Ll_transcript_530150

• Id Trinity: TRINITY_DN51069_c3_g1_i4
• Name Transcript: Ll_transcript_530150
• Sequence: CATATCGTCAAGCGCTTGCGAGTAAGTTTTTAGTTTTCCAAATTTATGATGGTGGATGGATTTGCGATTCCTCTGACAAAATAATTGTGTTCTAAATTGC TAATTTACTATTCATTCCTGTGATTTCTTTTATTTTGTGTTTTGATGATTGGATCGTTTATTTCCTTGATATATGCCACTTACAAATGTTGCTTAAACTA TTTCCCTACTCCAAAATCGTTACATCACTTAATTGTTTGATGTTCAGTTTCTACACTTTTAAGGATGTAGTTTGGTGTCTAAAGATTTATGGTGGTTATG ATTTTTTTCTCTTGTTAGACTTCTAGTGGAGGAGTGTGGTGGGGGTGGGATTTCATGAATTGTACTGGAGAAGGAATCCTTCTATTAGGGGAGTTAAGTT GATAAAGTTCAAAAGTTTGAATCATTACAAAGGATGAGTTCAGAATCAAATTTTGGGTTTCATTATTTTGTATGTAGTATGTGGAGTTCTCATGGCTCAG GTTCAGACATTACTGACTGAAATCCTGATTTCTTGGGGTTGAATACATGTTTTGATAAGATCTTATGACATGGATTGCATGCTTCTTATTCAACTTGTAG ATCATTATATTCTGTCTAAAGGGTTATTTTAAAGCCCCAGATATGATGATTAATAATTTCAATTTTTATTGAGCCTAGTTAATAATTAGAACACATAACA AATCCTAAACAATGTAGACAACAAAGTTATAGTATTAGAATTAGAATAAAATAATGGCAAAAGGTTAGGATATCTAAAAAAATACTCACAGCAATACAGC ATAGCATATCTTAAAGATTTGCTGACTTCTGTGTAAATGTGTTATGGTATGCCTCATAGATGATTTTATGCCACAAATAATTTGAACATGCATCCTCCAA ATCTTGACATATGAGGAAAAGGGCCTGTACCATTTCTTCAAGACACTAAGGAAAAACGTATGTTATATTCCCTTATATTGCAGGTCTCCAGTGAAACTCA TTAAGGACTTTTAGGCTTTCTCAAGATCTGTATATAGCTATTGTACAAAGATCCTGGATTTTACTGTGGTTGTGGTAACACTGTGAGCATCCACTGCAGA CATAAAATTAGTAGTCACTCCTAGGCAGTATCCAAACCAGTTTAGTAGTCACTCCTTTACATCTGTACTATAACTTGCTTTTATAGCTTCATGGTGTGAC TTATGAACTTGAATCTCTGGATAACCCCTGCATTAGTAAAGAAAACATACCAAGTTTTTATTCTCCATTCATCAGGCATATTTGTTTTTCATAGGAGTTT TTTTAAAAGCTTCACAAGTAAGCTATTCATTCTTTTTCAATGCATTCCATACATCAATGGAGGCCTAATTGCCCTTTTACTTCATATTCTTGAGGTAGTC CTTCATCTCATCTTTACAAATCCTTTCATAGTATGCAACATTGCTTTTTGAACAATTTATGTCACTAAAAATCAAATCCATCATTTGATGCTTCATTGAT AAGTTCACTGAAATTGCTCCTCCACCTTGTTCTTAATTTGACCAATATCTTTTTTTCTACACCTTTTCATACACTTAATTTAATTTTGGACCTTTGGGTG TGTTTGATGCATATTGAAAGATATCATAGGACAATTTTTGTGTTGTTACTATTTATTTTATGACTAATACACAATACTAGAGGGTGAACAACGGTAAGGT TGCTGCTTAGTGACCCACAGGTCAGGTTCAAATGCTGAATACAACTTCTCTGCTTCTGGGGGTAAGTTTGCATATATCTACCCTCCCCAGATCAACTAAG TGGGAATTTTGTGCACTAAGATGCCCTTTTTACTAATAAATAAGACAAACTGTAATGCTTCAGTATTTGATATGCTAATTATGCTTAAGTACTGGACGGA TAAAGCAAATTTCAGAAAATTTTCTATATTGTGTATTGTTTTCTATGCACTAGTCAAGTGGTGAGGATTTTTGGTCTTTTTCTTTTGTAGAACTGTAGAC AAATTGTGACTTGATTAAGTCGGTGATAAACAAGAGTTGTGTTGTTTACTTAGATTAGTTTAAAAATCAACCAAAGTACGATTATTATTTTGCAGTGTAT TTATTTTTTGTCAAATCAAATGCACACTTAGTTTTTCTTGCTCATATTGTTACATGGCCAACTTATATACAGTGGTTCCAAAATCATGTCCTTTTCTTTA CATTATGTTGTTCCAGATGCATCGAAAAACGGTGTTGCACAAGAGACAATGCAAAATACTCTCCGAAGAGCTAGCAAAGTCATGACAGAGCAAGAGGCTC GGCAGATTCTTGGTGTGACTGAGGGAACTCCTTGGGAAGAGATTATGAAGGTTAGTCTATCATCTGTGTTTTAGTTATGACCCATTTGTTGTTATATTAC TTGCTCAAACATAACTTCTTCAATGCAGAAATATAACTCTCTGTTTGAGAATAATGCAAAGAGTGGGAGTTTTTATATCCAGTCCAAAGTTCATCGTGCC AAGGAATGTTTAGAGAGTCTCCATCAAGCCAAGGATCAAGGTGCTACCCCTGGTTGAGAGCTTAAGCTTTGTCCCTTCTGGTAAGTTATAACTCGTGTAG TCATTTTGGCTAGATGGGTATCTAAATTGATCCTAGTTGTACATTATTTCTGCAATCAAAAGTTTTAGGAAACCAAAATTTCTACTAAGATGATTTTTAT TTTGTAAATTGTTAGTTCTGGTATGATGGCCAATAATGAAAGGCAATATAAATAACGGAAGCTATATTATTTATTGATTTTGTATTTTGTTGGTCCATGA AACTATATTATTACCTCATGATCATGATCAAAATGAGAAAGGCATAATCTTGATGTGTTTTGAAGGAAATATTTCTTGAACTGGATTTATTTTTGTAGTA AGATTTTATATGTTAGTGGTGGC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_182097;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_530150

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 0.4
• PS1: 0.2
• PS2: 0.3
• PS3: 0.1
• PW1: 0.3
• PW2: 0.5
• PW3: 0.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_530150

• Blastp: -
• Blastx: Mitochondrial import inner membrane translocase subunit PAM16 like 2 from Arabidopsis with 48.55% of identity
• Eggnog: mitochondrial import inner membrane translocase, subunit(ENOG411286G)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT3G59280)
• CantataDB: Link to cantataDB annotations (CNT0002650)
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019451334.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;