Id Trinity | TRINITY_DN51080_c0_g2_i11 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_530007 |
Sequence | ATTTCTGTTCCATTTTATATTCTTATCCAATTAAAAAATCTGATTTTAATAAAAAGAAAAATTATAATAACAAAAGTTAATAATTTTATATTATTTTAGG AAGTTTAATTGATTAGTTAGATGTAGAGATTATTTTGTTGGACATGATCTATCCAGAAAGTAGAATGTTATGTGACTGGTTTGAAGTTGACTAATAGAAT TAATTTGACGAATGATATTTGGTTTACTCTGCTAGTTTGCTATATTCATCATGCTTTCCTCACAAACTCACCTTCCTTTCAATCACTGAATCTGGACGTT ACATAATGCATCCTTCCATTTTATAAGTAGTCACGCATTACAGCCTCCCACTACTACTCTCAAATACAAAATACAACAATTAACTAAATACTTTCTTTCT TTTTTCCTCTCTCTCAAACCAATACGACACACACTCTTCTTCCTTTTCATTTTTCTCTCCACCTTCCTCTGTCGTTAAAACGGTGCGTCGTTTAGTGTCT TCACATGCTTCTTTTTCTGTTTTATCCAAAGTTTAACGTTGTTTTATGATTCGCGTGGTTTCTTTCTTATTTTCTTATTAGTCCTTGATTATGGATTGCA GATCCGTGTTTTTGGTTCAGTTTGAGTAAAACTTTTTGTCCAAGTTATTTATTTATGCTTTGAGAATCTTTGTTATAGTTTCTGCTTTGAATTACTATTT TTATTGATAGGAGTAATGGATCTGATGAGAATTTTGCTATTCCGATTAATTTAGATGGATTTTGAACTGTGTTTGAAGTTATTCTTAGTTTTCAGTGACT CTATATTGCGAATTTCAATGTTGAAGTCCTTGCTTGTTTCATTTGTTTCCTTTTTTGACCAAAAATGGAGGGGGGAAAATGAAGGAGCTTCTCATAAGAA ACTAATAATCTATTTTTCATAACGGGGATATCAATTTACTCCAAGAGTAACAAGAATAAGTTTGAAAGACTTACTCCTCATGTATTGATGGCTAAGATGA GGAGTAAGTCTAAAAAGACTTGATCCTCACCCTTTCATAACTTTGATTATTATCTGCTGCAGATGTTAAGCCTCTCAATGGAGATACCAATTAAATGTTG ATGAGATTTCGTTATTTTTATTTTAAATTTTTTCTAATAGATTGTGGGAAGGGTTTAGGAGACTGGATTTGCTAGATTTAGGAAATAGTAAGGTAATGTT TGGTGCAGGGATAGAACAAAAATGGAACAAGTTGTTATGTCATGTTTTATCTGGTCACACTCTTTTAGAGTTTTAGTGGAACAAAAATGTTCCACTTTTT AACACTTTTATACTTATAAACTACACCAAACGTTGGTAGAATCCATATGTTCTGTTTCTTCCTGGTACCAAATGCTACCTTTGAGTTAAAACTCGTGGTT CTTGTTGTTTTCCTTTATATATAAAGTGTCCTTGTATATGATATCTAAACATATGTGGCCTACTTGGTTGTGATAGTTTATTTACCCCTGCAAAGTATGG TCTAATTTTTTTAACCCAGTTGTTTAAAATACCCCTTTTCTATGGACTAATGAGCATTCTAGTATATTTGTAGGAATTTGTGCTTCACCTGACAATATAT TTTTCCATGCAGATAGAGAGGTGAGCTTTTTAAATTAGCGAATACGGTTTACTGCATGCAAGAAGATCAGTGAAAAATCCAGCTTGTGTGTTGGAAACTC TAGTTCAATATGTCTTCTGAAACCAAGGGTGATAGGAAGGCTACCCTTGATGCAGCATCATGGTTTTTCAATGTAGTGACATCTGTAGGGATAATCCTTG TGAACAAAGCCCTAATGGCTACATACGGTTTCACTTTTGGTATGATCTCATAACCACTTTTTAAATTTTCTTACCCCCTTATCAATTTTTGCTTGGTCAC CATGCTTCATTAGTAATTTAAAGCAGGCGATATTTCTCATATGTTATTAGGATAAACTACTAATTGTGCTTTTGTGGTTTAACATATGACTGTTCTTGTT TTCTGAGTGTGGAAATTTTTGTATCTAGTGCTTGTTATAGACTTGATGTTTCATGTGTATATTTCACTTGATATTATCAGTTAGCTTAATTTAGAATTCA GATCATACAACTTTAGTAGCTTGCCCTGGCTACTCTTGGGGATGATTTTCATTTGAGCTAACTATATAAATGACCTGATAGACTAGGATAGCATGAAAAA GGGATGGAAAATGATCATAAAGTGGCATTGGATTTGGCATGGCATTTGATTACAAACTGTGTTATAGAGACTTTGAATAGTTTACTCCTCATTTTGATTT CATTCTCTCAGCACAAACGAAACTACTGCTTTAAGTTAAAATGTTTTGATTGTCTTCTAAGTTTATTGATGTTGTGAAACACAAACTTTTCTTAGTATTT GAAAAAAAAACCCTTTATTAATCCTGTTGGCCTTTGAATAGAGGAAATTTGTACTGATGATGCTTGTGACCGGCCCATATAGTGAAAAAGACACATAGAT GGAAATCTTAAGAAAAGGGTAAATGAATGGTTTTTTTCTAAGGCTACAACTTTGCATGAGACCTGACATTATTATGCAGCTACAACTTTAACTGGAATGC ATTTTGCCACAACAACCTTGTTGACTACTATTCTTAAGTCGTTGGGGTATATCCAGAGCTCCCATATTCCATTACATGATATCATCAAATTTGTGTTATT CGCAAATTTCTCCATTGTCGGAATGAATGTCAGTTTAATGTGGAATTCTGTCGGTTTCTATCAGGTATATTCAGGCTTATTTTCTCACTTTTTAAAAAAA CAAACCTAGGCTTTTGATGAACTCTCCATTTGACAGAGATAAAAATTAACAATGATTCTTTCCTTTGAATGAATTTGTCAGATTGCTAAGCTGAGTATGA TTCCAGTATCTTGTTTCCTGGAAGTCGTCTTGGACAATGTGAGATATTCAAGGGACACAAAACTTAGCATTATTTTGGTTCTGCTTGGTGTTTCTGTCTG TACAGTCACTGATGTCAGTGTCAACACTAAGGGTTTCATAGCTGCTGCAATAGCAGTTTGGAGCACGGCACTGCAGCAGTATTATGTTCATTTTCTTCAG AGGAAGTATTCTGTTGGATCATTTAACTTGTTGGGCCACACTGCACCAGCACAGGCAGCAAGTTTACTGCTAGTAGGCCCATTTATGGACTATTGGTTGA CAAACAAACGAGTTGATGCCTACAACTATGGTTTGACATCTATTTTGTTCATCATTCTGTCATGCTCCATCGCAGTAGGGACAAACCTTAGCCAGTTCAT CTGCATTGGTAGGTTTACGGCGGTGACATTCCAAGTCCTTGGCCATATGAAGACTATTTTGGTCCTATTCTTAGGATTCATTTTCTTTGGAAAAGAAGGT CTCAATCTGCAAGTAGTTCTAGGCATGCTCATTGCAATAATGGGAATGGTTTGGTATGGCAACGCATCTTCTAAGCCCGGAGGGAAAGAGCGTCGTAGCT TTTCCATTCCAACCACCAAAACACCAGATTATAGTGCAGTACCTGTGTCAGCCGAACCAGATGAGAAGGTATAGACAATAGTAGAAATTCACAAGAAGAA CAAGTGGTGGAACTTTGGGTGAAGTTCATATTAGCTGATACATTTTATTTACACCCAGAGGGAATCCCTGATTATTTATAGATCATAGTGATTTATCTTT GCTTTTGCATTTGAGTTGTTAGTGGGGGAAGGGAAAGGACAACACATTGTTAAAGGGGGAAATCTACATAATGTTCCATCCTGTTTTGGTAATTGTGTTC CATTTTTCATAATAGAAAATCTTGCAGTTATTTTGAGTCTGTTTGAACGTTGGGATAAGAGTTGAATAAGAATTGAAACACAATTTTAATTTCAATTGGA TAATGTTTAGAGAAGATGAAAATTGAGGTATAGAATTAAAATTTCAAAAGAATTGAGATTGTTTTGGCACATTGGTCATTGAAAACTGCTGGTCATGTTC AGTGGACACCATTGTTGTACACTGCCATCAATGGTTGTTATAGG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_182195; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_530007
Blastp | UDP-rhamnose/UDP-galactose transporter 4 from Arabidopsis with 82.67% of identity |
---|---|
Blastx | UDP-rhamnose/UDP-galactose transporter 4 from Arabidopsis with 68.33% of identity |
Eggnog | solute carrier family 35 member(ENOG410XP1S) |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019434998.1) |
Pfam | Triose-phosphate Transporter family (PF03151.15) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |