Ll_transcript_529213

Id TrinityTRINITY_DN51025_c0_g1_i15
Name TranscriptLl_transcript_529213
SequenceATTCATTCCTCTCCACGTGTCACCGCCATAGCCAATATATACAGAAAAAAGAAAAAGCGATTTAAAAATAACCCAAACCACACTCTTTAACCATGGTTAA TTTCTAACCACACCAACTTCATCATAAAAATTCTATCCTCTCTCTCCTCTTACTATATCTCAGATCTAACATCACCAGCACCACCTCTTCAGAAAACGAC GTCGTTTCATCGTTGAAATCGCAACCATGCAGAAAATGGCGTATTCGTTCCCAGAGGAAGTTCTAGAGCACGTGTTCTCCTTCATCCACTGCAACAAGGA TCGAAGCTCAATCTCCACGGTGTGCAAATCATGGTACGAAATCGAACGGTGGTGCAGGAAGAACGTTTTCATCGGTAACTGCTACTCCGTGAGTCCTACG GTGGTGATTAACCGCTTCCCGGAGGTTAGATCCATAGAGCTGAAAGGGAAACCGCATTTCGCGGATTTCAATTTGGTACCTGAGGGTTGGGGCGGTTATG TTTGTCCTTGGATCGAAGCTATGGCGTGTGGTTACCCTTGGCTTGAAGAGATCAAGCTTAAGAGGATGGTTGTAACGGATGAGAGCTTGGAACTTATTGC GAAATCGTTTAAGAATTTCAAGGCTTTGGTTCTCACTTCGTGTGAGGGTTTCACTAATGTTGGACTTGCTGCAATTGCTGCTAATTGCAGGTCATTTTTT GATTTCGTGCACTGAGTCGCCCAGTTATAAAATGGTTTTTGTTTGTTACTATATTAGGTTTTTACTAGCTTAATATGGTTAGATTTGGTATAACTATTTA TCTTTTGATAAATTAATGGTCTAATGAAATGTGATACTGGCGATTGGTTTGTTTTTGTGTTTTATTTTGTTGTGGTGATAATGATGGTGAAACCGTGAAA TGAAGCTAAGAAAATGTGCTTTCATGTTTTCTTTCACATAGAAAGTAAAATAAGTGAAAAAGATGGTTTTTTTAAATGTTACTGAAATTATATTACAAAT TTGAAATCAAAACAAGAAAAGTCCAACGTTAATAAATATTTTTTCCGTATTATTTCCTTTATTTTGGGCTTTAATTTTGGTGGAAGGATTTAAAATTGAA GTTGTATTATGTGGTATACTTTATTTGTGAGTTATTCTGGGTAGTGGATTCGACAGACTTGCTGTTATGTTCAGCTAATTTTTTCCAGGTCTATGGTACT GGATCAAAGGGACTAACCACTTACCAATGGATTGTGGTTATGCTTCGGAGTTTAGATATCTTCTTTCTTACTAAATCAAGCATTATTGGCCACCTTTTGA TGTGTATGTATGTTTTTCATTATTTAATAAAATAAAAAAAATTGACACTTCAATACCTTGAAACATACTACTAAATCCTTTGATTATTTGTCTTGGTTGT TTATGATTTGATTTTAGGGGGTTAGATGTATATTTGGCAATGTTTTGGTTGTTGAAATAATGGAGTGTTCTTAATATTTCTTGTCTGATTTCACTCTGAG CTCCATTTCTATTTTCCTCCTATTCATCATGGGAAACTTGCATGAATGATGTTGACTTTGGCTTGGTGTCGTTCAATTTACTGTATTCTATATTTAGTAA AATAAATCTTGAGGATCCCTATGTCTGAACTGAAGTGTCTTATAACTGTTATTGATAAATCCACTGTCTGTGAATACACTGTAGGGGTTTGAGGATGTTG GACTTGCATGAGAGTGGAGACGAGGACCTCAATGGGAATTGGCTAAGCCATTTTCCTGATTCATACAAGTCATTAGTGTCACTTAACATCTCTTGCTTAG GCAATGAGGTGAGTTTGCCTGCACTAGAGCGCCTCCTTGCTAGGTGTCCCAATCTGCAGACCCTCCGACTGAATCGCGCGGTGCCCCTTGATAGGCTAGC TAACCTACTTCGTCGGTGTCCTCAGCTGGTAGAATTAGGTACAGGAGTCTACTCCACTGAGATGCGTCCAGAGGTTTTTGCAAACCTAACTGAAGCATTT TCTGGGTGCCGGCAATTGAAGTGCTTGTCTGGCTTTTGGGATGTGCTCCCAACCTATCTTGCAGCTGTTTATCCTATCTGCTCCAGGATAACATCATTAA ACTTGAGTTATGCTATCCTGCAAAGCTCTGATCTTATCAAGCTTGTCAGTCAATGCCCTAGTTTGACGCGATTATGGGTACTAGATTATATAGAAGATGC TGGCCTTGATGCTCTTGCTGCCTCGTGCAAGGATCTAAACGAGTTGAGGGTGTTTCCATCTGACCCATTTGGGTTAGAACCAAATGTTGCATTGACAGAA CAAGGCCTTGTTTCCGTGTCTGAAGGCTGCCCAAAGCTCCAGTCTGTTCTATACTTTTGCCGTCAAATGTCTAATGCAGCTCTACATACAATTGCCCGGA ACAGGCCTAATATGACTCGTTTTCGCCTATGTATTATTGAGCCTCGAACTCCAGATTATCTTACCCTTCAACCTCTGGATTCTGGTTTTGGGGCTATTGT AGAGCATTGCAAGGATCTTCAGCGCCTATCGCTTTCTGGTCTACTTACTGATCGTGTTTTCGAGTACATTGGGACTTATGCGAAGAAGCTGGAGATGCTA TCTGTGGCTTTTGCTGGAGAAAGTGATTTGGGGCTCCATCATGTGCTGTCTGGTTGTGACAATCTTCGGAAGCTGGAGATCAGGGACTGTCCCTTTGGTG ATAAGGCCCTTTTGGCCAATGCTGCAAAGCTGGAGACAATGCGATCCCTTTGGATGTCCTCTTGCTCCGTGAGTTATGGAGCATGCAAGCTGCTGGGTCA GAAAATGCCAAGACTTAATGTTGAAGTCATTGATGAAAGAGGACCTCCAGATTCAAGGCCAGACACTTGTCCCGTTGAGAAGCTTTATATATACAGGACT ATTGCCGGGCCAAGATCGGACATGCCTGGTTTTGTCTGGACAATGAAAGATGATTCTTCACCAAGGCTTGAGTGATCACCTTCTGATTTAGCGACAAAAT TTATCAGCATTTTGATGTGGGAAATTGTTATTGGCAGGTGCATGCTCAGGTTACTATCAGCATTCTGTGGTTGCACTCATGGTTCGTGTTTGAGCTACGC AAAGGAGTGTGTACACACAACCGAAACAAGGCTTGAGCTTCGCCATTCTTTTACTCTTTGGCGGAGCATACCTATTTACGGATTAATAAAGAAACTGAAA CTATGTTGTTGTGTGTTTCTCAGATACTAATACACAGCTACTACAACTGTTCTATTATTTTTCATACTAAAATATTTGCTGACTTAAATTTAATTGCATA TTACCTTTGTCTCCTGTACCTCTATCTTGGACACATTTGTCATTGTTAACCTTCTCAGTGAATATTTCATATTGTAATGCAACTATGATGCATTTATGTC ATTGTACCTGGCTTTCTGTATTTTATTCAAGTATAGTCTTGGAGCTGATTTAACAATTAAGATGAGCCATCAATTCCCAATGCGTGTGAACCCAATAATG ATTCTCATGTTGAAAAGGGTTTTGACATTCAATGAAATAGTTTTGG BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_181806; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_529213

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_529213

BlastpProtein TRANSPORT INHIBITOR RESPONSE 1 from Arabidopsis with 78.07% of identity
BlastxProtein TRANSPORT INHIBITOR RESPONSE 1 from Arabidopsis with 77.67% of identity
EggnogF-box and leucine-rich repeat protein(ENOG410XQ54)
KeggLink to kegg annotations (AT3G62980)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019421520.1)
Pfam-
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;