| Id Trinity | TRINITY_DN51091_c0_g2_i12 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_528645 |
| Sequence | TAACGTTGTGCCAAACTGTATATAAACGCGTGAAGTGTACCCGTTTCCCCCTATTTTCTAAGCATCAAATATTCAATCCTCATCCATTGCATTGAATTCA TTCTCTTACATCTCTTAACTAAATAGTGATTTCTGTGTCAAGTTGAATCCAAGGTAGGGGAAGTTCTCAAGTTTGCATAGTTAATTTGTTGTGCACTTCA ATTTTTGGCCCTTCACTCTTTTTAAATGATAGTGGAGTATTGGATTTTGATCATTTTGGTACAATTATTATTTGTATTCCAAGTTGGAATCTTTTTCCTT TGTAGCATATTTGGGATTGTTTTGTATTCTGGTCTATGTTTGATTGGGGGATAATTTTGTAATTCTTTATTTTTTTGGATTCTATGGTTTTCAATTATGG TTGGTTTTTGTAGATTTAAACACACTCATGTCATGTGGGAACCAGACATGGAATAAGCAATTATGTGCATGTTGTCTTTATATTTTAATTAATTTCATTA TGTAGGTGTTTGAATAGAATATGGAGGCTAAAATTGTTTGATCTAAAATTGTTTGATCTCAGAAACAATGAATGAAGTAGATGATTGAGAGATTTAGCAT TTATGTTTTACCCTCTCATACTTTTGAGAGTGATACTTGATGCAACCAAAGGGCTATTGCTTTTTCTGTTTTTCTTGTTTAAGATCATGGGGGCCAAGGT GATGTGCATCTCATCTACCACGAGCCCAAAATAATAGAGTCTTGTGCACTAGATTGCTCTTTTTTGTAAGAGCCTAGGAAGAGGCGGATTTTATTTCTTC TGCACGAAAAGAGCAAAGTAGATGTTTTCTTTTATATGATATTGTGTAGTGTTGAAATCAATTATGATTTGCTTTTGCAATTCAAGTTATCTTCATACTT CCTAATATTTGACATGTTGTGCTAATACTTTGGTTAGCTTAAGCTCTCATATTAGTTCCTCTCTGTTTTTATAGCATTTATGTGTCTCTTATTTTTTAGG GATAGTATCATAATATCTGCATCTACACCTCTAATTTAGGTCCTTAATGATGCAGTCTAATTTGACACAGTATACCTGGTCTGTTTACTGCATTCGATGA TATGATTTTTTATATTGTTTTAGGCGCATCATTGTGTCTTAATTACAAGTGAAGCTCCAATTTCTTAATCTAAAGCTTGCTTTGGCAGGTGTATTATTGC TGTTGTGGAATTTTCCCAATTGTCTAGGAGTCCTTCAGATTCCGAGTCAAGTTTAATACTTGAAAATGGTTTTATATGAGAATTCAGATGTTATTCACTG GGGTATGAATCTTTTTGACAGTGACCCTGGTTATAATCCTGGATACTACGGTGACGTGATTCAACATAATACTAGTGATGTCTATGATGGACACTACTTT CTTAACCATTATGATACGGAGTATAATGAAGTAGAGAATGATGAGATCATTGCACGAACTCTTCAAGAAGAGTTTTCACAGCTAGATATTGCTGATGCTG AGAATTCAGGGTATTCACAGGGGCATGAAGAGCAGTTCCATGCTGAGCCTGCATGTGATTGGCATAACGCGTCAACAATGAACTATTTTCCGCAAGGTCA TGATTATACCCAAGAAGGGCTTGATGATGCAAAACATTCTAGTTCATGTTGTAGTCCTTGTGAAGCGGAAGAGTACTCACTGGAACTAACTGATAATTAT CCTCTTGATGATGAAATAGGAAGAAGATTGAGTCATATGATTCCAATTCCTGTAAGTTTAACCTATCATGCTTCATTTAAACCCTTTTCAGATCAGCTAT TGAATTAACAAATATATACTCAGTCATTTAATGGTCATATAAGTGACGAACAGCTTAGTCATGTTTTTTCTAAGTTTTACTTGTGGATGCACATCTGAAC TCATTACATTAGTTTTATTTATTGTAATTCGTGGATACTCGAAGAATTAATTCCTACAGTTCTAACATATGGTTTCTCCAAGAACTCGGTTTTAGAAGTA CTATTCGTCATTATGTTGTTATTTTCTTTTTCTTATGATGAGTTTTATCTCTTTATTTTCAGCCTACGACCCTGGATGTGTCATGATTTTAGAAAGTCGT ATTATTTTCATCAGATGTATTACTTGTGGATTGGACTGTGGTGCTTAACAATTGCTTTTTAAAAATCTTGTGTAGCATGTTCCAAAAATTAATGGAGAAA TTCCTTCAACTGATGAAGCAACTTCAGATCATCAAAGACTTTTGGATAGATTGCAGTTATATGACTTTGTGGAGCATATGGTACAAGGTGATGGTAATTG TCAGTTCCGTGCATTATCTGATCAACTGTATAACACACCTGATCACCACAAGTTTGTGAGACGACAAATTGTAAACCAGTTAAAGTCTCATCCAGAGATT TACGAGGGATACGTTCCCATGGAGTACAGTGACTATTTGGAGAAAATGTCCAAGAGTGGTGAATGGGGTGATCATGTCACTCTTCAAGCCGCTGCAGATT CGTATGGTGTGAGAATATTTGTGATGACTTCCTTCAAGGACACCTGTTGCATAGAGATTCTTCCTCATTTTGAGAAGCCAAAAGGAGGTAAGATTTTCTT AGTGATGAACCTTTTCAGTAGGGGATTTGTCTTACCCTTTGTATCCTGTAGACATTTTTTCATTTAAGCTTGACAGAGCTAAAGCAGGCTGGTTTTACCG ACGATAGGACCCGTTGATTACCTTACTTAACTATTTTCATGTCACACTATTTCTTGAAATCTTTCTGAACCCCAGGTCCTCGGCCATAACTTGTATCATA CAAGTTGTTTATGAGATGGCTTTACCATTTCTTTTTTGGGTGATAACGTTTTAAGACCCTTTTTCAATTGTTCATCATGTAATCAACATGCATCATAATG TGTTTTTCGTCACTTCATTGCAGTGATTTTCCTGAGTTTTTG BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_182260; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_528645
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | OTU domain-containing protein DDB_G0284757 from Dictyostelium with 37.67% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019430648.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |