Id Trinity | TRINITY_DN51133_c4_g1_i9 |
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Name Transcript | Ll_transcript_459790 |
Sequence | TTAAGAAACTAATCCTTCAAAGTGTGTGGATCTCCCTCGTAGATTTGAGTATAAGGTAAAAAAAGAAGAATGAAAATAATATTTTAGGATTTACTTTTTT GTATTCAATTTCAAATTCTACTCATGAAACAAAAACAAGATAATACAGAGTCAGGGATGAAAAGGGCCCAATAGCGCGAGAGAAAATGGCGCCGCTGAAA TCTCTGGAGAATGAGTATCCAATTATCGACTCTAATTTTCAAAGCTTTTGTGCTTCCCACACCATTTTCTCTGTTGAAGATTTCCTCCTTTACGATCTCG ATGCACTAATCGCTTTTGCCGATAATGATCACACTTGTTCACACACATTGAAGCAGGTTAGGGTTACTTATACATCCTCACTCTGAATTGCGCTTCTAAA TCTGTTATAAAATTAATTAATTAATATGTTGATTCTGTGAAGGGAATTGATCAGCTTCTCTCAATAATAGATTCTCAGCAACCACCATTGCTAAACGGCT TGCAGCTATTTGAAGATGCTAAGCAGAATAAACATGTTTTGCCCACTGGATTTGAAGGGTGCACTTTCACCCTCAACGTTTAGTTTATGTTTGAAAATAT GCATACTGCGTAAACTTTTGGAATGTTTGCAATGAGTAAACTGTATTTGCACACTTTTTTACTACTACTATGAGTTTTATTGGTTGAGTAGCTGGAAATA TTGGATTCAAAATCAATATAGCTGTGTTGCGTACTTTCGAATATCGCAAATGTTAGGAAGTGATATAAAAATCACTTTGTAGTGGTTTGCTCTGACAGAG ATGTGGGAAGGAGGAGGTTAAAAGTGGAATGCAACTTATTTACATCCCCAATGTACAAAATTTGATCACTCTTACTCTACTAATCAACAATTAGTGAAAA TGGAAGCCTTTATGTTGAGCTACGTTTTCAATCTCCTCATTAGTTTCTTCTACCCACTCAAAGAAAAGTAGCCCATTTTCCCCCTCCATGGTGTTTAAAA TTTTGCAGCTTATTAATAAAAGTTTTATTTGGCTTCTAATGAGATGTGACACTGGTTTGAAATTTGCACTAAGTGTTTGAGTCTGTGTTATTCAGGATTG ATGCATTGCTTGGAGGTGGGTTAAGTGAAGGACAATTAACTGAACTTGTTGGGCCATCCTCTTCTGGTAAGACACAGGCTTGCCTGCTGTCTGCCTCGAC TGTTGCAAAACATAAGAGTTCAGTTATATACTTAGATACAAGCAACTCCTTTTCACCGCAGCGTATTGCACATTTGGTTGGTCAGACATCTGGTTATGTC TTTAACAGCCAGGCTGATCATAGATATCTCCAAGAAGTATTGGACAGGATAATCTGCTACTCAGTGTTTGACCTCTATCAAATGTTTGATGTGCTGCATC AACTGAAGATGAAGTTGAAATGCCAGATTGGCAAATCAGATTGTCATGTTCGATTGCTTATTGTTGATTCAATATCTTCACTGATTACCCCTATCCTTGG GGGCAGTGGTCCTCAGGGACATGCGATGATGATATCTGCTGGGAATTTATTGAAAAGGTTGGCGAATGAGCATAATATCGCAGTACTGGTAACGAATCAT GTGGTGGGAGGAGAAGGTGGTACTTCCAAACCAGCACTTGGAGAGAGTTGGAAGAGTGTACCACATGTGCGACTTCTGCTTTGTCGTGACTATGGAAGCA ATGTTGCCAATATTTCAATACTAAAACACCCATCTATGGCATCTGGTAAGACAGCAAGTTGGACCATGTATTCTTTCGATGACAAAATGTAAGTATCATA ACTTATAGTATTACTAATTGAACAAGAATGATCGGGTGAGTCAGTTTTGTTATTACTGTTGGTATAAAAATTTATATACTCATTTGTGTTACTTATATAA TTATATTTAAGAATTATTAATGGTTGATATGATATAGCACCAGTGTAAAAACCCAAAGATTTATACATACAATGCATCATTAGGTACGTATTACTTGTAT TTAAGAATTATAGTGTATACTTTTTGGCAATGCATAAATTTATGATTCCATGTCTTTAATAAATATAGATTCTCTTAATTGACTTAAATAGTATTTAAGA ACAAAAAAATATTTTGGCATATAGAGAGATATTTAAGGTCGAAGTCCTCCACGAAATTGTGAGAACTATATTCATTTTAGTACGTCAAAACATAAATCAT GCTATATGATCCTTATTATCATCAGCCAGTTGCTTTTTTAGTATTATGAAATATATTCTCTGATAAAGAATTAATCTTTTTCGGTTGTGTCATTTTCTTT CCCAACAAGTATTGTTCTCAAGAATCAAAGTATTAACCTTTTGATCTTTTTGGGATCTAATAGAGACTTACATTACTTCACTAGGGCCTGATTGGTATCA ATCATATGCTTTGGTGATACTTTTTATAATTTCTGAGAACATGACTGTTTTTTTTTATTTATCTGTCGTTATTAAAAACTTTAGTTCTCTCATTTTTGTC TTGGATAAGCCAATAGATCATAAACAGTGGGGTCAAAAGTGTTTAAGCTGCTCAAATTTTCTTATTACTTTCCTTATATAACATACATGGAAATGATTAA AAAGATAAAACTTCTGACCCATGCATTGCATTGACAAAAATTGCTAGTTCACCACATTTTGACAAGTAATCTTGTTGCCGATGAGTTTTATCAACGTGGC CATTTCATTGAAAAGATCCTTAATGCACTATCAAGTATCAAGTGCACTTGTGGACAATTTCACATAAACGTTACACCAACCTTAGCACAAAAATCAAAAT GGCAGGATATAAGTTATTGTAGGAAAGATTCAAATTCCAAAGCATCCACTCCATTTATGGTAGGAAACAAGGTTTCACCTTCAAGAGTTGCAGAAGTAGG CTTTATATATGGATAGTGGCTAGTCAAAACTATTTCTTTCTCCTTATAGCAGCAGCAAACTAAGAGTTCAGAACGCTTTATTACCAAAACAACCATAGAA ATAAAAATGGATCTTCAGCTCTTCCTCTCTTCCTTGCTTCTTGCACTTCTTTACTTACTTTTCCGGTCCGTTTTCCACCGCCGCCGCCACCACCACCTTC CCCCTTCTCCTCCATTCCGCCTCCCAATCATTGGGCACATGCACCTCTTAGGCCCCATTCTCCATCAATCCCTCCACAACCTCTCCCTCCGTTACGGACC TTTATTCTCTCTCCATTTTGGTTCTGTCCCTTGTGTTGTTGCTTCCTCCTCTTTCTTCGCTAAGCAACTCCTTCAAACCAATGAGCTCTCATTTAACTGT AGAATTGAAACCACCGCTGTTAAACGTCTAACCTACGAGGCCTCTTTGGCGTTTGCACCATACGGTGCTTATTGGAAGTTCATCAAGAAGCTTAGCATGA ATGAGCTACTAGGCTCTCGTAGTATCAACAACTTCCAACACTTAAGGGCAAGAGAGACTCTTCACTTTCTAAGGCTGTTGGCCATCAAAGGTAAAGCTTG TGAGGCTGTTAATATAACTGAGGAGTTACTCAAGTTGACCAACAACGTTATTTCAAGGATGATGTTGGGGGAAGCAGAGGAGGCTAGGGATGTGGTGCGT GGCGTGACACAGATCTTCGGGGAGTTTAATGTTTCAGATTTTATTTGGTTGTTCAAGAAGTTGGACCTTCAGGGGTTTGAGAAGAGGATAGAGGACTTGT TTCAGAGGTTTGATACACTTGTGGAAAGGATTATTAGCAAAAGAGAGGAGATTAGGAAAAATAAAAGGGTCAAAAATGGTGAAATAAGGGACTTTCTTGA TGTCTTGCTTGATTGTGTGGAGGATGAGAGCTTAGAGATTAAGATTAACAGGATTCACATTAAAGCTTTAATTATGGATTTCTTCACAGCAGGAACAGAT ACCACAGCCATTTCAACAGAGTGGGCATTAGTAGAACTCTTGAAGCACCCAATGTTGCTTCAAAAAGCTAGAGAAGAAATCAACAATGTAGTAGGGAATA CTAGACTAGTTGAAGAATCTGATTGTCCAAATCTTCCTTACCTCCAAGCCATAATCAAAGAAACATTTCGTCTACACCCACCAGTGCCTTTGGTTAGTAG AAGATGTGTTGAAGATTGTAACATTGAAAATTATGTGATCCCAAATGGGACAATACTCTTTGTTAATGTTTGGTCTATTGGAAGAAACCCAAAGTATTGG GAAAATCCATTAGAGTTTCGTCCCGAAAGATTCTTAAAGAATGGTGAATGTGATAACATGGATGTAAGGGGTCAACAATTTCAACTTCTTCCATTTGGAA CTGGAAGAAGAATGTGCCCTGGTGTATCCCTAGCCATACAAGAGGTACCAGCATTGCTTGGGACTATGATTCAATGCTTTGATTTTCATGTGGTGGATCA TAAAGGTAAGATTTTGAAGGGTGAGAATGGTGCAGTTATTGATGTAAGTGAGAGGCCAGGATTAACTGCTCCAAGGGCTCATGACCTTGTATGTTTCCCA GTTGAAAGATCTAACTGCCCACAGCTTAATGTCTTAGCTTCTTGATTTGTCTTTAGTATTGGCATGTCAGTGTGGTTTGGTTGTGTTATTATGACTTTTA AGTGCATGTTCTGTCCGTGTACTTTTCTTGGAGTATTCTCGTTTCAATAAGATGTTGTAAACAAACAAAAAATAATGTACTCATTTGTTGTGATGGTAAT AATTTTAGAATATCGACCAAGTGAAAGAAGCATATAAGTGGGTTTGACACCACATCTTGACCCAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_182586; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_459790
Blastp | Licodione synthase from Glycyrrhiza with 76.5% of identity |
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Blastx | Licodione synthase from Glycyrrhiza with 78.86% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | Link to kegg annotations (BAA22423) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019454023.1) |
Pfam | Cytochrome P450 (PF00067.21) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |