Ll_transcript_287853

Id TrinityTRINITY_DN51354_c0_g1_i1
Name TranscriptLl_transcript_287853
SequenceGAAAAAATATTCGATAGGAGGATTAACCATATAATAGATATTGTGAACTTAGACATGATTGATTTTAGTGTAGACAGGAAACAAAAAAAAAACATGGACG TTGTTTGCATATTTTTGTGTGGTAGGTGATAGAAGGACCAAGGAAATGAAGCGTGGAACACCTTAACCATACCTTCAATTCCCACGTTCTCGGGTCTGAT ACACGTGGACCACAACATTGCATTGTGCGCTCAAGCTCCTCCAACCTTAACCCGAAAAAATCTATCTTCATTGTCTCTGTTCTCTTCTCTGTCACCATGT CTCTTCTACTAGCAGCTACACAAACACAATCTCTGTTAATTCCTTCCATCGCTTATCACAACAACAAATCTCAACCTCTTATCATCAAAGCCACTCGGAA TCGCTTTCCTTTCACCACAACGCGAAAAACCGTTCATTCTCGGCGTATTCTCTTAACATCTTATCTTCCAAAATCAGCTTCCATCAACGGAGCCTCCTTC CAGAACAATTCAGAAGCTTCGAATGAAGTCAATGCTACTGAATTTCTTCATAGACTCAGAAAATGGATTCAGTTGTTTCCTTCGATTTTGCCAGGTGGAA AATGGTGGGACCTATCAGATGATGATGTTAAGGTTCAGGTTCTGGCTCAACCTGTCACTGTGTGGCGTGCCTTGGCTAAAATGTGGGACCTTGTTTCTCG TGACCGGTGGGTCATTTTTGCTGCTTTCTCTGCTCTTATTTTCGCTGCGGTTTCGGAGATTTCAATACCGCATTTCATGACAGCATCAATATTCTCAGCA CAGAGTGCTGATGTTACGGTTTTTCACCGGAATGTGCGTTTGTTGGTTCTCATGTGTACAATTTCGGGAATATGCAGTGGGATCCGAGGTTGCTGTTTTG GCATTGCAAACATGATTCTGGTTAAGAGAATGAGAGAAACATTGTACTCTTCCCTTCTTCTTCAGGATATATCATTTTTTGACACTGAAACAGTTGGTGA TTTGACAAGTAGGCTTGGGGCAGATTGTCAGCAAGTGTCGCGGGTCATTGGAAATGATATTAACTTGATATTGCGCAATTTTCTTCAGGGGACAGGTTCA TTAATCTATTTGTTGACTTTGTCTTGGCAACTTGGTTTATCTACATTACTGATATGCTCCATACTAGCTGCAGTCATGCTACGTTATGGGAGGTACCAGA AAAAGTTAGCAAGGTTGATCCAGGAAGTCACAGCTTCTGCCAATGAAGTGGCTCAGGAGACATTCTCTCTCATTAGAACTGTCCGTGTTTATGGAACAGA AGAAGAAGAACTTGGAAGGTACAAATCGTGGCTGGGGAAATTAGCTGACATAAGCTTGCGACAAAGTGCTGCATATGGATTTTGGAATTTAAGCTTCAAC ACTCTTTATCATTCAACTCAGGTTATTGCTGTGCTGTTTGGAGGAATTTCTATTCTTGCGGGTCATATTACAGCAGAGAAACTTACTAAGTTTATACTAT ACAGTGAATGGCTAATTTTTTCAACCTGGTGGGTGGGAGATAATATCTCCAATTTGATGCAATCTGTTGGGGCTAGTGAAAAAGTATTCCATTTAATGGA TCTCGCATCTGGCAACCAATTCATATCTCGAGGCATGTAATTTTATGAGCTACGTTTCAACTATTTCATTGAGTGAACAACTTCATATTACGTTGTGGTT AACAGTAGAACATACCATCAGGTGCTTGGTGCCTTGTAGTTTGCAACTTCCTTGCATCCATTCTCACTTCTCTACCAATAATATTAGATAATCGAGAAGA AAAACAAGCTCATATGTTAGAAAATAGAAATAATGTATTCTTGCATAACTTTTCTCTTCTTTGTTTTAATTTTCCATATTTTGAAGTTTGGGCGTAACTT TATTACAGGAGTAAAGTTGCAGAGCTTAACAGGGCAAATTGAGTTTCTAAACATATCTTTTCACTATCCTTCAAGGCCAACGGTAGATCTCTATTGCTAA CATCTCATTTGAATCCGAGATTTTATACTTGCTTATTTGATGCTCTTTTTGCTCTCCAGTTGCTTCAGTAAAGGATAAATTATGATACAATAGAAATAAA AATTTCAATGCTAATTTTTTTGAAAACACTCCCCTCCCCTAAAAAATCGTGGGTTCATACATCAAGAGTGTATGCTGTTGACAGATAATCAGTGGTGATA TGGTATGCTATTATCATCTTTCTAGGAAAATGGATGTTTAATATTAACGTTGATTAAAAAAAATTATTTTTTGGGGTTGTGAGAAGAGTTTTTGGATCAG TGTATTATCTAATGCTTCCTCATTATAACACTGTGCATGTAACTTCATTCTTCAATAGAAATGAAATTTCTGAAGTGAGTGGAATGGTTTATATTCTGGG TATTATGTTGACATCTGAATTCTTCTGGCACCCTTCTCTTTCTCTCTTTGCATGGCTTTTTTAACCAGTTACATTCAGTTTTATTGTCCATCCACATGAG GTTAAGATTATCATTGTCAGTCATACAAGCTCAATTAATGACAGGGCACTGTAACAGGTACCGGTAGTGCAACTTGTAAACTTTGTTGTCTATCCCAGTG AGGTGGTTGCAATTGTAAGAAATTGCTTCTTGTCTCTTCAATTCATTCATTCCTTCCCTGTAATTTGGCTGAGATTATTATGTTGTTTCTTTTGATTTGG CATAGGTTGGTCTTAGTGGTAGTGGAAAAAGCACACTGGTAAACCTTTTGCTCCGTCTATATGAGCCTACAAATGGTCAGGTAGAGTTTGGTTTTCAATT CTCATTAAAACTGAGTGGATTTGATGTCAATGGAATATTTAACATGAAGTAGCAGACTAACCTCTATAGTTGGAACAAGTGCAAAGAGATGGAATTATGT TTTTTTTCATCCTTCACAAGAAAAAGTGTATGGAATGTCATGGTTTCTGATTCCAGCTTCTAAGGCCTTGGATTCAAATTTCCCTTGTGAAGTTATTAAG TTTCTCTTCAATTCTTCATTTTATTACATTCACAACCTAAGAAACACTTTGGTAGACTATATTGATTAGAGGCTTCTCTCTAAGAATTAGATATGAAGTA CTCGTAGCCAGATATTCTGGTAGTATTGTTAGAGCAGATACTTTCAACATGGCTACTTTCCTAACATGAAGTTTTGTTGCAGATTTTGATAGATGGAATC CCTCTTAAAAACTTGGATGTCATCTGGTGGAGAGAGAGAATTGGATATGTTGGACAGGAACCAAAGCTGTTCCGGATGGATATTAGTTCAAACATCAGAT ATGGATGTGCTCGAGATGTAAAACAGGAGGATGTTGAATGGGCTGCAAAGCAGGCCTATGCCCATGACTTCATATCTGCGCTTCCCAATGGTTATGAAAC ACTTGTTGATGATGATTTGTTAAGTGGGGGACAAAAGCAGCGAATTGCTATTGCTAGAGCCCTTCTTAGGGATCCGAAAATATTAATCCTTGATGAAGCC ACCAGTGCATTGGATGCTGAGAGTGAACATAATGTCAAGGTCTGCTTCTGGAAACTACTACAAGCCAGTTGGCAGTTTTTTTGTGTCTTGAATAATTGCT CACACTACTTTGAGCACAAGTAGTAATTCGACATGGTTAGGGTCAAGATTCGGTAGCCTTCCCTGACATTTCTAGGATTCAAACCCATTATATTATAGGC AAAGTTTGCCTAGAATCTAATATCGGGGGTTCAAATCTTGGAAGTCGCTACTATGTGGAAAGTTTTATCTAAACTACCAGCCCGAAGATTATTAGTCAGC TATGCCTGTGGAAAAAATAACAAGTTTGTCTGTGGTCTTGATCTACTTCCACCACAAGCAACCATTGTTGGAAGTTTGACACAGTAAATTTCATGTAAGA ACTATTAAGAAATGGTATTTATGCTTCAGTTTCCTTTATATATGTGCAGGGTGTTCTTCGATCTGTGAGAAGTGACTCCCATTCAAGGAGAAGTGTTATA GTCATTGCACACAGGCTTTCTACCATACAAGCAGCTGACAGAATTGTTGTGATGGACGGTGGTCATGTTGTTGAGGTTGGTACTTTGTTGATTCATTTTG AATGCCATAAATATTCATACATATTCTTTTTTGAAGCTTATTATCCCTGATATTTTCATCAGATCTGTTCCCTTTTTTTGGTAAATTGCACTTAGCTTCC CTTGTGGTTTGGCCTGAAATTGAAAACACTCTATCCCCTGTGCTGAACTTTGACATTTCTCCGCATTACGTTTTGAATAAGGATCAGATGTCTCAAAACC CAATCTCAAACCATGTCCCCTACAAACATATTTAGCTATGTAGTTTAAAAATGGTACACCATTTAATTACTATTTTAACAATTTAAAAAACATTACACTA TTAACATATTTTTATGACTGTTGTAGTTTTGCTACAACTATGATGAAAGAATGTTAACAATGTTATGTTTTTTAAATTATTAAAATCATTATAAATTGTT GTCTTTAAATTATGTGATTAAATATAATTGGTGGGGAGAGTTTGATATAAGGTGTGCCATTTTTATGTTGACCCATTCACCCATTTTCTAATTTTTAAAA TATTTTTGGATAAATGTGAATTTTCTTAAGTAAATATTATTTATTTATCTTTAAAAATATATAAAATATTTTCTGAGTTACTGCCTTGCATTTATTTTTT AGAAAAAAATATAAAGACTCAATTGTAAAATATTGGATTTCTATTTTTTAAATAAACTGATTAACAAAAGAAATTTTGAATCAATAATCAAGTGTAAACA ATGAGATGGTAATTTTTCTATTACAATTTATAAATGAGTAATCATATTGAAGTAGCTTAATTGAAGTTAAAAAATAGGTTGACTTAGTGTATAAAGCTCC CATCTAGTAGAATAATTGAACTCATGTTCTCTAATTGTTGAAGTTAGGCATAGAGGTGGCATTGAAATAGTGTGTTTGACTTTAAATTATGTCTTTGTAT TTTCTTAGAGCAATTATTTTATTTTGAATAAGTGCAAGACAATAATTGTTGTAGATATTTATATATTTTTAAAGATAAATAATTGATAGTTACTTTTTAA AAAAACTATCACAATTTGACAACAATTTGATTTAAAAACTTATAAAAAGCTGGAAGGGAGTCATTGGTTAACAATATAAAATACAAGGGGGTAAAGTATC TTAAGACCAAACCACATTGGGGTTAAATGCAATTTACCTTTCTTTTTGCAAAGTTGTTTGCCCCATTCCCAATCTAAAGCTCACAAGCATATCAAAAACT TGGGTTAGAAGGTTATACTTATTCTCTGCATGTCAATTTTATGTGTTTGAATTTGACTCCTCAGACTCTTCTGCTGTATCATGATAAGTGATGGTATAGC ATATGGGATAGAATCATGAAGACAATGATTGTTGTAATATTTTTGTCTTATCGTCATTAACTTGTGTTCTTGCAGAATGGAAGTCACAGAGAACTTCTAT TAAAAGATGGTTTATATGCAAGGTTGACCAGAAAACAGGCTGATGCCATGGCATGATTTTAGTTTTCCATAGCAGCAGATATTCTAAATGCAGAATAGTG GGGCAAGCAACTTTTTTTTACTTGCTAACCCATATAATTATAGCTACAACAAAAAATGGTGAAGTTTTAGTCAAGGAAGAAATGTGTGTATTGGTGCAGC AGATTCAGTTCAAAACCTCAGACAGATTTCACAATATCAGGTTTTCATGCATATGCAGAAAAGCATGAAATCAGGTTCATGAGGCTTATTGATCTTCAAG TTGCTGATAAGTTACAGTCTCTCATTCCAGTAGTGAACACTGCGACCATGCCTGAGTTATATCTCACTTTGTACTCAACTTGAAATGTATGTATATATTC TTTTATATATAAATAAAAATAATGAATAATTTGTTATTAAACTTCACTGCATTCAATCCAAAAAGTTTAAATATGTAGAAGTAAAACACCTTGAAGCATC TATAAGATTGGTGCAACATACAAGGAGTGTGTATGAGTAACCATGCAGAGATGATAGAAACCATAGTAATAATGAATTCTATTGAAAATTTCAGTAAGTG CACACATGTTCCTTTTTCCACTTCCCTGTAAGGCATCAAGATCTACTCTCCCC BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_184293; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_287853

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_287853
BlastpABC transporter B family member 26, chloroplastic from Arabidopsis with 71.24% of identity
BlastxABC transporter B family member 26, chloroplastic from Arabidopsis with 71.24% of identity
Eggnog(ABC) transporter(COG1132)
KeggLink to kegg annotations (AT1G70610)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019424169.1)
PfamABC transporter transmembrane region (PF00664.22)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;