Ll_transcript_380070

• Id Trinity: TRINITY_DN51411_c0_g1_i16
• Name Transcript: Ll_transcript_380070
• Sequence: AGAAAACCTGTTATCCCAGCAGAACACCACCCAGAATGCAAGCCTTGCAACTCTAAACAAAGCTATGCAGAAATATGATAGCAGTAGAAGTTCTACACAT TTGTCCCAATGGACTCTTGCAACACACAAGGAGGAGTCTGAGGATGAATCACCCCAACAGCCATATGATAATGAGTCAGTTAAGACAAGTGACATATGGC CTAGACCGGATGAAGCTTCATCGGCATCTCAGCACAAAAATGTGGTTGATTTAATTCAGGAAGATTTTCCCCGTACAGTGTCCCCGGTATATAATAAGTC TCTTTCCATAAGTCGCGGACTCGTGGATGAACCAATTGACTTAGGTGCTGGTTCCACTTCTTCTCATGATCCTCCTGTCACTACAGCAGAGGCTGCTAAA CCTGCTGGAGGTGCAGATGAAAGAAGTGTTTTACCAACTGTTGATTCTCATGCCCCTGTTGCAAGCTCATCATCTATTGAATCCACAGGCAGCGTGGGTT TTAGTGACATAGATGTTACGGCTGTTGAGTCTCAGCTAAAGGCTCTTAGTGTATCTAATATACCAAATTTAGAAAGCATGAGTAATGAAGAAAAATGGAA GACCAGCTACCAGAGTAATTTGATGCAACACCAGAAATACCACCAACAAAACAATAAATATGAAACACCTGACGCCAATTCTCAAAGTGTAAATTCTGCC TATGTTGGTAGGGAACAGTTTCCTCGTAATTCCAGCAAGTTCTCTGATGTCCAACCAGTGCTGCAGTCATCTGGGATTACACCTCCACTATATGCCACTG CGGCTTATATGACCTCAGCAAATCCATACTATGCTAATTTGCATGCCTCGGGCATATATACTCCACAATATGTTGGTGGATACACCTTAAATCCCACAGC TATTCCTTCATATATTACTGCATATCCGCCTCATGGTGCCGTACCACTTGCTGTCGATGGGGCTGCTAGTTCTAGTTATACTCCCCTACCACCAGGGGTT TCAACCAGGGGAAGCGTTTCATATGGAGCTGAAATGGTACACGCAAACAAGTTCCCTGGACACTTTGGATTTCCTATGCAGCCTTCTTTTGGTGATCCTT TTTACATGCAATGTCATCAGCAACCTTTTGTGGAGGGGTATGGTATTCCTGGTCGTTTTGATCCACTGGCACCTAGACCAAGTGGTGGTAGCCAAATTAG TCCCTTTGATTCGCAGAAAAGTCCCAGTACTGGTGCTTATTCGGATGATAAAATATTGCATGATCAGAGAGCCAGTATTAATATGAATTCAAGAAGAGGA GGATTAACAATTCCTAGTTATCATGGACACCCGCCAAACATGGGTTTTGTAATGCAGTATCCAAGTTCACCACGTCCTAGTCCACGTCTGTCAGGATACC CAGAAGCAAGTCCCGCCCTTCAAGGACGGAGGAGTGAAATGAAACCTTTGCCAGCTTCTGGTAGAAATATAGGTGTATTAATTGGATGGCAAGGCCAGAG ATACCTTGACAGTACTCGTGACCCCAAAATTGTTAATTTTCTCGAGGAATTAAAATCTGGCAAAGGTCGCAGATTTGAGCTATCTGATATTATTGGTCAT ATTGTTGAATTTAGCGCTGATCAGCACGGTAGTCGATTTATACAGCAAAAGTTGGAATGTTGTGGTGTTGAAGAGAAGGCATTGGTGTTCAAAGAAGTTC TCCCACATGCTTCAAAATTAATTACTGATGTATTTGGTAATTATGTAATACAGAAGTTTTTTGAGTATGGAAGCCCTGAGCAGAGGAGAGAACTTGCAAA TCAGTTGGCTGGTCAGATACTTACTTTAAGTCTGCAGATGTATGGCTGTCGTGTAATCCAAAAGGCACTTGAGGTTATTGAGCTTGAACAGAAAGCTCAG CTTGTTCGTGAGCTAGATGGAAATGTAATGAAATGCGTTCGTGACCAAAATGGGAATCATGTAATACAGAAGTGCATTGAATCTATTCCAACCAAACAAA TTGGCTTCATAATATCTGCATTTCGTGGTCAAGTTTCTAATTTATCAATGCATCCTTATGGTTGCCGAGTCATACAGAGAGTTCTAGAGCATTGCACAGA CGAGGTTCAATGTCAGTTTATTGTGGATGAGATATTGGAGTCAGTTTGTTCTCTTGCTCAGGACCAATACGGTAATTATGTTACCCAGCACGTGTTGGAG AGAGGAAATCATCAGGAAAGGAGCCAAATCATTAGCAAGCTGTCAGGACATGTTGTTCAGTTAAGTCAGCATAAATTTGCGTCAAATGTTGTCGAGAAAT GTTTGGAGTATGGTGATGTCAATGAACGGGAGCTGTTGATTGCAGAGATTGTTGGGCAAGATGAACAGGACGATAATTTATTGACAATGATGAAAGACCA ATTTGCAAATTATGTGGTCCAGAAGGTTTTCGATATGTGTTCTGAAAATCAGCGAGCAAAGTTGCTTTCTTGCATAAGAATTCATGCTCATGCTTTGAAG AAATACACTTACGGAAAACACATCGTATCTCGGTTGGAACAGCAATTTGGAGATGAAAATCCAACACCTGGAGCATAATAGCAATGTGGATTATACACAT GTAAGTGCTGCTGTGGCATGCAAAACTCGAGCATATATGTTTTTCTGATGATGATATTGATCTTTGAAACTGCTGATGAATAAACCATTATTACTACTCA TGTGACTTCATAACTAGACCTTGATAGCTTCGGGAGCACATATGTTGTCCCATAAATTGTGCCAGTGTATGTACCATCTGTGTGACAGATTGGTTGAAAA AATGTTTAGTTAAAAAGTTAATAATTAACTATTTTCCTGACCAATACAGCCAGCTGGCACATACAGTGGGACAACTTACGGCAGCAGATATGTACTGGAT AGCTACCAAATTAATGTCTTTAGGAAACAATTAGTGTATGTACATCTATAGTGTGGAACTCAATGTAATTATGTGATTTTGAATAATTGATTGGAAATAT TGTTTCTGTATAGTTGTTTGGAAGGGAACTCTTGTTTATGTAAGATTTATTATTGGATCTTCTCTGCCTAGTGCTTAGTGTGTGGTTTCGTTTGGTGTTT CCATTGTCCTTATGATTGCATGTTGTTTTGATTTCTTCC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_184743;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_380070

FPKM

• PAB: 8.8
• PNAB: 6.2
• PS1: 3.8
• PS2: 4.3
• PS3: 7
• PW1: 9.2
• PW2: 10.1
• PW3: 8.9

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_380070

• Blastp: Pumilio homolog 6, chloroplastic from Arabidopsis with 48.47% of identity
• Blastx: Pumilio homolog 6, chloroplastic from Arabidopsis with 48.64% of identity
• Eggnog: pumilio homolog(COG5099)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G25880)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019439368.1)
• Pfam: Pumilio-family RNA binding repeat (PF00806.18)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;