| Id Trinity | TRINITY_DN51138_c0_g1_i12 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_460550 |
| Sequence | TGAAAATTTTACCTATTTCGATATTTAACAATTAAACCTGGTTTAACCATTTTCTAGACGACTCAAAGCGTTCCAAAAAATAGTTCATTTAAGAACATGA AATATGGTTGTTATTGTAATCGGTCAACGGTTGGACCAATTCGGGCCGTCCAAGCTCATAACATTGTTAAAAATGGAAATCGAAAAAAAAATATTTGTTG AACTTTATTTTGAGAGAAGTTTCTGAAGAAGTTCTTTTCATAACACCTTCATCAATAAAAAGGAGAAAATGGAAGGAAAGAAAATGGGTGAAATGAAAAG AGGAGGAAAACTTACATTTCTCTTGTTTGGTTGACAAGGGAAAAGAGGAGGAGAGAAAAAAATATGTTGGCCCATGCTAAATCTTTTCCGAGCAAATGTG AGCGGAAAAGTGGAGGAAAAGCAAAAAAAAAAAAAAAAATATGTAAAGTACCATGTCTCTTTTTTATTATCTTTCTTCATCACAATTAAGTATTCACACG CTGCACTTTCATTGTCTACCTAAACACAATGCGATCTCCCTCTACTTCATTTTTTCTCCTTTTCTAATTACAACCAAAAAGGTAATTTCTTTCTCACTTA TTATACTTGCAACCTCATTTAAATTTGTATTTATTTATTTTATTATTTATGATTCATGAATTCTCCCTCTATCTATTTTATGTTATGCAATTTCTCTTTA AAAATGATCCATTGTTTTCTCAAAGTGTTATGTTCCTTTTCATTAACCATTTTTTCCACCTTAAAATCTATGTATTGTTATCTTCTTTTACCATACATTA TTTATTTACTTAAAAATAATTAATTTTCTAGTTTTGATGGAAAAATTGGGTTACTCTGTTGAAGAGGTAAGGATAACAGTATGTAATGTGCACTCTGTGT TTGTTAGTGTCTGAAGAATAAGTATGCATGCTATGTGTTTGTTAAAATGTCTGAAAATAACTATGCACACTATGTGTTTGTTAAAATGTCTGAAAACAAC TATGCACATATTGAAAACAAATGTTGGGCATGCAAATCCTAATTATTTCATAGTCAATCTTTTAGATGATGCACATTATGTGTTTGTTAAAATGTTTGAA ATAGAAATTTAACTTGGGGACTCATAAATTTAATTTGGGCATGCAAATCCTTGTTTTTTATTTATGAATTGTGTGATATTGTTCATATGATTGCCACCAG CTAGAGCTTGACTTATATGCTTCATAACGTTCTCAATACATGGCTATAGTTTGACTTCATAATGTTCTCAATACATGGCTGTAGCTTGACTTATGTTTTT CAAAAGTTGACTAGCAACTGTGAATGGCTTAAAGTTGTATACATTTTTATTATTAAAGAATGATTTAAATCTTGGTTACATGATCTTAGAGGTTCTAGTA CCATATAAATGACCAATTCTATCAAAAGATTAAGTTGTTAGGTAGAGGTTCATAAATATCTTTATATATAACACTAACAATGTAGACATTTTTATTTAAA TTTTATATAACTATCTATGTTCTCATCCATCTTATGTCACTAATTAGAACTATTTTTATGTGATTAGATCTTTACCAAAAAAGTCATTGTTAGACAAAGG GAACATGAGGTATGCACCAAAACTTTTTTCCTACAAAGTACATCCATAAAAATTGCTTGTCATGTTTTCTTCAAGTATCATTCTTAATATCTAAAATTAT GTAACCTTAACTAAATTAACTCATAATAGTGGAATATGTTGACAGACATGAATTTTTTCAATCATGAAGATGATGAGTTTGGCAATGAATTTGATATAAA TGAAGTATTGTTCAAAGTAAAACAATTGACTAATATTGGCATGTCACTTGACATACAAATTCTAAGTCATTTTCGACAAGAGTTATGAAGGCGAGAGCGT CTTTGTTTTATGGTCCTATTATGTTATATTGTCCATGCATTGCATGTGCTTCAAATTATGTCATCTTACATGCACAATCCAATAAATGAGAGAAATCAAG GTAGCATAGGCGTCTTTATCTAATGAGAGAATTAGTGCAAACTGAAAGATGTCGAGGCATCATACGAATGGGCCCAGAAGCATTTATGTTGCTATGTCAT AAGTTAAGAGGAACTAGGATTGTGAAGGATACTATACAGTCCATGGTGGAAGGGCAAGTTGCTAAATTCTTGCACATCATAGGTCAAAATTGGAAAAAAT TTGCTTTATCATTTTACTTCCACCGAAAATGTTTTACGTGCCATAGTTTCATTAGAAGATGAGTTCCTTGTCCAACCTTCTTCCATAGTGATGTACCTCA ATATATATTAAATAATAGCATATTCCAGCCCTTTTTTAAGGTACCATTTTTTCATTTTACTTTGCTATAGTCACTCTTGAAATTTATGATAAATTATACA AGTTTATAACAATCAATACAAAAAAGGATTGTATTGGAGCTATAGATGAAACACATTTTCGGGTGAAGGTCCCAAGGATAGAACAACCTCGGTTTCATGG AATAAAGGAATTCCCTACCCAAAATGTATTGGTTGCATGTAACTTTGACATGAAATTTACATATGTGTTAGCGGGGTGGGAACGCACAACATCTGATTCT AGAATTTTGAAAGATGCTTCAAATAGGGAAGACCCATTAATACTCCCTGAAGGTCAGTAGTATATTATTAATATTTTTTACAACGAAGTATTCTAATTTT TCATCGTCATAATTTTATAAAATTGTTGCAGGGAAATATTACATTGAGGATGTGAGATTTATGTTAAAATGTGGGATCCTTACACCATATAGAGGTGTTC GTTATCACTTGGAGGAGTACTCAAGACGTGGCCCACAAAATCCTAGAGAGTTATTCAATCACCGCCATGTTTCACTTTGAAATGTAATTGAGCAAAGTTT CGGGGTATTAAAAAAAATCCCCATTATCTCTAGTGGCACCGAGCCTCATTACTCTTTTGATGTCACAAAAGACATTATCCTTGCTTGTTGTATTTTGCAT AACTTTCTAATGGGGGTTGATGTTGATGACGAATTAATTGTTGAAGTGGATCGTGAGTTGCTTGAACAAGAAGTAGATAATTCTCAAACACAACAATGTA ATGAGGACTATAGACAGGGAGCAATTTTAAGGGACAAAATTTCTATGGAAATGTGGATTCTTATTAATTTTGATGACACATTAGTACATTGTATTGCTAG TATATCATTATATTTTGTCATGTAAAGTATGCTATCATGTGAAGACTGTTATAATTAAGTAGAGATGTGTATTATTAAGTGTCATGTAGAAACAACTTTT ATTATTTTACTTATATTATTATTGTTTTGTATGAATTTATCACATTTTCTATGGAGAATATGTACAACTTTTTCAGCAATAGTTTTGTATGTTTTTTAAA TGATATGTAGATACTACAATGACTAAGGGGAAGGATACATCAAGTTCTACTCAGCCGAATAGAGATAATTTGCATTGGACTAATGAGATGGACCAAATGT TGTTGTATGCAATGACTGAAGAGGTGGACAAAGGAAATAGACATGACAATGTTTGGACATTAGAAGCATAGAGAATAGAATGAAAACATTGAAAGATTAT TTCGCGGAGGTGTATGACTTGTTTCATAGCTTAAGTGGTTTTGCATGGAATCCAATAACTCGAAAATTTGAAGTTGAAGATGAGGTTTAGAATGAGTTGA TCAGAGATAAACCACATGCATCAAGATGGAGGAAAATGCAAATTAAGAACTATGACATTTTGGAGGAGTTATATGGAGCTGATAGGGCAACAAGGAAGCA TGCAAGAACCTCTAAACAAAGGATGAAACAATGGGAGAAAGAAACTATTGATTTGAATTATTGTTCTGAAAATGTAGAAATCCATGACCCAAATGTTAGC ATGAATGATGAACAACAATTTTCACCCCCAAATCTGGATGCCTTTAGTCCACAATATGCTCCTTCAAACCAATCAATTGACACATCTACTTCAAGGGGTA TAAAAAGAAAGAGAAATATAGCTGAGATCATGGAGGCTCAATATGAGAGAATGCATGTAGGAATTATGTTTGTTGCAGAAGCATTGAAGGATGGAAATTC CCTTTCAAACAAGCTACACAATGCTGCTAAGCGTCAAGTTGCAATTGCTGAGAAGGAAGTAGGAATTGCTGAAAAATAATTTACTTTGATTCTACAGACT CGACCTCAACATTACTCTAAATCTGATGTTTGCGCTCTTTTAGAAGAGTTGCAAGTACCAGAGCATTACCTATTAAAATGTTATGACTATTTATGTGATA ATGATAAAAAAACGTAAGCTCTTTGGTGTACCTCCTCAAATGAGGGCTCAAGCTCTCATTCAAATCGTGAGTGATGCTAATATAAACTGAGTAGAGTTGT ATTATTGCTCTTTTTTGTTTGTATATAGTTAGGACATCATGTGATGCATTTGCAAATTATGTAGTCTAT BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_182649; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_460550
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Protein ALP1-like from Arabidopsis with 32.89% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_014618718.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |