Ll_transcript_289576

• Id Trinity: TRINITY_DN51316_c2_g2_i4
• Name Transcript: Ll_transcript_289576
• Sequence: CTTGTGATTGTGTTTTACATTCTTCTTCAGCTCTGTTATTTCCTGACAGTTATGTTAATATATATATCATTATTTTAAATTGCTATTATAGTTATTACAA ATTATTGTCATTATGACTGTTGTGCTATAAATGATAGCAATTGCAATGTTAATTATATTGTAAGTAAAAAATTGATATTGATGTCATAATATAATATTGT TATGGTCGGATCATTATGACTTGATGTCATACCATAATTGCAATATTGCGGCCTCATGAACCGTCCTCAATTTGAAATACTATATATGAAGTGTGTGAAA TAGATTATTCCATCTTCACACAAAAATGGGTAGGCTAGGTTTCTATCTTCCTGTAATAGGCATGATTGGGTTACAGATTCATTATGCAGCGCTTGCAATT TTCACAAGAGCTGCTTTGTTAGATGGCTTGAGTCCCACGGTTTTTGTAGTTTACAGACAAGGCATAGCCACCTTAACATTGGTCCCTATGGCTTTTTCGC CTAAGCGGAGACAATCTTTGAAGACTTCAATGGGATTAAGGAGCTTCTTGTTGATGTTTGCTACCTCTCTTATTGGCGTAACAGCAAATCAGAATGCATA TTTTAAAGGCTTATATTATGCATCTTCCACTGCAGCTACTGCAATGAGTAATCTGATACCCGCATTAACTTTTGTTATGGCAGCAATTGTTGGGTATTTG CTCTTCTCTCTCTCTTTTTTTATCGCCAATTGTTTAGTAGGTAAATATTAGTATGTTAGTATTTTTATTATCGATGAGATATCACCTCAACTTCCTTCAT CCTGACAATCAAACCACCTTATAACTCTCTTTTTGTTGATGGCGGAGCTCGAACCCACAACCTCCTGCACTCCGGTCCTTAAGACCATCATCTTCACCAT CAGACCACCTTATGACCCCTCACAAGCTTGACTCTTGTTGTTAGGAATTCATTTGTTCATGTGTTCCTTGGTTGGTTGTGTTAAATGGATTACAAACTTT CCAACTCATGTCTTCATATGAACTATTCGGTTGCATGTCGGATCATGGCTGTGACTTGTGATTTAAATACTTGAAGGCAAGGTCAATTTCATCCGTTTCT TCACATGCAGAAACACAATTCTAGCATGAATTGTTTTAGTAGGTTTAGTTTTGTGGTGAAATTTCCTTGGTCTAAACTCTAAACTATTTAAATTGCAGGC TGCATCATGTAATGGAGATGCAGTCGCCACAACCCCAACCATGGTCACATCTTGTAATTCCAAAGCCTAGCAATTCATTTTGCATAGATCAGATGTATGC CGGCTACGGCTAGAAGCTTGTTTTTTCATGGTAACTATTAGAACATGTGAGCCTAACTCCTCAAAATCTAGCTCATAGGGTGAGTGATGCCCGGACCTTA TAAGCACTATTTTGATCATATTCCCATTGGACATGGGACCATCTTAACAATAATGATTCGAAGGTTAATTAGGTTGTATTTGGACCGAGAACCACTTTTC AGTTCTGATTTCCTATGTTGTTTTTAGTTTGCTGTTTTTCATTGAAGATCAAATCTGAAAACAAACCCAAACCTCACTGGTAATTCCTGGATAAAGAAAA CTCCAGCAACCATTCTTATTCCTCTATGCTGGATGCGTATATGGGCTGAGTCAAACAAGGGTATAGATGTGCAAAGGGGATGGGATTTTTTCTCGATTCT ATTCGATTAGTAGTTCATGGGTATGAATTGATCCTTTGTAGTGGCCATATACTTGATTTTCTAACATTGTAAACTGAACTTTTTCACAGTAAATCAATGC AGTTAATGGTTGCTTCTATTTCTGTATGTTTCATTTATTAAAGATCTTCACCTTGCATCATTGAGTAAGCACAGTTTAGGATGAGTGATTCTTTTTTTTG GAAAAGAAATCACGGAAATAAATAAAATGGCATCGTGGTTAAGTGGAAACGCTGAAAGCAAGTTTTTAGCACTTTTGGGCCATAAAGCATTTTCCTTTAA GCCAAACTATACATAAGCTTTCTTTCTGTTTTCTTATGCAAATATTAAAACTTAAAAATATCTGAGTTATACCTTTTTTACTTATCTCTGCATGCCATTT TTCTGGAAGTACATGCAGTAAATTGATATACCATAGCCATAAGAGAACTAGTTTCAGATGTTCTTTAAAATCGGTGGTTTAATAAGATAGATACTATGTT CTATTATCCAAATGGAAAATTCTCGACACCGATATCTCATTTCTGTATTGCTATGTCAGCTACATACTTTTCCAGAAGGAAAAGTTTATCAAGACGATAC ACCTATAAGGCGATTGAAATGGGGAACTGCTAGTCTAATTGTTCGTGCACCTGTAACTCCAATCGTGTTGCCGATTGTGCATCATGGTTTTCAGGAGGTA ACTCTCAGCTTTATTCTGCTTTCCTTATAATATTTATCTGCTTGTAGACTTGTCCTACACCTATTTTTTCTAGTTACTTGATCTTGTCAGAGTAAAAAAA CCTCTCGAATAAGTTTGTTCTTCAGTTTTTAAACATTTTTAGAGGATTTGAATCTTTTAAATCGTCAATATTGTCTTTCAAGGAAGATAAAAAAATCTGT CGAAGTGATGACAATTTTAGTATTGGCAGAAAAGTGTCTTGCAAAATCACTTTAATTTGCAGATAGTAGTGACAATATGTCTAGGTTCTGATAACTAAAT GAAAATTTGAACAATGGCCTTTGAGATATGTTTGTTCTGGCTAGGACTTTTTTCCCTCAATGCTCATAAATTTTGCCATAGATAAAAGGCTTTAGATTTT ATTATCCTCCTGGATTATATTGACAGATTCTTATTATTATTAGTATTATCATTTGCAAGAAAAACAAATGATTGGTAATCAAAATAGTCAATGTAGAAAG ATCAATATTTCTACAATTGTTCAGAGTTATTATCATGTCTATCAAATTCTGGCTAGTTCTGATATGATAATTGAACAGTTGTGATGAGTGCTCATTTTTG TGTATAATAAATATAATCTGTTTATTGTTTTAAGTTGTATGTTTACTTTACTTATTAAATTGGAATAAGTTCGGCAGCGGATCACGAATATGGAGTCCAT TTTGAAATCCTTCGCCCTGCATCCCCGAGTATATGCTTCAACAAGAATCACACCGGTTTGTTTATTAACACTAGGTTCTTCTGCTTATTATGCTTGTAGG TGATGCCAGAGAAATTTATGCTTGGTAGAAGACCTCGTTTACCATTATGTAACAAGAAAA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_183998;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_289576

FPKM

• PAB: 0.1
• PNAB: 0.2
• PS1: 0.2
• PS2: 0.2
• PS3: 0.1
• PW1: 0.1
• PW2: 0.1
• PW3: 0

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_289576

• Blastp: WAT1-related protein At4g28040 from Arabidopsis with 51.69% of identity
• Blastx: WAT1-related protein At4g28040 from Arabidopsis with 51.69% of identity
• Eggnog: EamA-like transporter family(ENOG411087W)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G28040)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019453791.1)
• Pfam: EamA-like transporter family (PF00892.19)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;