Id Trinity | TRINITY_DN51131_c4_g1_i4 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_460298 |
Sequence | CTTACTTGTTTTGTGGTTAGTTGCTAGAAAAAGTGGCAGAAATAAAAACTGAGAACTTTTAAATTGGTATTAACTACATACTTTCTAGAAATGGGAATTT TGGAATTTTGAAGAGTTATCTTCACTTTCCCAAATCAATGGTTGGATCCAAGAAAAGTACCTTTAATGCCTAAAATTTGATTACTCATTCCCAAATCAAT GATAGGATTAAAAAAAAGTACTTTTAATTCCTAGAATTCCACTGCTTTTCTGATATTTGTTTTCCTATTATGCAGCTAGTTCAACAAATATAAAAACGGT TCTATTGTTTGTTGTTTTACGTGGGGAAGCTGAAAGATGGGAGAGAGATTGCAGTGAAGAAGTTGTCACAGACCTCAAATCAAGGGAAGAAAGAGTTCTT GAATGAGGCGAGGTTGTTGGCTCGGGTGCAGCACAGGAATGTGGTGAATTTGTTGGGTTACTGTGTCCATGGCATAGAAAAGCTACTTGTTTATGAGTAT GTTCCTCATGAGAGCCTTGACAAGCTTCTATTCAAATCCCAGAGGAGAGATGAGCTTGATTGGAAACGTAGATTTGTAATAATCAAAGGAGTGGCAAAAG GGTTGCTTTATCTTCATGAAGACTCACATAATTGCATAATACATCGTGACATAAAGGCAAGTAACATTTTACTTGATGATAAATGGTCACCAAAAATTGC TGACTTTGGCATGGCTCGTCTCTTCCCAGAAGATCAAAGTCAAGTCAATACACGTGTAGCTGGAACCAAGTAATTCAATTCACCTTTCTTAATTATCCGA TTTTCAACTTCATTTTGTTATGTAAAATCGGCTATATAGATAAATTTCACCCGTGAGAATATAAGAACGTCAATTTGGGATCAAATTAACTTAAGATGTC TAGAGTGAAAAACCAAATTGACCATAATATCTATCTCCATGTTGTAGTCATAATTTCATTAATATATTTACAGTGGATATATGGCTCCTGAGTATGTGAT GCATGGGAGTCTGTCTGTGAAGGCAGATGTGTTTAGCTATGGGGTTTTGGTGTTGGAGTTGATAACTGGCCAAAGAAATTCTGCCTTTAACTTAGATGTG GATGCTCAGAGTCTACTTGATTGGGTAAGAATATAATATTGATATTTTATGTTTTTGACTTTAGTTACATAATAGGCTAATCTTTTCTGCCACCCATAAA TTGTTTTTTGAATGAAAAGGGTATTTGGTTTTTGTTGACATTTTGATATTTGTTGGGATATTTTATTGTTCAATTAATTAATAGGTGTGTTAAGAAGTGT CTTTTCACACAATTATTCAAATAATTGAACTCAAAAGTTTGGCATGAAAAGTAGATTTTTAAAAAAAAATTAAATGTATTAAATAATTCAATTTTTATAA ATGGAAAAAAATTAAATTGACAATGATTGATTGATAAGCCCATAACATGTTTGATTCACAAAATTAAAACCAAACTCTGCCCCCACAAGTGGACCATTAT CTCATGCTTACATAAACATAAAATTGTTCTTAAAACTAAGTCAAGCTACCATTAATTCAAAAAGTCAAGCTACCTTAAATTTTATTACTTCTAATTAAAA ATGGTTCATTTACTCGAATGAATACAAGAAAATTTAAAAAAAAGATGGTAATATTTTTATATAGATTTAGATCCAACAATTGTGAAAGCTATAAGATTCA TAACTAGTTTCTTGTGATTATAGGCATACAAGCAGTATAAGAAAGGAAAGAGCTTAGACATTGTAGATTCCACATTAGCATCTTCAATGGAACCCGAACA AGTAGCTATGTGCATTCAGCTGGGTCTGCTATGCACTCAAGGCGATCCACAGCTACGTCCAAATATGCGGCGTGTGGTGATGATGTTGTCTAGGAAACCT GGCCACATGGACGAACCAGTGAGACCAGGGACACCTGGGTCGAGATATAGAAGACCTCGCAAACACTCTGCGATGTCTTCTACAGTCGATACCTCTGATT CGCATACTTCCGATTCAAGCAACAATTGTACCACTCGTACCACTACTGCAACAGGAACAAACTCAGCTACTAATACTATAGAAATCATAGATTCCAAAGG GAAACGACCAATGCAAAGTTAGGCTCATTTAGTGAAGTTTATTATCATTTAAATTATTCTTTTTGTATGATGAGTGCAGTATATATAATATTTATAAACA AATTAGAATGTAAATATTAAGTAGATTGGGTCAGGATTGGCATGGTGGAAGTGAATTCTTATTATTCTTTTATAAGTGATAGATGCGTTGAAATTAATTC CTTATCCCCTTTCCCATGATTCCCAAAACAATGGTAGCAAAAAGGATAAGTTAGTTTATCTATGGCTAAGCTATGACATAGAAAAACATTTTATTTTAGT TTGAGGGATTCAATAGTGAAGCATAAGGCATTCATTATGCATGTCTTCATTGCCTTGACTTTTGTATTATGTATATGTTTAATGTTTTTTTGGGGTACAT ATATGTTTTCATTGCCTTGTTTAATGTTTAATGTGACATATGATAAATATATAATTATTTAGTCTAAAAAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_182566; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_460298
Blastp | G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SRK from Arabidopsis with 38.67% of identity |
---|---|
Blastx | Putative cysteine-rich receptor-like protein kinase 35 from Arabidopsis with 59.88% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0002499) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_017442814.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |