Id Trinity | TRINITY_DN51344_c0_g1_i6 |
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Name Transcript | Ll_transcript_288317 |
Sequence | CTGGGTTGGTGTCAAATTAGTATTTTTTTCTTCTCAAAGGGTCGTGCTTTGACTTTCTACCAATTCCTTTTGTGACACATGTTGGTGTATTCTGCTCGTC TCAGTTCATGCAATTTAGGTTCTTAGTTTTTTGTACCAGGCATCAGAGAATTGAGGATATGATGGTGGCTATGATGTATAGAGGGGAGTAGAACTAGGGT TGGTGTTCAAAATGAGAAGGGAGCTAAAAGAGGGATGCCGAGCTTCGATTCTCAGTTACCCATTTCAAATGCACTGTATATTTCCTTTATGCTGATTTTT TGTTGCAAATGTTGGTTTTGATTCATAGTTTTAGTTATTTATCATGTATTTCTTGCCTATTTAGATTGAGATATTTCTTAGGCCTTTAATTTCACATTAG GGTTTATAGGATGATTCAAGGAATATGCAGAACACTGATTTTTTTGTTAATTGGGTTTGGGTCTCTAGCGTTTTGAATAAGTAATAGATGCTAAAGGTTC TATTATACATTCCGGTTTTTTTGAATTTAACTAAATAAACTAGTGATGCTAAAATGGACTTATGCAGTTATGCCCTTCTAATTGGAGCTAAATACCTTTC CTATATCTGTGAATGTGGGTTTGAATTCAAGATTGTAGGGACTATACCTAGAGATAATTTCAGCAAACCGCTTTGCTACTGCATTCACAATTTTAGCACA GTTGCCCTAGTTTAAAACTATAAACTTTCTGCTTCAGTCAGAAAGGCTGAACCAGACTAACTGTTCCATTTCTAATTCCCTTTATGGGTATAATAGGTTC ATTAGTTGACATGGGTATATTACGTTTCGAAATAGTAAATGTACTGCGAGATGAGTACCACTTATCTATACTTATTTTTATATTTATAAGAAGGTCCAGG ATGACCCCTTTCATAAATTTGTAATAGATAGCTTATAAATCTAGATAGAATGAGTTTTAATAGAAACAGTCAAACAGTACAGAACTGCTTGATGCATCAC ATTTTTTTTAAAAACTAATAAATAAATTAGTGCACTATTTAGTAGCTTAAAATAATGATGATATGACAAAAAAAATTATTAACTAAAAGGGCGGCTCAGT GCACAAGGTTCCCACCTGGTGGGATCTAAGAATGGTAGATATGCACAGCCTTACCCTTGCAAAGGAAGGGATCGTTTCCACGATTTGAACCCATGATCTC CAGGTCACAAGACAAGCAACCTTAGCATTGCGCCGAGGCTCTCCCTCAACTTCTTATTAACTACTTTTCAAATATCCTACCAATGCCTTATATGCGTTTA TAGAGCTTGGAGCATCCATAATCTTCCCTTCTACTAGTAGTCTAGTTTTACCACCAGATGCGTATTTTAACATATTGACTGACTTGTGTTAGCATGGCTT TCAGCTATACAAAGGGGAGCACAATCGATTCTTTTCATATTTCTGACTTTGGAGCATTTGATCAATCATACCGCATAGAGAATACTGTTTATCTGAGTAG AAGTAAGTACTCCTGTGCACCAACATGGTGAAGTTTACATGTAACAAACATATAATGATATGTTGTATAATTATCAAATCATCTTTACAGAAACATATTT TTTATCTGTCTAAATGATGCTTAATTATCATTTATTCAAAAAAGAGAAATACTAGGGATCTGTGTAATGGTTGCTTTTTGCAAGCTGTCAGTGTGTAGCT ACATGGCAAAATTTGCATTAAGAAAAGGAATAATTGCACTCGCACAGACATACCCATTCACTAATGTACACATGATGTTGCTGTTGGCTAAATAGCTGGA TATTCATGTCTATCATCTTGCTCATTTTTTTGAACTCTCGCTTACAAGTATAGACTTTTTTCTCCAGCTTTTCAGTCTCTAATTAATACTCGTGATATAT GATTCAGATTCAACTATTAATTTACTAAGTAGCGAATCAATTTCACGTGGTCCTGTTGATAAGGTGAGTTTTTAAAGTTATTTTCAACTGACGAGATTCC ATATTTGGTAACTAAGGTGAATCTTAGCTTGCTGCTGGCTACAGTATGTCTTATAAGAACTTTTCTCTTTTTCTCTTTAATTTAGTTGACAACTTCACTT GATAAAAGCCCATTGACGAACCAAACAGAGCCTCATAGGTTGCAATTTCAAAAGGAAAAGGTTCAATCATCAAATCCTCTTACTATATTAATTGGTAATA CTGAAAACTGGGAAGAGTCTGCCATGGCTGATGCCAGTCCTAGGACTGATATTTCTACAGATGCTGACACCGATGACAAGAATCAGCGGTTTGATAGAAG TCAATCTCTTGCTGGTGTGGCTTCTGACTCCAGTGACAGATCAAAGGATAAAACAGATCAGAAGAGTCTCCGCAGGCTTGCTCAGAATCGTGAGGCAGCA AGGAAAAGTCGTCTGAGAAAGAAAGCTTATGTCCAACAGCTGGAAAGTAGTCGTTTGAAGCTGACCCAGCTAGAGCAAGAGCTTCAGCGAGCTAGGCAGC AGGGAGTCTTCATATCAAGCTCGGGTGATCAAGCACATTCATCGAGTGGAAATGGGGCAATCCAATTTGATGCTGAATATGCAAGATGGCTGGAAGAGCA GAATCGACACATTAATGAACTAAGAGCAGCTGTAAATTCTCATGCAAGTGATACGGAGCTCCGCATGATTATTGATGTTATATTGGCACATTGTGATGAT ATTTTTAGGCTGAAAGGTATTGCAGCTAAGGCTGATGTTTTCCATTTGTTGTCTGGTATGTGGAAAACACCAGCCGAGAGGTGTTTTTTGTGGCTAGGTG GTTTTCGCTCATCCGAAGTCCTCAAGGTAAGCTTTTGCTGATTCCTTTCTTTCTGGTTCTCATGGTTTACTGAAAGGTATAAGGGGTTTTCCCGAGCACT ACGGTTTCCTTGTAACATAGAGAGTAATTTTCTCTTTTAAGATTTTGTAATCATTAGTTTATTATAAGATAGATGGTATATAACCTGATAACTTTGAGAA AGAGAAGTAAGTAAGTAATTATACACACTGCTAGTTGCTGCCTCGTATTGCTGGTTGATCAATAATCTAAATGAATAATGTCAGTATTACATAAAGCTAA GTTTGGTAAGACTTACTAATAGATTTTGGGTATGCTGTTTCTGGTGACACTGGGGTTGTAGTTGTGAGGTTTGACTTCTCTTGGAATAAGCATGGACTTA GACTTGTGACCACACACAAATGATAATGGTTTGATGGTTTATTTTTTCTTTTCTCTTCCTAGAACACGGCATTCCTTTTTATCTTCGAAGATCAATGGAA GTACTACTTTCATTATTTGATATGAACCCAAGAATAGAACTAAGAATTATATTAAAAAATGATTGAAAATGAACAAGAATAGGAGAGAAACTCTCCTCCA AGGGGGTTCCTCCTTTTCAAAGGCCTAACCGATTGCCAACTGAGACGAAACTCTGTTTTCCCAAACTAACAAAACCACTTAATAAATCTGTCCTCTTTAA TTTCATCTGTTTAACTATCTCACTCCACCAACTAACTACACAACTAAATCTGTCCTCTTCAATTTCATCTGGTTAACTATCTCACTCCGAGTGCCTAACA TTACTGGTGTCTGCTTATTCTTTTTATCTATATTTTGCCTTCATCAACTTTGGTAATTTTATAAGCAAACTTTTAATAATCTTTTCAGTTGCACATATAT GTATGTTATTTTTGAGATATAACTTCAATATGAACCTTTTTTTGCTGCATTAACACTTGCATGGTTTTGAAAAAATAGGTAAATTCCACTTTCTGCAAGT ACTTAAGTAATTTTGTAGTTCAAAATCAACTGAACCCTAAATCCGACTCATGGGAGCCAAGTGTAAGAAGAAAATGTAAAAAATAACATTTCATGGTATA TAGCTAAACAGCCATGATACAGAGGTAAAACCCGAAATATCCGTACTGTTAAAGTTCATACTCAATTTACTCATGGTAAATGCTTATACATGATTTGTAA GTTATTATGGAACTTCTTGTATCCATGTTTCTCATAATTTCAATGTAACCAACTTTTTATTCCCAAGGTGTTGAGTCGTTTTATAATTTCTTTACCTTCG TCTCCGTGTGGTTGCAGCTTCTGGTAAATCAATTGGAACCTCTCACAGAGCAGCAGGTAGTGGGTATCACCAACTTGCAGCAATCATCACAACAAGCAGA AGATGCATTATCTCAGGGAATGGATGCATTGCAACAGTCCCTTGCCGAGACATTGTCTACCGGATCACAGAACTCATCCGGTTCATCAGGGAATGTGGCA AATTACATGGGTCAAATGGCAATGGCCATGGGTAAGCTAGGGACACTCGAAGGGTTTATTCGACAGGCTGATAATCTGCGCCAGCAAACTCTTCAACAAA TGCACCGTATACTGACAACTCGCCAATCGGCTCGTGCTCTCCTTGCAATACATGACTATTTTTCGCGGCTACGTGCTCTCAGTTCGCTCTGGCTCGCCCG CCCAAGAGATTGATGGGTTTGGTAAATAGTCTGTTAAAAATTAATTTAATAGGTCCTTCACAATTGTAGTTTTTACTCTAAACAAGTTTCTTGTGTACTG TAGTCTTTGTATCACTGATATCAGTGTTTCATTGAGCAAGTCTAGAAATCAAATTTGTGAGAAGCAGTATGGTAATAATGTCCATTGTAGTTGTTGCTTT TTGTTTCATACAAAAAAATATTTGGGATATATGATAATTTTTAAGGGTTAGTTCAGT BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_184221; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_288317
Blastp | Transcription factor TGA6 from Arabidopsis with 76.24% of identity |
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Blastx | Transcription factor HBP-1b(c1) from Triticum with 69.92% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | Link to kegg annotations (AT3G12250) |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0000028) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019449314.1) |
Pfam | Basic region leucine zipper (PF07716.14) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |