Ll_transcript_288879

• Id Trinity: TRINITY_DN51357_c3_g1_i5
• Name Transcript: Ll_transcript_288879
• Sequence: TTAGGATTGTGCCAACCTTCAAGATATACAAAAACGGAAGTCGGGTGAAGGAAATCTTATGCCCTAGTCGCGATATGTTAGAACACTCTGTGAGGCATTA CAGCTTATAACACTTATGACTTGTACTGCTTCTCTCTGTTATCTTCGGCATTTCCCTTGTTCTTGCTGCCGAAACCTCCGGTTAAGCTCACAAGTCCCTC CGGTTAATCTAGTATGTTGATCCAACCTATAATGATCACCTGATACCTCTGACATAGTCAAAACCAGATAATAATCTTAAGCAGCCAATGCCATTGGAAC CCAGAGATAGTCTCGTACCTTTTCGAGTTTCTATTTATTCATTCATTACCCATTGCTCTATGGTTCCATATTCCTCCCAACTCCCTTTGTCAATTTCCTT TCTCTCTTCTTTTCAGTTCACTAGGTCAGCTGTTCTTGTATCACTAGTTTCTTAAGTTCAAAAAACAACCAAAAAATCGGTTTTTGTAGTTTTTGTATGT ACAATTGATTCAATTATCAACTTAAATTAAGATAGACAGGTATATACAAATATAAACAAAAGAGAAGGGAGGGTTGGTTTGTTGTTAGAGGGGGATCTAT ACATGTATGTATGCATGTAATGATATATACTAAACACCAGAATCTATACATGTATGTACCTACTACCTAAGTTAGCCAAAGGAGGATGAATATGCTGTTG TTATTATTACTATTTTTCTTCCTGTCTTAGCCATTTAATCAATAAAAGTTCCCATTTTTTGTTATCCTCCATGCTTTTTATTTACTTCAAGTAACATTTG AGAGACATGTTAGAATGGTACTTTGCTCTATGTTGAACATGTTTTATAAATACAACAGAACATGTACTTTATTCTGGTCTGTTCACTCTACCATAAAGAC CAAAACCATACAAGTGATGAGTGTTGAGAAGGAATTGTCCTATGTATTGGGCAGAGGTTTGAAAAGCTGACTTGGTCTTGGGATTGGAAATCATTTGGTT ATGGCATTTAATTTGATGTCGGTTGTAAAATTGTTAGTATAAAAGTTTATACACAATCATTATATTATTTATCATTCATTTGTATTATTTATATTTAAAA GTTAACGATGATCAAATATGAATGATGAATGATACAGTGAGAGTGTAAAAATAGTATACATCTTTTGCTATTTGTTATGTTTGATACGTAGAGGCAAGGT AACGTGTGTTCTTAAATGAAGGTTGGTTATGATATTAGAGGGGAAGTGGACTTTGACCCTTTATCCCTTTACACTTTCCTATATAATGAAAGGTGGACCA CTAATTCCTGTTTGATTTTTAATACACTGAGCAAGCTTGTTTATATAGCTAAGTTGTGATGCTTGAAAAGCACTAAAGCAGAATAATAAAACTAATGAGA GAGGTTGCCCTTTGAGGAAAGGGGTTATGTTCACATGTGGGCATTTAAGAAGTTGCTTCTTCCAAAAGAGGGCACTCAAAGCTACCATAAAAGAGTCCAA AAGGTCATATTGGTGGGTGTTTGAACTTTGATGTGTTGCTCTTCATATTAGCTGTGTTGTGTGATATGTGAAGGCAAGTCATTCCAATTGGTGGTGGGGC TTGATTAGATGATTGCCATTCTTTGTGGACCTATTCAAGGTCATTGCCACATGAAGTATATTCACTATTCATTTTTAGTTTTTATAGATTTCCATATCTG ATTTCATGTATATGTAAAAATAAAA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_184314;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_288879

FPKM

• PAB: 0.4
• PNAB: 6
• PS1: 3.1
• PS2: 3.8
• PS3: 2.5
• PW1: 4
• PW2: 2.2
• PW3: 1

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_288879

• Blastp: -
• Blastx: TPR repeat-containing thioredoxin TTL1 from Arabidopsis with 78.79% of identity
• Eggnog: TPR repeat-containing thioredoxin(ENOG410ZSQA)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G53300)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019425252.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;