| Id Trinity | TRINITY_DN51091_c0_g2_i3 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_528627 |
| Sequence | TAACGTTGTGCCAAACTGTATATAAACGCGTGAAGTGTACCCGTTTCCCCCTATTTTCTAAGCATCAAATATTCAATCCTCATCCATTGCATTGAATTCA TTCTCTTACATCTCTTAACTAAATAGTGATTTCTGTGTCAAGTTGAATCCAAGGTGTATTATTGCTGTTGTGGAATTTTCCCAATTGTCTAGGAGTCCTT CAGATTCCGAGTCAAGTTTAATACTTGAAAATGGTTTTATATGAGAATTCAGATGTTATTCACTGGGGTATGAATCTTTTTGACAGTGACCCTGGTTATA ATCCTGGATACTACGGTGACGTGATTCAACATAATACTAGTGATGTCTATGATGGACACTACTTTCTTAACCATTATGATACGGAGTATAATGAAGTAGA GAATGATGAGATCATTGCACGAACTCTTCAAGAAGAGTTTTCACAGCTAGATATTGCTGATGCTGAGAATTCAGGGTATTCACAGGGGCATGAAGAGCAG TTCCATGCTGAGCCTGCATGTGATTGGCATAACGCGTCAACAATGAACTATTTTCCGCAAGGTCATGATTATACCCAAGAAGGGCTTGATGATGCAAAAC ATTCTAGTTCATGTTGTAGTCCTTGTGAAGCGGAAGAGTACTCACTGGAACTAACTGATAATTATCCTCTTGATGATGAAATAGGAAGAAGATTGAGTCA TATGATTCCAATTCCTCATGTTCCAAAAATTAATGGAGAAATTCCTTCAACTGATGAAGCAACTTCAGATCATCAAAGACTTTTGGATAGATTGCAGTTA TATGACTTTGTGGAGCATATGGTACAAGGTGATGGTAATTGTCAGTTCCGTGCATTATCTGATCAACTGTATAACACACCTGATCACCACAAGTTTGTGA GACGACAAATTGTAAACCAGGTTTGCTCTCTAGTGAATTATGTTCTACTATGTTCTTTTTTTGCGCATTATTCTTCAATTCTGATTGTTGAATGGTTGTT TGAACCAGTTAAAGTCTCATCCAGAGATTTACGAGGGATACGTTCCCATGGAGTACAGTGACTATTTGGAGAAAATGTCCAAGTACGAATCCACACTCCC TTTCTATCTGCATATGAAATTTCTTTGATGCTAACATATAGTTCCTTGTACTGTCATTTTTAATGAAACTAGGAGTGGTGAATGGGGTGATCATGTCACT CTTCAAGCCGCTGCAGATTCGGTATGAGTTCTTCAACTAACTTTTTCTCTTCCATAGGACTTTCATTGAACCATGTTCCCTTATTCTGCCATTTTCTGTG AAGCTTTTTTTGGGGCCGAAGTGCCAAACATCTAGAGAAATAATGAATTAGTACTGTGACCATTTAATTTTCCTAAGATGTGGTTTGGAAGTTGTATATT TGGTTGTTTGCTTTGTGTTTAAAAATTATCTTGTTATGGTTTCCGTTTTAAATTTTCCCAGAGATTCGATGATTGATTTCAAAGTTGACAACCAAACTGT GGATGAGTTGTTAATGTTGTAATATTACCAATTGAGACACCTTTTACAATCGGTGTCAATAAACGCAGTAATCAATGCAGGCTTGTACTGCTTTTGAAAA AGAAAAACATCAATTTTAATTATGGTTGTATCATAATTTTTAGGCATAGTTGCCTGGTTCAGCACTCTTCCCCTTTTAATTATGCTTGAATCACATTTTT AGCTTGTATCAATTCATTGTCAAGTTTATGATAATATATGAAATTACACGAACTTTTACTTACGATATGATCAATACCTCTGAAATTGTTTTCCTTCTTT TTCCTCCAGTATGGTGTGAGAATATTTGTGATGACTTCCTTCAAGGACACCTGTTGCATAGAGATTCTTCCTCATTTTGAGAAGCCAAAAGGAGGTAAGA TTTTCTTAGTGATGAACCTTTTCAGTAGGGGATTTGTCTTACCCTTTGTATCCTGTAGACATTTTTTCATTTAAGCTTGACAGAGCTAAAGCAGGCTGGT TTTACCGACGATAGGACCCGTTGATTACCTTACTTAACTATTTTCATGTCACACTATTTCTTGAAATCTTTCTGAACCCCAGGTCCTCGGCCATAACTTG TATCATACAAGTTGTTTATGAGATGGCTTTACCATTTCTTTTTTGGGTGATAACGTTTTAAGACCCTTTTTCAATTGTTCATCATGTAATCAACATGCAT CATAATGTGTTTTTCGTCACTTCATTGCAGTGATTTTCCTGAGTTTTTGGGCAGAGGTGCATTACAACTCAATCTACCCTCAAGGAGGTACATTACAAAA GTTTCATCCACGCCTTGACTCACTTTTAAACAATCGCTGGTTTTAATCATTTAGTGGAATCTTTAATATAATTGATAGATTAAGTTTCGAAGTGTTTGGC CAAATTAACTTGTGATTAATTATATGTTAAACAAGATTTCATTTTATTGACAATAGCTAACTTTAACTCATCAAGCTTATTGGAATTCTTTGCTATTTTG ATTTCTTTTCAACAATTATATATAGAAAAAAGTTCGGTGAAGTTCATTTTGTGTTAGTGATACTATTCACCAACAAAAAATGTAACATGTGTCCTACATA TAGTCATCTGATTAAGGAGCTATATAGAAAATATATATTATGTTATTATTATTGGAGAACAACAGAAGTCTCTAATTACTTGACCTAAGTTTTGTCCTTT ATTTATGGGGTTCATTTATTTGCTTACTGGCTTAACATGTATTTATTAACCTACTGATTCAGATATACCTTCAAGTGAGTCAAGAAAGAAGAAAAGGTGG TGGAACTTTGGGACTAAGCATTAAAGTATAGCTGGTCTAAAGAAAGAACTAATTTTGAACCTCTGCAATTTCCCAAAGATTTGATGCCTATGCATTTTGG ATCACTGGATTCTCAATTCTGTATCCAAATTGAATTTATGGTAGAATCAACAAACACCAACTCAACAAGGGTACCGAATCTTTGCTGTGCTCATTTTTGT AAGGTTAATTTGATTATTATCCTCTTTAGTAGTTATAAATCTGGGTATGCTGACCCATCTGCCTGTGGCATTTTGGATGCTTTCTGGATCAAAATTTATA CATAAATAAAGGGTTGAAGTATATCAAGTGAATGGTTGATTTATATGATAGTTTGTTTTCATCATGATCTATTAGGTCATTGAATGCACATAGTTTTCAA GAAATGTCTACTAATCAAGTGATGCTTGATTTATTTTTATTAAACACTTGTCATGTGAATGGTTTTGTTGTGAATATAAATTATTGGCTTGACCTAATGT AAAAGGTTGGATTAAGAGACCGTATATGTGTTATGTAAATCTAGTGACTTATTATAATAATAATTACAAATTAATGTTATTAATATCATACTTGCCAGGC TATTGGGC BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_182260; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_528627
| Blastp | OTU domain-containing protein DDB_G0284757 from Dictyostelium with 40.51% of identity |
|---|---|
| Blastx | - |
| Eggnog | OTU-like cysteine protease(ENOG4111GFM) |
| Kegg | Link to kegg annotations (DDB_G0284757) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019430647.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |