| Id Trinity | TRINITY_DN51471_c0_g1_i19 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_380327 |
| Sequence | ATGAAACACCCCTAATCGAATATGCCTATATTTTAAACTAATACAATTTAGGTTGAAGATAAAATATTAGTCTAATACATGAAGGATATCAAAAACAGAG TAACACGAATCACATAGAGAAAGTGGAAGAGCCACCGTTTCCTCCTCCACCGCTATCATCTCTCTTCCATTCCCAGCTCTTTTCTTTTCTCGGAGCTCCA ATTTTTGAAATTCGGATCTGGTTCTTTTGATCTGTGTTGTGTTGTCTGTGATGGAAGAAAACATAATTTGCCAGTGGAGCGTGTTTAGATCTCTCTTAGC AATCCTTCAATGGTGGACTTTCAATGTCACTGTTATTATCATGAATAAGTGGATCTTCCAGGTTTCATTTTTTAATTTACCCTTCTTTTTTCTATTCTAA TATCTTGCTTATTTATTTTTAAATCTGATCGTATTTATGTGATTTTCATTTCAAAACCATAAGATATATTTATTATTATTATTATTATTTGGTTACGTTG TAGTTTTTTATTTGTTTATTAATACATGGAGGCTGGATAATTTTGTGATCTCCGGAATTCTGGTAAGATTTTCACATTAATGCTGAAGCTTGAAGCTTTA AATTAATATATTAAACTCACACGAACTATAAACAATATTGTAATTTGGTGATTTTTGACTTCATTGTTTGATGTTAGCTCTTGATTCATTGCATATCTGG CTTGTTCACTCAGCTAGGCTTGTTCCAGTGCTAAAATTATGGTTTTCTGTAATGAAAAATGACCGATGTACCCTTGTCGCACGATAATCCGAAGTTATTA AATTAAATGTTTGGCTGTCCATGTTGGAGCTTAATAGTCTGGATTCTGTGAATTTTGATTTGCTCTGTCTGACTTAAAAACAATTATAATATATGAATTG TGTTGTTCATTAGTTAAAAATGTAACATATCAACCGCTGAAAAAATTACATCTGGGGATTGAGAAATCTGAAGCAATTGGAACACCAATCGGTGAATCAA TTCAACTCCTCCTCATCCTGATCAGTAATCACAGGGCATCTCCTGTGAATTACAATCATCTATATGAACTGTGTCGTTGGTAATCATTGAACAACCCTTT TTTTAATATTGGGCTGTATCATAGGAATTAAAACAACTAAGATATGCACAATCCTGAAAGTAGATGTTGTAGATCAGCATAATTGTGTCCTTGAAATTAA AATTAATTGTCCAGGTGGTATGTAGTAATTGATTTATAACAAATTAAAATTCTTTTGTTAATGCCTTTAGGAAGGTTTGTGTTTTTCCTCCCGCAGTTTG GGCATTCCTCAGGAATATAATTCTTTGCCCTTAATTTCACCGTTTCCTAGTAGGTGTTCAGGGAAGGTCCACCAACATTCTTATGTTATTTTATTAGTTC TCAGAATGTTTCATTATACATAGATTTGCGGCAAAAAGCTTTTTCTTAGGACCTTAAACGATTCTGATCACCTCACTAAAGTAGTTAGGTCTTTTTTGTT CTTTGTTCCATTTGTCAGGAAATGTTTTTATCTCCACATATGTACATTCATTTCCTTCTTGCTCACCTTGGCCCCTCAACCATTGTAATAAAAACTTGTA TTGATTAAGACAAATGCTTTAAATTTTAATATTTTATGCTTTTTCAGAAATTGGAATTCAAGTTTCCCCTATCAGTGTCCTGTATCCATTTTATCTGCTC ATCCATTGGAGCATACGTGGTAATTAAGATGCTGAAGCTTAAACCACTGATACATGTTGACCCTGAAGATCGCTGGAGAAGAATCTTTCCAATGTCATTT GTGTTCTGTATTAACATAGTGCTGGGCAATGTGAGCCTACGATATATTCCAGTTTCTTTTATGCAGACCATAAAATCATTCACACCTGCAACAACAGTTG TTTTGCAATGGCTAGTTTGGAGGAAGTATTTTGAGTGGCGTATTTGGGCTTCTCTTATACCCATTGTTGGAGGGATACTTCTTGCTTCTGTTACAGAGCT TAGTTTTAACATGTTCGGATTTTGTGCTGCCTTATTTGGCTGTTTGGCTACATCTACAAAGACTATCCTTGCAGAGTCTCTTTTGCATGGATACAAATTT GACAGGTGCATAATTCATGCTTTGCCTTTCTCTATTGTTTGTATTTTTATAATTTTCTGTTCTGTCTTTCCTTTCTCTCTGGAATTTTTCATGTGTAGAC TTTCCTGTTATTTATGGGTCTGTAATTCCCATTCCTTGTGTTGGACAACAGCTTTTTTTAACCACCTATGTTGACTCTATTTGTCCATTTCTTTATGGGA TTTGGAGAACTAGAGCTAGTAAGTTGTTTGTATTGGAGTCGAGAACTTTTTAAGTGCTGCTAAGTTTGATCACAGCACCTGCTATCAGTACCCATGAAAC ATGACAGCTGATGTATGTTTGCCGAATTTTGCTGGATTTTACGCAAAAGATGGATTTGGTTGATTTTGTTTCTTGGACCTATAATGTCGAAGTTCCTCAT TCTTGGTCATGATCTGTATGTATGTGTTTATATATGGAAATTAAAGATTGGGGTTTGTAATAACCACCTTGTCTAGTGTTTGCTAATATTTTAAAGATTT GTTGAGAGTGACAAAATGGAAGCATAGTGATGCTGAAGCTGAAGCAACCCGAGCCTCCAACAATCCACCCTCTGGAGTTATTTCCTCTCATGTATGAAGT GCGTCTTGCAAAGAATCGTCGGAAAACGATTTCTGATGCACTATCTGCTAATGTTGCAGTGACGTCTCCATCACATCGATCTCCTCCTCCGGTTTTGTCT TCAAATCAGTCCCATTCGTCTCAGCTGTTACCATTGTCTTCGCAGCTTCCTTCTCGTCCTGAATTTCTACAGTCCTATGGTAGCTATGGAAGTTATGGTA ACTAAGGTGGTGATTATGGGGGACGCTGTGTTGTTGGTGAAATTGCAGCAGTGTTGTGTTCATATCATGTTTTTGGATGCTTCTGTCCTTTTTAATGGGG GTGCAATCTCTTGGGTAAGGGAGAGGGAAAGGTGTTGCAGGACCAAGCCTCCAACACCAACTTCACAACCATGTCTCAAAATTGCGTTACAAGCTGGCGA TGCTTCCGTCCTTACTCACTATGTCCTAAATGGACTGATATAATGTACCCAAAAAAAATGGACTGATATATGTAATATTCTCTAATTTCCGTGATAATAT TAGTAACTTTTATGCAAGATGTAGATCTTGCTTAGCTCTGTGTCAATTAGCTTCCATAGGTTGCAATCAGTAACAGGACTCTTGAGGATGGAAATCTTTC CTTTTGCAGTTAAGCAGTCTGTGTTGTATAGCATTTATGATCAAAATCCACACTGGTGCTGACTTTTCAATATTTTTTTGTGTGTATCCTTTAATGCATC AATTTTTAAAGAAAAAGAGAAGCGTTTCCCTTGGGTAGGTGGTGATCTTTATCATTCTCTTTATTGCCTGTATAATCACATTTGTCTTAGTTATGCTATA GCATGTTCTATTCCATGCTTGTGCACATTTCTCTGAATTGCTTTGGCATGTTTTGTCTTCAGTACATAGCCTAATTCGTGTTTTGTATTTGTAGCATAAA CACAGTTTATTACATGGCACCTTTTGCAACCATGATCTTGGCGATACCTGCTATGTTACTTGAGGGCAATGGGATTCTTGAGTGGCTAAGTATTCACCCA TATCCTTGGTCAGCCCTGATAATCATTTTGACTTCTGGGATTTTGGCATTCTGCCTTAACTTCTCCATTTTTTATGTGATTCACTCCACCACTGCTGTAA CGTTCAATGTTGCTGGAAACCTTAAGGTAAGATCTATCTGGCAGATCGCTTCAAGCCACTACTATATTATTTAGCCAACATGAAAGTTTATATTCTTTCT TTGTCAACCTGTTCAATTCATGTATCCCTTAACAAAGTTGTTTGTATTTTCCTTTTCCTGTTTAATACCTGGAGATACTTAACCGTGATTTCTTAAAATC ATAGTTATTGTGTGTTTCCGAATTAACATTTATCATGTTTTTGTGCAGGTTGCAGTTGCTGTCCTTGTTTCTTGGCTAATATTTAGGAACCCAATTTCAT ATTTGAACTCTGTTGGATGTGCTGTGACTCTTGTTGGATGTACATTCTATGGCTATGTCAGACATAAAATCTCCCAACAGCCACCACTTCCGGGGACTCC TCGGACACCCAGAACACCTAGGACTCCTATGAGTAAAATGGAGCTGCTTCCACTTGTAAATGATAAATTAGATGATAAGGTCTAATTGTTGGTCTAACTA CAAAGCATAAGGTTTCTGCCATTTGGAATGACATTAACAACAACAAAAAAGGCGTCCAGTATACGAGGCAGGCTCCCACCTAGTGGGGTTTGAGGAGCGT AGATATATGTAGTTTTATCCCTGCATGCGGACTTGCAGGTACAAAAATATAAGTGATTATGGTTATTTGTTCTTTTAGATTACCCACAGTTTTAAATAGC ATCAGGGTCATCATCATTAATCATTATTATTATTACAACTATGGTTCAAGGCTTAAGTCCTATGTTTGCAGTTGAACACCAACACTGTATAGTACTGTCT GTTATCATGTGATTCAGTGGTTCACAAAAACAAAAAAAGAATAGAAATTTATTGAAAGTTCCACCAAATAAGAAGAAATTTATTGGCATTGATTGTTAAT GGTTCACTTGTATTTCAATTACAATTACCAAAAATGAAAAAGTGGTGGGATTTAATGCTCATGTCAGAAACTTCTACCCCTGTGCATTGTGGTCCTTCAT CTTTATATGGCAATGGTGATAGTCCGTGATTGATATAAATTTGTTAGTT BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_185145; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_380327
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | UDP-galactose transporter 1 from Arabidopsis with 94.19% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019430579.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |