Id Trinity | TRINITY_DN51275_c4_g1_i2 |
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Name Transcript | Ll_transcript_519083 |
Sequence | TGGATGCTGCTTCCATCTATCATCTTTGTAAAAGCATTGTTTTGGTAAATTGTATTTGAACTCGTTATTGTAAATAATGTTGTGATTTTTGTTTTTAGTT TTGAAATTAATGATTGTGTTTATTTATTTTGATTAGGTTAATACCCAAGCACCTTCTAATGTGATTGATTGCAGTGATCGAAAAAATTCTAAGTACTATA TTGTCGTTGTTCAGTACACTGCTCGACTTAATGCTGAGGCTGTGAAGAATTTTTTGTATTCACTCAACAATGGAACTATAGCAAAAAAGAAATTCAACTG TAAGCTATTTTATCTTGCACAAGGCTGTTTTGTCTTGGGCATATTTTTGTGTGTGGATTTCATAGGAGTTCAACTGGAGCGCACCTTGTAGAGATTGAAT GAGATACTATTGGATATTGTGGCATTGAAAGGAACATGATGATTGTGCACCTTTTCCAACTTAAATACATGATCAATATAACTTTATGCACTGCCTCAAA ATTTAAACACTGATTTACTTTTCCTCTAAATATCATAAAATATATGTTCGCTATGGAATGCATCGCCTCATCATGGTCTGCTGGTCTTTATAATAATAAA TGAACTTTTCAGTTTATCTGCTTTTATGCCATGCGAAGGAATGGTAGTGATTAAACTGAATATAGTGGAAACACCAGTTTTAAATCTTTCTCCCTATCAA AAACTACGCAGTTAGTACATTTGAGATATTCGTCTGCATCCCTAGTTGTTGTAATATGACATTTGCAATGAAGGAGAGTTAAGGTAGGATTGTTCATGAA GGTTTCCTTGCTGAATATGAATCTTCGCTTGCAATTTGAAGTCATGAGCTTCTTTGTGCATAAAGGGAAGTATCATGGATGAGCTTGGTCGGGATAGGCC AACCCTGGGTAGGCTCCCCTGCCGCCTTGTTTTCAATGTTTATAGCATGCATTTCCCCCCTCTAATTGAAATAAAACAACAGCTCTCCTTGTTTCTCACT GACTCCCTATGGAAACAGCCTTCTCCTTCTCTTGCTATCTCAATTTCACCGCTCACAGGTGCTGCAACCCCAATCATTTATGAAGGTATGAAATTATATT ACTTTATACCAAAATCAATCCCTGCTTCGGTGTTGAAAATGGATGCAGATTGATGAATGCCTTGAAAAGTTGGGTTATGAGTGAGGACAGAGACCAGAGC ATATTCCACATTTCTAAAATGTGAAAGGATGGAATTGCAGGCAGTGAGTGAGATTAAGTAGGTTTTGCAGAAAATTAAATATGAAGTTTCCTTTAAGGTG CTGATAGGATGTGCGGGAAAATATATTAGAGAAGGAAGAGGAGAGTAGCACAGGATCCTAATACTCAGTTAGGAGATTAGGATCAGTTAGGACAGTTTCA GTCCTAACTGTATAATAACAAGTGTGAGTTAGATGGTTGCTTTTGGGAGAGAGGAGGTTCTCCCAAATAAACCTTAGGATATTCATTGAAATTCTTCTAT TCTTCTACCTACTTCTGCATCATTATCACTTTGATAATGTTATAGGAGGTTAGTGTTCATCAATAAAATCTAGTTTTCCTTTCTATTCGTAAGTCAATTT TACCAGTTCCTATTAACTGTTATCAAAGTACCGATGTTGGCACTGTGGAACAATTTGGAGAGTTTATTGTTAACACGAGAATGGAAGCAAGGATCGAAAT TTTGGAGCTAGTGATGCAATGTTGGATTTGTGAGAAGGATGAACAAGAAAACATTATGGTTGAATGATTCCAAAAATTAGAAAACATGATCACTTACCTC AACGATGTGGTGGGAATATCACGAACAGACTCAAAGTTGAGATAACCCTATGACTGACTCTATGAACCGTGATTGAAACCCTGAGAGTCGCAAACAAAAC TGATGACAGTGTTACAATTTGATGAATGGGAAGCTGAAATACGGAAATTGTCAAATTGTCTGTTATTGTTCAACATTTGTTGATTGATTCCATGGCTCAT ACAAATTGTCAAGCTACATGGTTTCCCTTCTACTATTGTCTCTGATAGAGATCTTGTGTTCCTTCGCACTTTTTGGAGATAACTATTCAAGCAAGCGGAG ACAAAACTGAAATTCTGTACCGCTTACCATCCTCAATTTGATGGCCAAAGGGAGGTCGCAAATTGCTGCTTGGAGACATATATACACTACATGACTGGTT CTAAGCTCAAGCAACGACCAGATTGGTTAAGTTGGGCAGAATTCTGGTTTAACACTAACTATAATGCTTCTACCAAGATGTCTCCTTTCAAAGATTTATA TGGGCAATACTCTCCAGTTTTATTAAAGGAGACCACTATTCCCTCCAAGGTGGAGCAGGTAAATAAATTAGAAGAACAAAGGGACATGATCTTCAAAGAT TTAACGACTGATCTTTGTATAGCTCCCAGAATAGGTTACAGGCCAATAAGTACAGATATAGATGCAGTTTCACATTGGTGATTGTGTCCTTTTGAAATTA CAGTTGCACAGATTGAAATTCTTACCTAAGATATCTAATGCCAAATTGAGTCTGCAGATTTCTGGGCCCTACCAGATTTTGGAGAGGATAGGACAGGTCG CTTAAAAGTTGTAGCTGCCTGATAATAGTGGTATATACCCTGTCTTCCATGTTTCGTTACTCAAGAAAGCTATTCACCCTACTGAAATTTCACAATCTTG ATCACCAATGTTGTCGGATGAGCATGTGCTGGAAGCATTTCTGGATCAACTGTTAGATATAAGGCAGACATTACAGGGTGAGTTAGAAGTGTTGATCAAG TGGCAGCAGCTCCCTGTCCATGGAGGTGTATGTGTTGCAACTCTTCTTAGGTGTATGTTTTTTTGGAGTGATTAGAAGATGGCTAAGCTTTGTTGAGGCC GCTAAAGTCCCTTAACTATCAAGTTTTGACTTGCGATTGTCCATGGGTGTTTAACTGCTTTTATTTTAGCTTAGTGCACAATGCCTATCAAGTTGAAGAT ATGAAAACTTCAATCTGGGTCATCAATTGCAAACACATGCCAGCAGAGATAAAGAAGCAATATTGACATTCACTGAATTAGCTTTTCGTGCACTTGTAGA ATCTCGGTTCTCTGCCTTGAACTGCTTCAAACTGTAGGGAATAAGACCGCCGAGGAACCGAGCTCACAAACTGTTGACCATGTAATTGATGTTGCAAGCC AATTCTAAGTGGCAGATGTATGAAGGAAATTTATTTAGATGCATTAAAAGATTAGGAGGTCCATACTTGACAACTTGTTGATACCCATCACTTTGCAGTC CCACTTTTCTGAACTTAAATTGTATTTACCATGTAAGATTGTTTTTATATATTGTAATTCATGTGTTCATATGAGCACTGTGTCTGTACTTGTTTATCCT TTATCCTGTATTCTTTTTATCATGCAGTTTATGCAGAATTCTCATGTTTCTAATTCCCTTTTATTTAAAAAAAAATGAATTTTCTTTCAATTATAGCTTC AACT BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_183679; |
Additional information | - |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_519083
Blastp | - |
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Blastx | Transposon Tf2-6 polyprotein from Schizosaccharomyces with 27.1% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | Link to kegg annotations (SPAC27E2.08) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019459958.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |