATGCGTCCAGAGGTCT TTGCAAACCTGGCTGAAGCATTTTCTAGGTGCAGGCAATTGAAGTGCTTGTCTGGCTTTTGGGATATTCTCCCAACCTACCTTGCAGCTGTTTATCCTAT CTGTTCCAGGCTAACATCATTAAACTTGAGTTATGCTATTCTGCAAAGCTCTGATCTTATCAAGCTTGTCAGTCAATGTCCGAATTTGACGCGGTTATGG GTGCTAGATCATATAGAAGATGCTGGCCTTGATGCCCTTGCTGCGTCATGCAAGGATCTAAATGAGTTGAGGGTGTTTCCATCTGACCCTTTTGGGTTAG AACCAAATGTTGTATTGACAGAACGGGGCCTTGTTTCTGTGTCTGAAGGCTGCCCAAAGCTCCAGTCAGTTCTATATTTTTGTCGTCAAATGTCTAATGC TGCCTTACATACAATTGCCAGGAACAGGCCTAATATGACTCGTTTTCGCCTATGCATTATTGAGCCTCGAACTCCAGATTATCTTACCCTTCAACCTCTG GATTCTGGTTTTGGAGCTATTGTAGAGCATTGCAAGGATCTTCAGCGCCTGTCACTTTCTGGTCTTCTTACTGACCGTGTTTTCGAGTACATTGGGACTT ATGCGAAGAAGCTGGAGATGCTATCTGTGGCTTTTGCTGGAGACAGTGATTTGGGACTCCATCATGTGCTGTCCGGTTGTGACAATCTTAGGAAGCTGGA GATCAGGGACTGCCCCTTTGGTGACAAGGCCCTTTTGGCCAATGCTGCAAAGCTGGAGACAATGCGATCCCTTTGGATGTCCTCTTGTTCTGTGAGTTAT GGAGCATGCAAGCTTCTGGGTCAGAAAATGCCAAGACTTAATGTAGAAGTCATTGATGAAAGAGGACCTCCAGATTCAAGGCCAGACACTTGTCCCGTTG AGAAGCTTTATATATACAGGACTCTTGCCGGGCCAAGATCGGACATGCCCGGTTTTGTGTGGACAATGAAAGATGATTCTCCATCAAGGCTTGAGTGATC ACCGGTCGGAGAATGGTTGGTGTTTGAGCTAGGCACAGGAGTGTAGACAGAAGGCTTGAGCTACTTACCAAATTATTGAAGAGACTAAAACTATGTTGTT TGTTTATTAGATATAGTTGTTACATTATTTTTCCTACTAAAATATTTTCAGACTTAAATTTAATTGCATGTTACCATTTGTCATTGTTAGCCTTCCCAAT GAATAATATTTGATATTGTAATGAAACTGTGATGCATTTATGTCAAAGTTCCGAACTTTTTCCTGGTTGATTCAAGGACAGTAGGAGTGATTTAACAATT GGGATGAAAA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_181806;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_529209

FPKM

• PAB: 5.4
• PNAB: 7.8
• PS1: 5.8
• PS2: 9.2
• PS3: 8.5
• PW1: 7
• PW2: 5.8
• PW3: 5.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_529209

• Blastp: Protein TRANSPORT INHIBITOR RESPONSE 1 from Arabidopsis with 77.16% of identity
• Blastx: Protein TRANSPORT INHIBITOR RESPONSE 1 from Arabidopsis with 77.16% of identity
• Eggnog: F-box and leucine-rich repeat protein(ENOG410XQ54)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G62980)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019421520.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;