Ll_transcript_382077

• Id Trinity: TRINITY_DN51401_c2_g1_i12
• Name Transcript: Ll_transcript_382077
• Sequence: GCTTCGTTATCCTTGGGTGCACCATCACCAGTAGTTCATCCACCTATGCAACTAACATCTTCCGCGTTGAGGAATGGACTCTCATCCGGAGCAAAGACCA AGAAGCCAAAACCATGTACAATTACCTTCGACATGAGTTACTAGCAGAAGCCACGTTGCTAATCGAGGAGGTTCTTCGGGTGCCATTGCAACAAATGGAC TTGCTCCTTCCTCTTATGATCTATTGATTGGAAAAAAGTTTGGACAAGGTGGCCTGATGATAATCACTTCTATGAAGTTGTTATTACTAATTATAATCCT GCTGAGGGACGACATGCTTTGGTCTATATGATATGAATTCAGTAGATGAAACATGGGAGTGGGTCAATCTCAAAGAGGTAAAATTCTTGCGATATTCTTC GGTCTGTGGTAAATGGTAATTTTGTAGATGAAACATGATGACTATGTCTTATATGTTGAATCTCAATCCTTGAAATGGGCATGAAAGATCTTATAAATTT AATAAGATAAACATTATATTTCTGTCTTAATAAATGTAGTTGTTTTTGTGGATGAAGGTATTGTCATATAGTCAATATCCTTGGTTGGTTTGAGCCATCA TTGTGGGTGATTTCCTTTGTATAAGTATCTATAATTGATGCAAACAAATAAACTTCAATCTTATATATGATAATTCATTCTAAAGTATAGATCAGGCTAC AATGCAGTAACATACTCATGTTTTTGTTCTCTTAGTTTTATCAGGATGTTCATTAAGCTTGATGCTGCAATTGTTAACATTTTTGTAATGCAACTTTGCA TTTGCTTCCTGAAGCCTTTGTGACTGGCTTTCTCTCTAATTTGTGCTAGAGAAGTTATATGGCCAAATACTCAATGGTTTGGCCAGCAAACCAGCTTGAT AATATTGTAACTTCTTTAAAATCAGAATCAATCAATTGAGATGTTGTTAATATATAGAAACCTTCTACTTTCATTAAACCTCCTCGTGTTTCCATCTGTC AAATCGTGCCATAGTAATATCAAAACATTAATAAGCTTGTTCTTCGCATTAATTGGTTACAATCAGTGAGATGTAGTCTTTATTTTAATCATACACCAAT GTTAAGACAATGCACTACCTTGAAATTAAAATCTTCTTTGCAATTAAAATCCATGCACTAGATAAAGTAGTAATTATGAAAAGTTAATATAGACGAGTGT GCCTAAAAAAACATTCAAAATGTAAGAATTGTTTGCTATGCATCTGATGCTTTGTAATCTGGCTGCTTTGAAGTTCGATTGATATGTTATCCTAATATGT ACCCACTTGTATCCAATGGTTAGCTAATTTGTTCAATTAAATTCAATTTCATTAAACAATTATTTGTACCCACTTTTATATTTTGGTTACTCTTTCATTT TTTCTTATTAATTGATCATTGTTCAAGTAGTCTTGTTTCATTATTGTGTTGTTAATCTCATACTTTCCACTGTACCACAAATCTCAAAACTTTCAAGGTG GTGATGAAGTGATGAAATGGCCAAGACTAGATATTCCATGTGATTATGCGTGAAATTTTTACTATAGAAATATTAATATTTGTGTATTTGTCTTTCCCCG TAGTTGTTAACCGAATTTGGAATGCTTCAACAATTGGTTTGGATGATACATATTATATTAACTTATTAATGCTCGTGTATTTGTGAATTATTTTAAGAAG GTGGTGATAATTTGAGATTTTGGGTCCAATTTCTT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_184681;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_382077

FPKM

• PAB: 0.7
• PNAB: 0.5
• PS1: 0.1
• PS2: 0.8
• PS3: 1.8
• PW1: 1.1
• PW2: 1.9
• PW3: 0.3

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_382077

• Blastp: -
• Blastx: Protein EMSY-LIKE 3 from Arabidopsis with 43.24% of identity
• Eggnog: Chromosome 11 open reading frame 30(ENOG410YF3T)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G13020)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019451063.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;