Ll_transcript_380312

• Id Trinity: TRINITY_DN51471_c0_g1_i7
• Name Transcript: Ll_transcript_380312
• Sequence: ATGAAACACCCCTAATCGAATATGCCTATATTTTAAACTAATACAATTTAGGTTGAAGATAAAATATTAGTCTAATACATGAAGGATATCAAAAACAGAG TAACACGAATCACATAGAGAAAGTGGAAGAGCCACCGTTTCCTCCTCCACCGCTATCATCTCTCTTCCATTCCCAGCTCTTTTCTTTTCTCGGAGCTCCA ATTTTTGAAATTCGGATCTGGTTCTTTTGATCTGTGTTGTGTTGTCTGTGATGGAAGAAAACATAATTTGCCAGTGGAGCGTGTTTAGATCTCTCTTAGC AATCCTTCAATGGTGGACTTTCAATGTCACTGTTATTATCATGAATAAGTGGATCTTCCAGGTTTCATTTTTTAATTTACCCTTCTTTTTTCTATTCTAA TATCTTGCTTATTTATTTTTAAATCTGATCGTATTTATGTGATTTTCATTTCAAAACCATAAGATATATTTATTATTATTATTATTATTTGGTTACGTTG TAGTTTTTTATTTGTTTATTAATACATGGAGGCTGGATAATTTTGTGATCTCCGGAATTCTGGTAAGATTTTCACATTAATGCTGAAGCTTGAAGCTTTA AATTAATATATTAAACTCACACGAACTATAAACAATATTGTAATTTGGTGATTTTTGACTTCATTGTTTGATGTTAGCTCTTGATTCATTGCATATCTGG CTTGTTCACTCAGCTAGGCTTGTTCCAGTGCTAAAATTATGGTTTTCTGTAATGAAAAATGACCGATGTACCCTTGTCGCACGATAATCCGAAGTTATTA AATTAAATGTTTGGCTGTCCATGTTGGAGCTTAATAGTCTGGATTCTGTGAATTTTGATTTGCTCTGTCTGACTTAAAAACAATTATAATATATGAATTG TGTTGTTCATTAGTTAAAAATGTAACATATCAACCGCTGAAAAAATTACATCTGGGGATTGAGAAATCTGAAGCAATTGGAACACCAATCGGTGAATCAA TTCAACTCCTCCTCATCCTGATCAGTAATCACAGGGCATCTCCTGTGAATTACAATCATCTATATGAACTGTGTCGTTGGTAATCATTGAACAACCCTTT TTTTAATATTGGGCTGTATCATAGGAATTAAAACAACTAAGATATGCACAATCCTGAAAGTAGATGTTGTAGATCAGCATAATTGTGTCCTTGAAATTAA AATTAATTGTCCAGGTGGTATGTAGTAATTGATTTATAACAAATTAAAATTCTTTTGTTAATGCCTTTAGGAAGGTTTGTGTTTTTCCTCCCGCAGTTTG GGCATTCCTCAGGAATATAATTCTTTGCCCTTAATTTCACCGTTTCCTAGTAGGTGTTCAGGGAAGGTCCACCAACATTCTTATGTTATTTTATTAGTTC TCAGAATGTTTCATTATACATAGATTTGCGGCAAAAAGCTTTTTCTTAGGACCTTAAACGATTCTGATCACCTCACTAAAGTAGTTAGGTCTTTTTTGTT CTTTGTTCCATTTGTCAGGAAATGTTTTTATCTCCACATATGTACATTCATTTCCTTCTTGCTCACCTTGGCCCCTCAACCATTGTAATAAAAACTTGTA TTGATTAAGACAAATGCTTTAAATTTTAATATTTTATGCTTTTTCAGAAATTGGAATTCAAGTTTCCCCTATCAGTGTCCTGTATCCATTTTATCTGCTC ATCCATTGGAGCATACGTGGTAATTAAGATGCTGAAGCTTAAACCACTGATACATGTTGACCCTGAAGATCGCTGGAGAAGAATCTTTCCAATGTCATTT GTGTTCTGTATTAACATAGTGCTGGGCAATGTGAGCCTACGATATATTCCAGTTTCTTTTATGCAGACCATAAAATCATTCACACCTGCAACAACAGTTG TTTTGCAATGGCTAGTTTGGAGGAAGTATTTTGAGTGGCGTATTTGGGCTTCTCTTATACCCATTGTTGGAGGGATACTTCTTGCTTCTGTTACAGAGCT TAGTTTTAACATGTTCGGATTTTGTGCTGCCTTATTTGGCTGTTTGGCTACATCTACAAAGACTATCCTTGCAGAGTCTCTTTTGCATGGATACAAATTT GACAGGTGCATAATTCATGCTTTGCCTTTCTCTATTGTTTGTATTTTTATAATTTTCTGTTCTGTCTTTCCTTTCTCTCTGGAATTTTTCATGTGTAGAC TTTCCTGTTATTTATGGGTCTGTAATTCCCATTCCTTGTGTTGGACAACAGCTTTTTTTAACCACCTATGTTGACTCTATTTGTCCATTTCTTTATGGGA TTTGGAGAACTAGAGCTAGTAAGTTGTTTGTATTGGAGTCGAGAACTTTTTAAGTGCTGCTAAGTTTGATCACAGCACCTGCTATCAGTACCCATGAAAC ATGACAGCTGATGTATGTTTGCCGAATTTTGCTGGATTTTACGCAAAAGATGGATTTGGTTGATTTTGTTTCTTGGACCTATAATGTCGAAGTTCCTCAT TCTTGGTCATGATCTGTATGTATGTGTTTATATATGGAAATTAAAGATTGGGGTTTGTAATAACCACCTTGTCTAGTGTTTGCTAATATTTTAAAGATTT GTTGAGAGTGACAAAATGGAAGCATAGTGATGCTGAAGCTGAAGCAACCCGAGCCTCCAACAATCCACCCTCTGGAGTTATTTCCTCTCATGTATGAAGT GCGTCTTGCAAAGAATCGTCGGAAAACGATTTCTGATGCACTATCTGCTAATGTTGCAGTGACGTCTCCATCACATCGATCTCCTCCTCCGGTTTTGTCT TCAAATCAGTCCCATTCGTCTCAGCTGTTACCATTGTCTTCGCAGCTTCCTTCTCGTCCTGAATTTCTACAGTCCTATGGTAGCTATGGAAGTTATGGTA ACTAAGGTGGTGATTATGGGGGACGCTGTGTTGTTGGTGAAATTGCAGCAGTGTTGTGTTCATATCATGTTTTTGGATGCTTCTGTCCTTTTTAATGGGG GTGCAATCTCTTGGGTAAGGGAGAGGGAAAGGTGTTGCAGGACCAAGCCTCCAACACCAACTTCACAACCATGTCTCAAAATTGCGTTACAAGCTGGCGA TGCTTCCGTCCTTACTCACTATGTCCTAAATGGACTGATATAATGTACCCAAAAAAAATGGACTGATATATGTAATATTCTCTAATTTCCGTGATAATAT TAGTAACTTTTATGCAAGATGTAGATCTTGCTTAGCTCTGTGTCAATTAGCTTCCATAGGTTGCAATCAGTAACAGGACTCTTGAGGATGGAAATCTTTC CTTTTGCAGTTAAGCAGTCTGTGTTGTATAGCATTTATGATCAAAATCCACACTGGTGCTGACTTTTCAATATTTTTTTGTGTGTATCCTTTAATGCATC AATTTTTAAAGAAAAAGAGAAGCGTTTCCCTTGGGTAGGTGGTGATCTTTATCATTCTCTTTATTGCCTGTATAATCACATTTGTCTTAGTTATGCTATA GCATGTTCTATTCCATGCTTGTGCACATTTCTCTGAATTGCTTTGGCATGTTTTGTCTTCAGTACATAGCCTAATTCGTGTTTTGTATTTGTAGCATAAA CACAGTTTATTACATGGCACCTTTTGCAACCATGATCTTGGCGATACCTGCTATGTTACTTGAGGGCAATGGGATTCTTGAGTGGCTAAGTATTCACCCA TATCCTTGGTCAGCCCTGATAATCATTGTCACCTCTGGGGTTATGGCGTTCTGCCTTAATTTCTCCATTTTTTATGTGATTCACTCCACCACCGCTGTAA CATTTAATGTTGCTGGAAACCTTAAGGTTGCAGCTGCTGTCCTTGTTTCTTGGCTAATATTTAAGAACCCGATTTCATATTTGAACGCTGTTGGATGTGC TGTGACTCTTGTTGGATGTACATTCTATGGTTATGTCAGGCATATGATCTCCCAACAGCCACCAGTTCCAGGGACTCCTCGGACTCCTCGGACACCCAGA ACACCTAGGACTCCTCTGAGTAAGATGGAGTTGCTTCCACTTGTAAATGATAAATTAGATGATAAGGTCTAATTGTTGGTTTAGCTATTCAGTAAGAGGT TTCTGCCATTTGGAAGGGCAGTAATAGCAGAAGGTACAAAAATATAAGTGGTCTTGGTTATTTATTCCTTTAGATTACCCAGGTTTCAATATATGGTTCT TTTTTTAGTTCCTCAAACTTTGTTTTATTTTATTTATTTACTTTTTCTAGGGTATGATGCTTCATTTTTACTAGCTGTTTAGCCACTAGTTTTCTGCTGT TTTCTGATAGAGTACAACCTAAATGGGAATGGGACCTTTGATAATTGATACTGCTAATTGTTATCATCATTATTATGTATTTGTTTTAGATCCAAGGTTC AAGGCAAAGTTCCTTGTTTGCAGTTCAACACAATAGTGTATAGAACTGTCCTAGGCATGTGATTCAGTGATTCACACAAAACAAAGGAATAAAAATTTAT TGAAAGTTCCACCAAATAAGAAGAAATTTATTGGCATTGATTGTTAATGGTTCACTTGTATTTCAATTACAATTACCAAAAATGAAAAAGTGGTGGGATT TAATGCTCATGTCAGAAACTTCTACCCCTGTGCATTGTGGTCCTTCATCTTTATATGGCAATGGTGATAGTCCGTGATTGATATAAATTTGTTAGTT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_185145;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_380312

FPKM

• PAB: 3.7
• PNAB: 4.1
• PS1: 3.1
• PS2: 2.6
• PS3: 3.5
• PW1: 3
• PW2: 3.4
• PW3: 2.6

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_380312

• Blastp: UDP-galactose transporter 1 from Arabidopsis with 80.39% of identity
• Blastx: UDP-galactose transporter 1 from Arabidopsis with 94.19% of identity
• Eggnog: solute carrier family 35 member(ENOG410XP1S)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G77610)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019430579.1)
• Pfam: EamA-like transporter family (PF00892.19)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;