Id Trinity | TRINITY_DN51080_c0_g2_i8 |
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Name Transcript | Ll_transcript_530004 |
Sequence | GTTGAATATTATGACATTCCATTTACTCCGATGTTGTTTCTCACAAACTCATTCTTTTTTTATCATTGAATCTGAACGTTACATAAAGCACTACCTCTTC CATTTATATAAGTATTCACACATTACAACAACAAAAACAGAGAGAAAGAAAGAAGCAAAGAACAAAAAAACCGTTAAGCTCTTTTCTTCTTTGTTTTCTC TCTATTGCTCAAACGGTGCGTCATTTAGTACACTCACATGTTTGTTTCGTTTATCTTCTAATTGAATCAAAATTGTCGTCGTTTTATGATTCCTATTACT GCAGATCCATGTTTTAGATTCAATTTGAGCATAAGTTATTTATTTCTGCTATGAGAATTGATTGTTACAATTTCTGCTCTGAATCATTGTATTAATCGAT AGGAGTAATGGATCTGATAGGAGTTTGAACTGTGTTTGAGGGTTTTTAGGTTATGGTTGAAGTTAATCATAGTTTTAGTGACTCTATCATGAATTTCAAT GCTCATGTCTATGTTTGTTTCCTCTTTTTTTGTTTCCTTTTGGAAATTTTGAACAAAAATGAAAAAAAAAATGAAAGGGTTTCTCATAAAAAACCCAAAA ACTACTATTTTTAGCAATGATTATTCTCTGCTGCAGATGTTAACTTTGTCAATCGAGATACCAATTAACTGTGGATAATATTTCATTATTTTTATTATAA GATTTTGCTATTAGATTGTAGGAAAGGTTTTAGTGGAACAATAATTTTCCAACTTGTTACACATTACTAATTATAAACTACACCAAACATAAGATATAAC CCATATGCTATGTTCCTTCCTGTTACTGAACTCTATCTTTGAGTTACACCTAATTTGTTCTTCTTGTTTTCCTTTGTATATAAAGTCCTTGTATATGAAA TATAAACATGTGTGGTCTACTTGGTTGTGATAATTTATTCGCTGTCCAAAGTTTGGTCGAATTGTATTGACTAAGTTCTTTAAAACCCCTTTTTCTCCGG TGGGATACTGAGTTTTTTAGTATATTTGTAGGATTTGTGTTTCACCTGACAACTTATTTTTCAATGCAGATAGGGTGGTGCGCCTGTTAAGGTATTGATA CGATCAATTGGATGCAAGCAGATCAGTGAAAAATCTAGTTTGTATATTGAAAACTCTAGTTCAATATGTCTTCTGAAACCAAGGGTGATAGGAAGGCTAC CCTTGATGCAGCATCATGGTTTTTCAATGTAGTGACATCTGTAGGGATAATCCTTGTGAACAAAGCCCTAATGGCTACATACGGTTTCACTTTTGGTATG ATCTCATAACCACTTTTTAAATTTTCTTACCCCCTTATCAATTTTTGCTTGGTCACCATGCTTCATTAGTAATTTAAAGCAGGCGATATTTCTCATATGT TATTAGGATAAACTACTAATTGTGCTTTTGTGGTTTAACATATGACTGTTCTTGTTTTCTGAGTGTGGAAATTTTTGTATCTAGTGCTTGTTATAGACTT GATGTTTCATGTGTATATTTCACTTGATATTATCAGTTAGCTTAATTTAGAATTCAGATCATACAACTTTAGTAGCTTGCCCTGGCTACTCTTGGGGATG ATTTTCATTTGAGCTAACTATATAAATGACCTGATAGACTAGGATAGCATGAAAAAGGGATGGAAAATGATCATAAAGTGGCATTGGATTTGGCATGGCA TTTGATTACAAACTGTGTTATAGAGACTTTGAATAGTTTACTCCTCATTTTGATTTCATTCTCTCAGCACAAACGAAACTACTGCTTTAAGTTAAAATGT TTTGATTGTCTTCTAAGTTTATTGATGTTGTGAAACACAAACTTTTCTTAGTATTTGAAAAAAAAACCCTTTATTAATCCTGTTGGCCTTTGAATAGAGG AAATTTGTACTGATGATGCTTGTGACCGGCCCATATAGTGAAAAAGACACATAGATGGAAATCTTAAGAAAAGGGTAAATGAATGGTTTTTTTCTAAGGC TACAACTTTGCATGAGACCTGACATTATTATGCAGCTACAACTTTAACTGGAATGCATTTTGCCACAACAACCTTGTTGACTACTATTCTTAAGTCGTTG GGGTATATCCAGAGCTCCCATATTCCATTACATGATATCATCAAATTTGTGTTATTCGCAAATTTCTCCATTGTCGGAATGAATGTCAGTTTAATGTGGA ATTCTGTCGGTTTCTATCAGATTGCTAAGCTGAGTATGATTCCAGTATCTTGTTTCCTGGAAGTTGTCTTGGACAATGTGAGATATTCAAGGGACACAAA ACTTAGCATCACTTTGGTTCTGCTCGGTGTTGCAGTCTGTACAGTCACTGATGTTAGTGTCAATACTCGGGGTTTCATAGCTGCTGCAATAGCAGTCTGG AGCACAGCACTGCAGCAGTATGTAAGTAAAATACTAATGCTGTATCAAGCCCTGCATATTGATTGGGAGATAGAAACTTTTTGCTCACCCTAAAGGCATT TCTAAAATTGGTGGATGTTCACATTCATGAAGCTTATTGGTAACATTTATGTGTATAAGAATTAACAGGTTGTTGTGAATCTGAATATGACTAATTTGGA ATCCTGCAACACATTTTTGTAATTTTGTTTATAAATCTGGTTTTTCAGCACAAACTGTATTGTCAGAGGTATCTTCTGGAATGGACTTAGATATAATACA ACAACCAAGCCTTAATCCCATTAGATTGGGCCAACTAATGGACTTAGATATAATGTTTTAGTTAATCAGAATTCTAACTCTTCCTGTTTTTTTTGGGTGC AATATGTGCAGTATGTGCATTTTCTTCAGAGGAAGTATTCGGTTGGATCGTTTAATTTACTGGGCCACACTGCACCAGCACAGGCAGCAAGTTTACTGCT AGTAGGCCCATTTATGGACTATTGGTTGACAAACAAACGAGTTGATGCCTACAACTATGGTTTGACATCTATTTTGTTCATCATTCTGTCATGCTCCATC GCAGTAGGGACAAACCTTAGCCAGTTCATCTGCATTGGTAGGTTTACGGCGGTGACATTCCAAGTCCTTGGCCATATGAAGACTATTTTGGTCCTATTCT TAGGATTCATTTTCTTTGGAAAAGAAGGTCTCAATCTGCAAGTAGTTCTAGGCATGCTCATTGCAATAATGGGAATGGTTTGGTATGGCAACGCATCTTC TAAGCCCGGAGGGAAAGAGCGTCGTAGCTTTTCCATTCCAACCACCAAAACACCAGATTATAGTGCAGTACCTGTGTCAGCCGAACCAGATGAGAAGGTA TAGACAATAGTAGAAATTCACAAGAAGAACAAGTGGTGGAACTTTGGGTGAAGTTCATATTAGCTGATACATTTTATTTACACCCAGAGGGAATCCCTGA TTATTTATAGATCATAGTGATTTATCTTTGCTTTTGCATTTGAGTTGTTAGTGGGGGAAGGGAAAGGACAACACATTGTTAAAGGGGGAAATCTACATAA TGTTCCATCCTGTTTTGGTAATTGTGTTCCATTTTTCATAATAGAAAATCTTGCAGTTATTTTGAGTCTGTTTGAACGTTGGGATAAGAGTTGAATAAGA ATTGAAACACAATTTTAATTTCAATTGGATAATGTTTAGAGAAGATGAAAATTGAGGTATAGAATTAAAATTTCAAAAGAATTGAGATTGTTTTGGCACA TTGGTCATTGAAAACTGCTGGTCATGTTCAGTGGACACCATTGTTGTACACTGCCATCAATGGTTGTTATAGG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_182195; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_530004
Blastp | UDP-rhamnose/UDP-galactose transporter 4 from Arabidopsis with 79.07% of identity |
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Blastx | UDP-rhamnose/UDP-galactose transporter 4 from Arabidopsis with 80.98% of identity |
Eggnog | solute carrier family 35 member(ENOG410XP1S) |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019434998.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |