Id Trinity | TRINITY_DN51084_c1_g1_i5 |
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Name Transcript | Ll_transcript_529065 |
Sequence | CTCGTATTCCGATTCCTAATATCAATAACGATGTTCTCTGTTTGAGTTTTGATTTCAGAGCTCGATTCCTCACTCAACAAAAGAAACCATGGGTGCTTCA GAATCTACCCTTTCCACCTTTCAGAACCCAGATGACAAAATCACCACAATATCAGAACGATCAGAAGCTTCTGACCCCATTTTAGAGAAACTCAAATCAC TCAAAATTACACAGCCAATTTTAACATCTCCACCATCAGAGGGTACTTTGACTGATATTTTAGTGAGGAAACCTTCCTCATTGTCCTCTTCAGGTTCCTT TTTTGTTTCTCAATAGTTATTTTTCTTATTGGGTTTATGTCATTATCAATAGAATAGAGCTCTCATTGCGTAGTTAGTACCGGTACTGGTCGATTGGGTA CATGGTTCGTGACTTTTTACATTAATTTTACGAGACTTTATTTATGACGAACTGGGTATGTGGTAAAGTGAATTCAGTATGTCGTACTTAAGGTAAATGA GAGAATTATGTATTTATGGTTTTATGCTCTTAGTATTGCTCATGTAATCTTGTTAGAAGAAAAAGATGGGTTGTTTAGTGGGTTGAGATTTCTATGCACT TCTGATATCACGAGTTTTGGTGCGAATTCTTCTTCGTAACATGAGTGAAATAAAGACATTCTTTCTTCGGCTAATGCCAATTTTAAATTGTGGGACTTGT CTTTCAAGCCATACAATCAATGAAGCAAAGACACAGCATGAGACATGGGTATGGGGATATGATATGTAAAATATAAAATGTTATGGTTAGGAGTGTCCAA TATAGGTACGTGTTTGGTATGGATACAACGTGAACACGGCGGCTATTTTGGATTGTCCATGTTTCCTGGCATAATTAACTGTCTTGGTGGTAACATCTTC CGTGGTGCAACAAGACTTCCACCATGTCAAGGTGCATTACGTTGAGTTATACCCCCTCCTTCCTTCTCTTATCTCCGTCGAGAAATAAACTGACTAATCC TACGGCAAAGGGCTGAGAAAAACAATGCCACTATTGGGTAGTCATTAGCATTAGATTTGAAAATGTACATATAGATGGAGCATTTTTCAATGTAATTTTG TATCTTAGATGGAGCTATGCTTTGTGTTATGCTCCACCGCTTCTACGATCCTAACCCCTCCCTCTCCAAGGTTGACTTTACGCTTCAACAACCTTGATTC AGGCATCCAGTCCAATCTGAAAATCTGTCGTTTTAGGTAGTGAATATTTAGACTAAACTGATCACAATATCACCAAGGATATTCCAGTTCTATCCCCGAT ACAAATCGGTCAACCTTCCATTTGTAAACATTCAAACTTTGTTTCATGTTAACCCTTGTATCCTGCTTCCCGTAGTTCACAAACAAGAGCTGAGGGCATT GATGTGTTGTACTATACTACAATATTGCAGTTTAAATGGTATGCGTCCATTCGTTAAATCCAAGGGAGGAACTCCATAACTAACTATAATTTTATTTGTA TACAAAATAAAATAAAATTGGTCATAAGCTTCAAGATTTTAGGCCAAATTTATGTCCTTAGAGATCATCTTTGACCTTTTGCTAGTATGGCGTTGCTTGT AGCCATTCTAGTGTGTGATATCTGCCGCTTTTCGATAACAATTCTGTTGAGTCTAATTATGAACTTCTCTCTGTCCATGCTTGAAACAGCCACAGTAAAT CCAAAGGTTTTATTGGAGCTCTTCTCGATGTACCGTGATTGGCAAGAGGAAAAGGTCCAAAAGATAAGCAAAAGACAGGTCTGTTTAATACAAGAATGTT TCAGTGAGTTCATCTAATATTGGGTTCAAATTCTTATGAAATACCCCCTTTTCGCACACGCTCAAAAAATGCAAACTTTCACATGCAGATGTATTGAATT AATGTATAAGTTGGGTTATGATGAAAGTAATACATTTTCCATGCCAATAAAAAGAGAATACCGCAGTTCTTACAGAATTGAATGCAAGAACTTTCATTTA TAAATTGATGTGGTTTTTATGGTAATGTATGGCTTTTTTTCCAGACCCGATACTAATGCCAAATATAATAGTAATTGACAATGACTTTGATGCATTCATA TTTAAGGCGTCAAATTTGGTAATTGACTTCTCTTCTTGATTCGGAAGTGGTTAATAAAAATATCTACTAAATTAACATTGCTGCTGAATTTGATTCAGGC GCATATGTAGGATTCGAGCTTTGTCGAATCCCTCAACTGTCTGATCAAGTTTTTTATTTTGTGGCATACCATGAAAAGTTGGAATCATTCTTGCAGGAGG ATATAGAAAACAAAGTAGAAGTTGCAGATGCTTTGGCGATCAAAATTTTTCAGCGATTTAATTACTCAGTGGCCACAATGAAGACTACTTCACAACATTT ATCAGAAGGTAATTTCTGAAGTCACAGTTCTAAAAATATGTTGAATATGTTGTTCATCATCATTGTAAATAACACATACTTCTTTAATAACCTCCTAAAA TTGAAAAGGAAAATTTCCTCTATACTTCTACATGGTGTGGATGTTGAACTGATTTTTGGGTCTATCACCATGTGGGTTCGGCTGGCTCGTTTCTATACTT GCTTGCAAACATGGGCAGCCAGTGGTGTCGTTACATATTTACCTAAGGCTAAAAATGGGCAGCTCAGTGCACGAGGCTCTCACCTAGTGAGACCTGAGAA GGGTAAATGCACATAGCCTTACCCTCGCAAGCGAACTCAAGACCTGCGGGTCACAAGATAAGCAAACTTACTATTGCACCGAGTCACCCTCACCTATTTA CCTAAGGCTACCCTAATATTATTTGAAGTCGAGTTTACTTATTTATTTACAGACAATCTTTCCGAAAAAAGTTATATTTTCTTTAACTTCACTTGACCCG CTAAAAAATGTATTCCTCTATTTTATCCGGTTTAAGGAAAATTCTCTATCCATGCCTCTACCTGTGATCATCTATTAACTATATACAGAATGTGCATGCA GTTCCTTCTTTGCAGATAGAAATAGGAGAACTCAAAGGAAGGTTGACTGAAGTTATAAGTAACTGTGATGCATTGTGCAAGAGAATTGCAGCAGAAGGCC CGGAATCTCTCCGGTCATCTATCAAACCATTCGCCATTGCTACGGTGGAGCATGAAATCGGCTTAAGGTCATCTCGTTTGGCTAAAGAGTAGTTAAACTA AATTGTTCGATTCTTGCGCCTTAGTTCAGGAGCTTCCTGCATTTTTATTGAATTTGAGGTTTCAAGTTTTCCCTTCAAAGTCTGAAAGAAGGGTTGGATC ACATTCACATGTTGGATCAATTTTGTATATGACAAGCAATTATTATAACTCATTTCACAATTGAAATTGCAGTTCAAAATTTTAATTATAAGTTGTGTGA ATGATAGAAACAAAATâBLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_182223; |
Additional information | - |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_529065
Blastp | - |
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Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019422702.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | - |