Id Trinity | TRINITY_DN51319_c4_g1_i25 |
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Name Transcript | Ll_transcript_289858 |
Sequence | TATTATTTTAATCTTAAAATTGAACAAATATTACGTGGAGTAAAGGAGAATTACTAAAAAAAAGTAATAACAGAACAAAAAAGAAGAAGAAGAAAGAGAG AAAACAAGCACCTTCTGATGCCGCTGACTGCCACCTCACCTTGTCGATCATATTCGCACTTCATCTAACCCTCTCCGTCTTCTCCCTTTTACCACCCTCA TCGTCAATATTTGATTGTGTAATCTATACTTGTTGGTCAAGTTTTATAATACAAAGAAGCTTTAATGGCCAAGAAACCTGGACCAAGACCCAGTAAATTG TCTGTGTACCTTTACATTCCTAATATCATAGGATACATCCGGGTTCTTTTAAACTGTACTGCATTCTACCTATGTTTTACAAACAAAATATTGTTTTCTA TTCTCTATTTTTTCAGCTTTGTATGCGATGCTGTGGATGGCTGGGCTGCTCGCAAATTCAATCAAGGTATAAACTTTATTGTACAAATCTTAGTATCCGC TTATCTTTCCAAAAATCAGCTTAGATACTTATTTGAGAAGCATGTACCATTTCAATATGTGGTCCATGTACAAGGCGAGTCTTAGTGCTAATTTCAAGGT TGAGGATGATTTTGGTTCATATTGCTAATGACGATTGGCTCAACTAATATGATCGAACAGTAAATATAAACAGGCATTGGGTCTGAATCGTGGTGGTATT TCATTGGTAAGCCATGTGTAAGTACCATTGTAAGATCTCATTGAGACTTATGCCCTGACCATGGGGCAACCTTCCCTCTCCCAAAACTTTTACTTCAGAA AGAAAGTAATTATTCCATATAGTAAACGAATATATTAATCTTGCTTTTTTGTTTTGTAATGTTACTTTCTTGATTCAGTGTCAACCTTTGGGGCTGTTCT GGACATGGTAACAGACAGGTCATTCTCTACCCCCCCGGCATGCAAGCCAATGAAATGTGTTGATTGATGCCTGCAATGACTCTTTGTATTTTTCGATTCT TGTGTGCTATGAATTGATGTGGCTTCCTTAATACCAGAATTAGCACTGCTTGTCTCCTTGTAGTCCTCTCGCAAGTGTACAGGTAAAAAAATTCTCCTTC AAATATGTTCATTATTTGCTGTAATTATAAGCATGCACCTAACTTTTGGGGTGAAATTGTTAAGGCCTGGCTTGATTTTCTTGTCACTGCTGGCCTTAGA TATTGCCAGCCACTGGCTACAAATGTACAGGTAATGCATTTCAATTTTGTTTTTGCCTCCTCTAACTCTGATTGTATGATTCTAAAGTTACTGGGTTTGG TTTTGAAGAGATTCTTTTGCTCTATTTTTTACTTCAAATGTAGCACTTTCTTGCTGGGAAAGGCTAGCCATAAAGATGTAAAAGACAGCACTAACTGGCT TTTTAAGGCATATTATGGAAATAGGATATTTATGGCTTACTGTTGCGTTTCATGTGAGGTAATTGTAATTGATCTCTTGTGAAAAAACCGTTAATAAATA TAACGTTCTTTGAGAGGAGATCCACTTATTCCATGAGTAGGTTTAAAAAACTTATCCCCTTCTTGGCCATCAATTTTAAGGAGATCTAATGGTTTAGAGC TACTCACTAGTTCAAACCATTAGATTTCCCTAAAATTAATGGCCAAGATGTGGAGTAATTGGATACCCACCGATATTCTTTTGTTCATATCCTTTATATT ATTCTACAGGTTCTTTATTTAATTATGTTTTATCTTGCCGAGAAGCAAACAGATAAATTGGTGGATGTAAGTGGCTAAGTGATCTCTGTATTTCAGCAAT TAGATTATCTAATATGTCTAGAAATTTCTTCAGATCAACTTATTTTCTCAGTCGTTTAATTTCAGGTTCTGAAAATTAATTTGCAAAAAATATCAATACA TTCTTTCCTCATTGCTACAAGTTTATTTGGATGGGCAATCAAGCAAGTTATAAATATTATTCAGGTTCTTGCACAATTTACTTGGTTAATATATTTTAAG AGTTGAGGTCCGGTATACAAATAACTATGGAATGCGCTATTAGGAAGTATCTTGTGGCCAATGGTGACATTGGTTTCATTTGCAAAACCTTTGAATTCAT ATCTAGGATTGATTGTCAGACGATGTAATTGCCAATTATACGGCCTCATAACAAAATTCTTCAGAAAATTCAGAAACTAGTAAGTTATGTTTTTCCTCAG TCATATCTTGCTTGAGTTTTGTTATTTTATGAGAAACTAGCAAGTTATGTTTTCCCTTAACATGACTTGAAGATTGATTTAAATAGTTTTGTTCTTCACA GTCCACTTCTAGCCATATAAAGTATTAGAATTGTTTAACTAATTTACTTTGCTGCAATTAGTATGTGTAAATGCTATTCATTGATTTATTGTTTAAGTCT TGAAGTTTGATCTGCCTTAATACCCTTGTCGATTCAGATGAAAACAGCGGCAGATGTGTGTGTTCTTCATGACATTGACAAGAAACACAAGCAGTGATGT TTCTTCCATAACCAAGTTTTTGAGATCTCATTATCAAGTTTTTGAGATCTAACAGTAATACTAACACAAAATCAGTGCTCTGGATGGCAATTGAACTTGA ACTTTTCATTTTTCTATCATTTGTGATGAAAGAAATACAACAGTGTAGAATTAAAAATACTAGTTGTCCATGTTGTTACCAAATTCTAATAGCACAACAT TCACTGTTTTTTGTTTTTGTTCATTTTGATTTCTGAATCCCATTTAAATCTATGTTATCTGCTCCAGAGTAATAGGGGTACATTTGTATGTAACCTTGTG GACTTCTGAAACTCGTTTTAGGATAAACTGAATAAATGTCTATATTTCAGTTTCCTATTACAGTGTGAATAGGGCTACCTTATTATGGGATAAACTGAAT AGGGCTGCACCTTATTAT BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_184027; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_289858
Blastp | CDP-diacylglycerol--inositol 3-phosphatidyltransferase 1 from Arabidopsis with 80.43% of identity |
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Blastx | CDP-diacylglycerol--inositol 3-phosphatidyltransferase 1 from Arabidopsis with 76.06% of identity |
Eggnog | cdp-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase(COG0558) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT1G68000) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019412892.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |