Id Trinity | TRINITY_DN51416_c5_g2_i4 |
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Name Transcript | Ll_transcript_381526 |
Sequence | AGTAAAGTAAGTGGGTGCTCCTCTTGCTGGGTGGAGTGGAGCTTTACGCAATTCCATTATTACACACTCCATCCACCAAAGAATCTTACTTTCTCTCTGT CTTATCTAATTTCCATTATTATTATTTTCTCTATTTTTTAATTCCATTTCCATTCCACGTTCCTTCTTATAATCATTACATGCCAAATCTTCTCTCAAAA CCCTTCTCTTCTCATTTCAATTTTTATAGCTAAATCATGATAACAGAAGAAAATTTATAAAAAAATAAAATAAAATCTTCTGGTAAGTTAGGTGAAAACT TTCTTCTCCATAATCAATGGGCAACGTTGGAAGTAGTAGCGGTGTTAACAACCGTCGTAGATCTAGCGGCAGTGGCAGTGGGCGACGGATTCATCCGCCG CCTCCGCCACCAGTGACGTCTCAGCCGGAAACCACGGCCAACCGGTACATGTACCCGGCGTCTGCCACCATGCCGTATCACAACTACCCTGGCTACTATC CCCCTCCACCGCCAACTATGCCGATGCCGTTGCCGGCTCCGTATGACCACCACCACCACCGTCCGGTGATGGACCCAATGTGGGGGCGATACCCGCAACC GCAGCTGCAAGTGCCGCCGCAACCGCCTTTGCCCTATGTGGAGCACCAGAAAGCGGTTACAATAAGGAATGCTGTTAACATTAAGAAGGAGACTCTGAGG ATTGAGCCTGATGAAGAGAATCCTGGGCGTTTCGTTGTGTCGTTTATGTTTGATGCCACCATTGATGGGAGGTAATTCTGTTTTCCCTTATTTGATGGTA AGAATTCGTGAGATATGAGCCTTACCCACAAGTGAAGAGGTTGTTTCTGCTGTTGGGATTTGAACTAGTAATACTAATATAACTAACAAGGTTTGGTATA ATGGTGTAAGACTCTGCTTGATCCCAAAAAAACTAAAAGGTTCAGAGTTCGATTTCTGTGAGCGACACTTGTTAGTAGGGACAATCACACACTCTGGAAC GGATTAGTTCCTTACCTATGGAGTAAGGGATACTCTTGGTAGTACCAAAAAATAATAAAAGTAACATAAAGAAGTGCTGCCCAGTAGATCATGCTCTCAC TTACCGGGCTCTGAGGAATATAGATGTATGCAGCTTTACCCTAACAATCGGGAAGAGAGGCTGATTCCAGAGTGACAATAATAACACTGGACAAAATTTA GTGCTGTTTTTTTGTGTGCTTGCCATGCTTTCCAAGAAACATGCCTAACATATATCGTAGACATGTTATATTATTATATTTTTATTGGAGAACAACACAA GTAGTCAAGCACAAAAGAAAATAATATGGATTGGGGTGTGGTTATTTGTTGCATCCATAGTCACAAAAGAATCCTAATGATGCAGCTTGCATCATTTGAA TGCTAATTGTGTTCTAGATTCAAAGTTTTGGAGAGCTTGTTGGATAGGAATAGGATGCTGTTAGAGTTAAGCTCATCGAGATTATACATGGTTTAACTAC TTACTTTACTTACTAGCCATCATTTTTCACTGCTGTATGTATATGCTTTTTAGGCTTGTCACTATGTCATAATCTGTATTGATATGCTCAACTATTTAAA CTCTAATGGTAGCTAGAATTTTTAAGAAATGGGCTTTACAAGTTACCAGTTAGGGAAGTATGGGTTTTTATGTACTTATCAGAACATCTTAGTGTAGGTG GCATAGAAAGTGTAAAAGTGGCTTGTGATGTAAAGATGTCCAAAGAGTAGCATTTCCAAATGAAAAAATAGATATAAGCAGATATCTACTTCAAATAACT TGGTATTTTATAGTTGAGACTTTAGATAGCTCATTGACTTTTATGTAGCTGAGTAGCTATTGTTTTTGTTTTGCATCTATGTTGTGATTTAATGAATAAG CATATTTATGTGTTGCTACTTGCTAGGGTTCAGTTTCCTCTAAGAATCTGGGGAGTCCGATTGAACAGCAGAGTCAATTGTTGCTAAAAGTTTCCAGCAG GACAGATTATCTTCATTTCATAATCAACATTTCTTATAAGTACTATTTTGTGTGCTTTTTATAAAAAAATCCATTTGATATATTCTGGATTGCAATCTAA TAACTCATGGTTGCATCTATTTGCAAACGTCCACTCAGTTTTTTGAGAGTACCTTTTTAATCCTTTTCACTTTTTGGAAGTGAAGAAATTATGTATTCTA TTTTGCATGAACTGGTGTTTTTTAACAATTGAAAGTGAACTTATTTAGTACACATTAATGGCAAGTATGATGGTTTTGAGAAAATAGTTGTCAATATTGC TTTAGTATGCTTGAAAGCAGAGGTTTATTGTGCCTGAACATTGGTTTATAGACCATGTACTGTCTGATATACTTATGCTAATAGCTATTGTTACTTTCAA ATCACTAATCTTGGAGTGAATGCTATTTCTGTCGGTTTAACTGCAGTTTTGTTTCCAGTAACACTGACTAGTTAAGACTGGAAGGAGGCCTTATTAAAAG GAGAAACTGCTTCTATAGTAGTTTGATTGTTTGAGGTTTAATTTTGAACTGACAGGGCACAATGAGAAATTGGTAGATTATAGAGTATTATGTGCAGTGA GTCAGTGACAAGGCACAATGAGGTTCTATGTCAATTACATTGTTGGATAGTCTGGTCCCTTTGTATTGAAGGATGTGCATGTAAAATACCAGCATAATCA TATTTACTTCTGAAAAATACATGTTCAAGGATTTTAACATTTATTGTCCACCCTAAAGGTAATTCTCTGCATCGCCGATTGTTATGCCATTTCTGTGGTT TTTTTTTCCATAACCTCATGATAAAGATTTTGAATGTGGACATTTTGTCCACTCTAAAGGTAATTCTCTGAATCATCGATTGTTATGCCATTTCTGTGTT TTTTTTGCTATAACCTCATGATAAAGATTTTGAATGTGGACATTTTGTGCTATAGTTCTTTATTTGATCTGAAGGTTTTACTTTCTTTTTATCTCCATAA CAGCATCACCGTAATTTTCTTTGCAAAAGAAGGTGAAGGGTGCATCCTTACACCAATGAAGGAAGACAGTCTTCCACCTGTGACTGCAAATTTTCAGCAA GGTCTCGGGCAGAAGTTTAAACAGCCTGCTGGAACTGGTATTGACTTTTCAATATTTGAGGAGTCTGAGCTGTTGAAAGTGACTGACATGGATGTCTATC CTCTAGCCGTTAAGGCAGATGCATCCTCTCACGATGGTGATGGATCAAATGAAACTCCAACATCTGGTAGCACAAACTTGCAGATAACTCAAGCTGTGTT TGAGAAGGAGAAAGGTGAGTTCCTTGTGAAGGTTGTAAAGCAGATCTTGTGGGTGAATGGAATGAGGTATGAGCTGCAGGAGATATATGGCATTGGAAGT TCAGTGGAGAGTGACTTGGATGGAAATGATCCAGGAAAAGAGTGTGTTATCTGCTTGTCAGAGCCCCGGGACACAACAGTCCTTCCCTGCCGCCACATGG TATTTTACAGTTTCACTTTTTGAATAAACTTCCTTCATTGGTTAATAGAATGGTGACGATGATAATCATCAATATCATGAGTATTAATGTACTGAAAGTG TGAAATGATATCCATGATTGTTGCTTCCATATTCCTTCAACCATCAGAATGTTGTCACTCCTTTTTATTCAACAACCTTTAAATTATTTTGACGTGTTAG TCTCAGCAAACTGATGATTAGTTGCTCACCTTTAATTGTGTATAAAAAGGTTTTACAATTGTGGTCCATTACCGCAATCGAGAATAAGGCTGCAATTTGT GGTTCTTGTTGTCTCCACAACCGCATCCTTAATTGCAATTAAAAACCTTGGTCGAAAACTACGTAATCAGTCCTTGAGTCCTTCTTGATATACTTTGGCT GGATTTGTTTCCCTGTTTCAGTGCATGTGTAGTGGATGTGCTAAGGTTTTGAGGTTCCAAACAAACAGATGTCCAATCTGCAGACAACCAGTTGAGAGGC TTCTCGAGATCAAAGTGGGTCCAGAGCCTGAAGAGTGAAGATACAAGTGTTTGTGACTCAAGCTTCCTGTACAGTCCAATTGTAATACTTAAAACTTTTC CCTTACCTTCAAAAAAGTGAATAATGGAATTTATATATATGTTGTTTGACATGGAGGCGTTGCTCCTAACTTGTATAATTCAATGCCTCCACTATGCTTG TTTGGTTTTACTTCTAATGTTTATATTGACATTCCTTCTAAATATAGTCAAATGCATTATTCACCTTCTCTTGGGACTTGACATCTTTCGGTTTTTCCTT TGTAATTGCATGTTTTGTAATCTTCAAAGAAGGATTGATATTATGGCTAGTATTTTATTATGTCTTCTTCAGATATCTTTTCTAGTTCCAG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_184771; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_381526
Blastp | Probable E3 ubiquitin-protein ligase LOG2 from Arabidopsis with 66.09% of identity |
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Blastx | Probable E3 ubiquitin-protein ligase LOG2 from Arabidopsis with 62.96% of identity |
Eggnog | RING finger(ENOG410XRAE) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT3G09770) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019432624.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |