Ll_transcript_287875

Id TrinityTRINITY_DN51354_c0_g1_i21
Name TranscriptLl_transcript_287875
SequenceGAAAAAATATTCGATAGGAGGATTAACCATATAATAGATATTGTGAACTTAGACATGATTGATTTTAGTGTAGACAGGAAACAAAAAAAAAACATGGACG TTGTTTGCATATTTTTGTGTGGTAGGTGATAGAAGGACCAAGGAAATGAAGCGTGGAACACCTTAACCATACCTTCAATTCCCACGTTCTCGGGTCTGAT ACACGTGGACCACAACATTGCATTGTGCGCTCAAGCTCCTCCAACCTTAACCCGAAAAAATCTATCTTCATTGTCTCTGTTCTCTTCTCTGTCACCATGT CTCTTCTACTAGCAGCTACACAAACACAATCTCTGTTAATTCCTTCCATCGCTTATCACAACAACAAATCTCAACCTCTTATCATCAAAGCCACTCGGAA TCGCTTTCCTTTCACCACAACGCGAAAAACCGTTCATTCTCGGCGTATTCTCTTAACATCTTATCTTCCAAAATCAGCTTCCATCAACGGAGCCTCCTTC CAGAACAATTCAGAAGCTTCGAATGAAGTCAATGCTACTGAATTTCTTCATAGACTCAGAAAATGGATTCAGTTGTTTCCTTCGATTTTGCCAGGTGGAA AATGGTGGGACCTATCAGATGATGATGTTAAGGTTCAGGTTCTGGCTCAACCTGTCACTGTGTGGCGTGCCTTGGCTAAAATGTGGGACCTTGTTTCTCG TGACCGGTGGGTCATTTTTGCTGCTTTCTCTGCTCTTATTTTCGCTGCGGTTTCGGAGATTTCAATACCGCATTTCATGACAGCATCAATATTCTCAGCA CAGAGTGCTGATGTTACGGTTTTTCACCGGAATGTGCGTTTGTTGGTTCTCATGTGTACAATTTCGGGAATATGCAGGTCAAAATCTTTGGGATCCGAGG TTGCTGTTTTGGCATTGCAAACATGATTCTGGTTAAGAGAATGAGAGAAACATTGTACTCTTCCCTTCTTCTTCAGGATATATCATTTTTTGACACTGAA ACAGTTGGTGATTTGACAAGTAGGCTTGGGGCAGATTGTCAGCAAGTGTCGCGGGTCATTGGAAATGATATTAACTTGATATTGCGCAATTTTCTTCAGG GGACAGGTTCATTAATCTATTTGTTGACTTTGTCTTGGCAACTTGGTTTATCTACATTACTGATATGCTCCATACTAGCTGCAGTCATGCTACGTTATGG GAGGTACCAGAAAAAGTTAGCAAGGTTGATCCAGGAAGTCACAGCTTCTGCCAATGAAGTGGCTCAGGAGACATTCTCTCTCATTAGAACTGTCCGTGTT TATGGAACAGAAGAAGAAGAACTTGGAAGGTACAAATCGTGGCTGGGGAAATTAGCTGACATAAGCTTGCGACAAAGTGCTGCATATGGATTTTGGAATT TAAGCTTCAACACTCTTTATCATTCAACTCAGGTTATTGCTGTGCTGTTTGGAGGAATTTCTATTCTTGCGGGTCATATTACAGCAGAGAAACTTACTAA GTTTATACTATACAGTGAATGGCTAATTTTTTCAACCTGGTGGGTGGGAGATAATATCTCCAATTTGATGCAATCTGTTGGGGCTAGTGAAAAAGTATTC CATTTAATGGATCTCGCATCTGGCAACCAATTCATATCTCGAGGAGTAAAGTTGCAGAGCTTAACAGGGCAAATTGAGTTTCTAAACATATCTTTTCACT ATCCTTCAAGGCCAACGGTAGATCTCTATTGCTAACATCTCATTTGAATCCGAGATTTTATACTTGCTTATTTGATGCTCTTTTTGCTCTCCAGTTGCTT CAGTAAAGGATAAATTATGATACAATAGAAATAAAAATTTCAATGCTAATTTTTTTGAAAACACTCCCCTCCCCTAAAAAATCGTGGGTTCATACATCAA GAGTGTATGCTGTTGACAGATAATCAGTGGTGATATGGTATGCTATTATCATCTTTCTAGGAAAATGGATGTTTAATATTAACGTTGATTAAAAAAAATT ATTTTTTGGGGTTGTGAGAAGAGTTTTTGGATCAGTGTATTATCTAATGCTTCCTCATTATAACACTGTGCATGTAACTTCATTCTTCAATAGAAATGAA ATTTCTGAAGTGAGTGGAATGGTTTATATTCTGGGTATTATGTTGACATCTGAATTCTTCTGGCACCCTTCTCTTTCTCTCTTTGCATGGCTTTTTTAAC CAGTTACATTCAGTTTTATTGTCCATCCACATGAGGTTAAGATTATCATTGTCAGTCATACAAGCTCAATTAATGACAGGGCACTGTAACAGGTACCGGT AGTGCAACTTGTAAACTTTGTTGTCTATCCCAGTGAGGTGGTTGCAATTGTTGGTCTTAGTGGTAGTGGAAAAAGCACACTGGTAAACCTTTTGCTCCGT CTATATGAGCCTACAAATGGTCAGGTAGAGTTTGGTTTTCAATTCTCATTAAAACTGAGTGGATTTGATGTCAATGGAATATTTAACATGAAGTAGCAGA CTAACCTCTATAGTTGGAACAAGTGCAAAGAGATGGAATTATGTTTTTTTTCATCCTTCACAAGAAAAAGTGTATGGAATGTCATGGTTTCTGATTCCAG CTTCTAAGGCCTTGGATTCAAATTTCCCTTGTGAAGTTATTAAGTTTCTCTTCAATTCTTCATTTTATTACATTCACAACCTAAGAAACACTTTGGTAGA CTATATTGATTAGAGGCTTCTCTCTAAGAATTAGATATGAAGTACTCGTAGCCAGATATTCTGGTAGTATTGTTAGAGCAGATACTTTCAACATGGCTAC TTTCCTAACATGAAGTTTTGTTGCAGATTTTGATAGATGGAATCCCTCTTAAAAACTTGGATGTCATCTGGTGGAGAGAGAGAATTGGATATGTTGGACA GGAACCAAAGCTGTTCCGGATGGATATTAGTTCAAACATCAGATATGGATGTGCTCGAGATGTAAAACAGGAGGATGTTGAATGGGCTGCAAAGCAGGCC TATGCCCATGACTTCATATCTGCGCTTCCCAATGGTTATGAAACACTTGTTGATGATGATTTGTTAAGTGGGGGACAAAAGCAGCGAATTGCTATTGCTA GAGCCCTTCTTAGGGATCCGAAAATATTAATCCTTGATGAAGCCACCAGTGCATTGGATGCTGAGAGTGAACATAATGTCAAGGTCTGCTTCTGGAAACT ACTACAAGCCAGTTGGCAGTTTTTTTGTGTCTTGAATAATTGCTCACACTACTTTGAGCACAAGTAGTAATTCGACATGGTTAGGGTCAAGATTCGGTAG CCTTCCCTGACATTTCTAGGATTCAAACCCATTATATTATAGGCAAAGTTTGCCTAGAATCTAATATCGGGGGTTCAAATCTTGGAAGTCGCTACTATGT GGAAAGTTTTATCTAAACTACCAGCCCGAAGATTATTAGTCAGCTATGCCTGTGGAAAAAATAACAAGTTTGTCTGTGGTCTTGATCTACTTCCACCACA AGCAACCATTGTTGGAAGTTTGACACAGTAAATTTCATGTAAGAACTATTAAGAAATGGTATTTATGCTTCAGTTTCCTTTATATATGTGCAGGGTGTTC TTCGATCTGTGAGAAGTGACTCCCATTCAAGGAGAAGTGTTATAGTCATTGCACACAGGTAGTACTTTGTATTGTCAGAGTCATTTATGGTATCACAATT ATTAGTTTTGAAGTTAAAATGCATGAACTGGTTTTCACAGGCTTTCTACCATACAAGCAGCTGACAGAATTGTTGTGATGGACGGTGGTCATGTTGTTGA GGTTGGTACTTTGTTGATTCATTTTGAATGCCATAAATATTCATACATATTCTTTTTTGAAGCTTATTATCCCTGATATTTTCATCAGATCTGTTCCCTT TTTTTGGTAAATTGCACTTAGCTTCCCTTGTGGTTTGGCCTGAAATTGAAAACACTCTATCCCCTGTGCTGAACTTTGACATTTCTCCGCATTACGTTTT GAATAAGGATCAGATGTCTCAAAACCCAATCTCAAACCATGTCCCCTACAAACATATTTAGCTATGTAGTTTAAAAATGGTACACCATTTAATTACTATT TTAACAATTTAAAAAACATTACACTATTAACATATTTTTATGACTGTTGTAGTTTTGCTACAACTATGATGAAAGAATGTTAACAATGTTATGTTTTTTA AATTATTAAAATCATTATAAATTGTTGTCTTTAAATTATGTGATTAAATATAATTGGTGGGGAGAGTTTGATATAAGGTGTGCCATTTTTATGTTGACCC ATTCACCCATTTTCTAATTTTTAAAATATTTTTGGATAAATGTGAATTTTCTTAAGTAAATATTATTTATTTATCTTTAAAAATATATAAAATATTTTCT GAGTTACTGCCTTGCATTTATTTTTTAGAAAAAAATATAAAGACTCAATTGTAAAATATTGGATTTCTATTTTTTAAATAAACTGATTAACAAAAGAAAT TTTGAATCAATAATCAAGTGTAAACAATGAGATGGTAATTTTTCTATTACAATTTATAAATGAGTAATCATATTGAAGTAGCTTAATTGAAGTTAAAAAA TAGGTTGACTTAGTGTATAAAGCTCCCATCTAGTAGAATAATTGAACTCATGTTCTCTAATTGTTGAAGTTAGGCATAGAGGTGGCATTGAAATAGTGTG TTTGACTTTAAATTATGTCTTTGTATTTTCTTAGAGCAATTATTTTATTTTGAATAAGTGCAAGACAATAATTGTTGTAGATATTTATATATTTTTAAAG ATAAATAATTGATAGTTACTTTTTAAAAAAACTATCACAATTTGACAACAATTTGATTTAAAAACTTATAAAAAGCTGGAAGGGAGTCATTGGTTAACAA TATAAAATACAAGGGGGTAAAGTATCTTAAGACCAAACCACATTGGGGTTAAATGCAATTTACCTTTCTTTTTGCAAAGTTGTTTGCCCCATTCCCAATC TAAAGCTCACAAGCATATCAAAAACTTGGGTTAGAAGGTTATACTTATTCTCTGCATGTCAATTTTATGTGTTTGAATTTGACTCCTCAGACTCTTCTGC TGTATCATGATAAGTGATGGTATAGCATATGGGATAGAATCATGAAGACAATGATTGTTGTAATATTTTTGTCTTATCGTCATTAACTTGTGTTCTTGCA GAATGGAAGTCACAGAGAACTTCTATTAAAAGATGGTTTATATGCAAGGTTGACCAGAAAACAGGCTGATGCCATGGCATGATTTTAGTTTTCCATAGCA GCAGATATTCTAAATGCAGAATAGTGGGGCAAGCAACTTTTTTTTACTTGCTAACCCATATAATTATAGCTACAACAAAAAATGGTGAAGTTTTAGTCAA GGAAGAAATGTGTGTATTGGTGCAGCAGATTCAGTTCAAAACCTCAGACAGATTTCACAATATCAGGTTTTCATGCATATGCAGAAAAGCATGAAATCAG GTTCATGAGGCTTATTGATCTTCAAGTTGCTGATAAGTTACAGTCTCTCATTCCAGTAGTGAACACTGCGACCATGCCTGAGTTATATCTCACTTTGTAC TCAACTTGAAATGTATGTATATATTCTTTTATATATAAATAAAAATAATGAATAATTTGTTATTAAACTTCACTGCATTCAATCCAAAAAGTTTAAATAT GTAGAAGTAAAACACCTTGAAGCATCTATAAGATTGGTGCAACATACAAGGAGTGTGTATGAGTAACCATGCAGAGATGATAGAAACCATAGTAATAATG AATTCTATTGAAAATTTCAGTAAGTGCACACATGTTCCTTTTTCCACTTCCCTGTAAGGCATCAAGATCTACTCTCCCC BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_184293; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_287875

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_287875
BlastpABC transporter B family member 26, chloroplastic from Arabidopsis with 77.62% of identity
BlastxABC transporter B family member 26, chloroplastic from Arabidopsis with 67.46% of identity
Eggnog(ABC) transporter(COG1132)
KeggLink to kegg annotations (AT1G70610)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_006574634.1)
PfamABC transporter transmembrane region (PF00664.22)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;