Ll_transcript_461711

• Id Trinity: TRINITY_DN51149_c0_g3_i16
• Name Transcript: Ll_transcript_461711
• Sequence: ATTTATTTAAACAATCATCATAAAAAAAGATCTTGTCTCTCTATATATATCCAACACACAGAGAGACACAATCACACTAACCGCGTTGAAAATCTCTCTC TCTCTCTCTCTCTCAGATTCTGCTTCCGATCCTTCTCTCTCTTTCCCATGGCGGAAGCATCACACAAACCCGTTCCACTGTTGAAAGATGAGCTCGACAT CGTGATCCCCACGATCCGAAACCTCGATTTCTTAGAGATGTGGAGACCCTTCTTCCAATCTTATCATCTCATCATCGTTCAGGACGGTGACCCTACTAAG GTCATCAAGGTCCCAGAGGGTTTCGATTATGAACTCTATAACAGGAATGATATTAACCGGATCTTGGGTCCTAAGGCTTCTTGTATCTCTTTTAAGGACT CTGCGTGTCGCTGCTTTGGGTATATGGTGTCTAAGAAGAAGTACATCTACACCATCGATGATGATTGCTTTGTAAGATTTTCTGTTTTTGTGGATCGGGA GTTTATGTTTTTGAATTTTGTTGACTTGCTTGATTTGTTTATGGGTTGTGAATTTTTGTGGAATTTCGTTGACTAGATTACCCTTTTTGTTAAAGTTTAT TTTTTTATGTACCATTTGTGGATTTTGCTTGGTTGAGATTTTGGGGTGTTTATATTTTACTTTGAGAACTTATATAACATGTGTGGAATCATGGTTTTAT ACTGAGGTTGTCTGGTCCTCGTTTTGATTATGCTGTGTTTATTGTAATTGTGTTAAAAACGAGATCTATGGTGATGCAATTGAAGTAATGTACATAAATA TTGCAGGGTTTTTAAAATGGGGTTAGATCTGGCTTGTTTTGTTTACTGCAATTGTGAATCCAGCTCTGTTTTATTTCGTATGATTTGAAAAACTTATCGA ATCCAATTGCTGGTAGTTGTTGATCATAATTTAAACCTTTGATGAGTCTTGGACATTAGGCATTGCATGGGTTTGTCAAATGGGTTGGATCTAACTTGTT ATAAGAGTGCTTTTGTTTGATTTGTTTAACTACATGGCTTTTGTTGTGCAAGTACTTGGTTTCTTTTAGGTCATTGTGTTTATGGTTGGTCACTTGGTCT GTTATAGTTGGATTGCTTTCAAGCTCAAGATAATTTGATTCATTTGATCTTATCAAATATGACTGGTATATTTCTTTGTTCGGAAAGTTTTGAAATTTAT TTTGAAATATTTTTTCGTTATGTTATGATACTTAGAAATCCACTCAAATTTGGTATGATTTGATTTAAATTCAGTTTCAGTTTTTGAATTAGAATTTTAT CCTTATTTATTTATTTATTCTACCTATTTTAATTAAGTGTAAGAGAGTAAAATTACTAAAATACAATGATTTCCTTTCACTTTTATCATGTTCCAATAGT TAGATTGGATTTACAAATCAATTTAAATCCTATCTTTTGTATTATTAGGTTCTAAACATGAGAAATGATTTCTAAATCAAGTCAATTCAAATCACATAAA GTCTAATTTTATTGATTCTAAACACAACCAGATCTTATTCAAATCAAGTCAATTGCATTTGGGTTTCTTTCCCTTACTTCGGAGAATGATTATGAGCCAA ATAATGAGAACAATTGTTTTGGAATTATCTCCATTTGCCTGAAACATTTTTAAGCTGTTCAACCTTAATCCTCCATTCTGTAATTTTTTTCCCTTCTCTG GCTTTTATGAACACACTGGTTGCTAGTCAAATTGAGCTCTGGTTGTTGATTTTGTTGTCTTTCCCTGCTTCATTTTTTTTCTTTCCAAATCTAGATTTAG CTACGGATTGAAATCATGATTTTTCCTTTATTATTGCTGTCAATAGATCTTTGATATCAATGATGACAATTTATTGATTTTTATAACCCAAATTTCCGGG GATCTGTTGCTTTTAGTACAAAATGTATGTGATTTTCTCAATATTTTCTATATGCGGGTGTAGGTTGCTAAAGATCCATCTGGCAAGGATATCAATGCAC TTGAGCAGCACATCAAGAATCTCCTAACTCCATCTACTCCACATTTCTTCAACACCCTTTATGATCCTTACAGAGAAGGTGCTGATTTTGTCCGTGGATA CCCCTTTAGTCTTCGTGAGGGTGCCCCCACTGCTGTTTCTCATGGCCTTTGGCTCAACATACCTGATTACGATGCTCCAACACAGCTTGTCAAGCCTCGT GAGAGGAACACCAGGTATGTTGATGCTGTTTTGACCATTCCCAAGGGAACATTGTTCCCCATGTGTGGTATGAATCTGGCCTTCGACCGTGAGCTGATTG GACCTGCAATGTACTTCGGACTCATGGGTGATGGTCAGCCTATTGGACGATACGACGATATGTGGGCTGGCTGGTGCATCAAGGTTATCAGTGACCATTT GGGGTTGGGAGTCAAAACTGGTCTTCCATACATCTGGCACAGCAAAGCAAGCAACCCATTTGTGAACCTGAAAAAGGAGTACAAAGGTATCTTCTGGCAA GAAGATATCATTCCATTCTTCCAAAGTGCCACCCTTTCAAAGGATTCAACCTCTGTTCAGCAATGCTACATTGAACTCTCCAAGCAAGTGAAAGAGAAGT TGGGTCCAATTGATCCCTACTTTACCAAACTAGGAGATGCTATGGTCACTTGGATTGAAGCTTGGGATGAACTTAACACCCCATCTGATGCAAAATCTTC AAAACCAGCCAATGGAGTTGCTGCCAAGTGAACTTTTGATAGTTGAGGATTCTAGCTTTTAATAGTTCTTGCTTATCAATTTCAATTTTTATCATCTTGG TCATTTTTATTTCTTATCAGTTTTACTGATATTTTGCAAGACTAGAGAACTATTTCTATTGTTATTCAAGTGCATGTCAATTTCAACTTTTCTTATTGAT ACTATTTTGCAAGACTATAGAACCTTTTTTATTGATAATCGTGATATTACTGTGCAATACTCCAAATCAAGGTTTACTATTTTAGCATACTGGTGAATAT GTTAAAAACATAATATGTAAGAGAATCACTATTTTTATTTATATAATTTGTTAAAATAAAATGTGCCACTTGTATAATATATTTATGTTTTCGAAG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_182737;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_461711

FPKM

• PAB: 53.5
• PNAB: 84.7
• PS1: 62.6
• PS2: 28.9
• PS3: 45.1
• PW1: 55.6
• PW2: 40.9
• PW3: 18.5

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_461711

• Blastp: Alpha-1,4-glucan-protein synthase [UDP-forming] from Pisum with 85.26% of identity
• Blastx: Alpha-1,4-glucan-protein synthase [UDP-forming] 2 from Solanum with 90% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019461195.1)
• Pfam: Reversibly glycosylated polypeptide (PF03214.12)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;