Id Trinity | TRINITY_DN51471_c0_g1_i8 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_380313 |
Sequence | ATGAAACACCCCTAATCGAATATGCCTATATTTTAAACTAATACAATTTAGGTTGAAGATAAAATATTAGTCTAATACATGAAGGATATCAAAAACAGAG TAACACGAATCACATAGAGAAAGTGGAAGAGCCACCGTTTCCTCCTCCACCGCTATCATCTCTCTTCCATTCCCAGCTCTTTTCTTTTCTCGGAGCTCCA ATTTTTGAAATTCGGATCTGGTTCTTTTGATCTGTGTTGTGTTGTCTGTGATGGAAGAAAACATAATTTGCCAGTGGAGCGTGTTTAGATCTCTCTTAGC AATCCTTCAATGGTGGACTTTCAATGTCACTGTTATTATCATGAATAAGTGGATCTTCCAGGTTTCATTTTTTAATTTACCCTTCTTTTTTCTATTCTAA TATCTTGCTTATTTATTTTTAAATCTGATCGTATTTATGTGATTTTCATTTCAAAACCATAAGATATATTTATTATTATTATTATTATTTGGTTACGTTG TAGTTTTTTATTTGTTTATTAATACATGGAGGCTGGATAATTTTGTGATCTCCGGAATTCTGGTAAGATTTTCACATTAATGCTGAAGCTTGAAGCTTTA AATTAATATATTAAACTCACACGAACTATAAACAATATTGTAATTTGGTGATTTTTGACTTCATTGTTTGATGTTAGCTCTTGATTCATTGCATATCTGG CTTGTTCACTCAGCTAGGCTTGTTCCAGTGCTAAAATTATGGTTTTCTGTAATGAAAAATGACCGATGTACCCTTGTCGCACGATAATCCGAAGTTATTA AATTAAATGTTTGGCTGTCCATGTTGGAGCTTAATAGTCTGGATTCTGTGAATTTTGATTTGCTCTGTCTGACTTAAAAACAATTATAATATATGAATTG TGTTGTTCATTAGTTAAAAATGTAACATATCAACCGCTGAAAAAATTACATCTGGGGATTGAGAAATCTGAAGCAATTGGAACACCAATCGGTGAATCAA TTCAACTCCTCCTCATCCTGATCAGTAATCACAGGGCATCTCCTGTGAATTACAATCATCTATATGAACTGTGTCGTTGGTAATCATTGAACAACCCTTT TTTTTAATATTGGGCTGTATCATAGGAATTAAAACAACTAAGATATGCACAATCCTGAAAGTAGATGTTGTAGATCAGCATAATTGTGTCCTTGAAATTA AAATTAATTGTCCAGGTGGTATGTAGTAATTGATTTATAACAAATTAAAATTCTTTTGTTAATGCCTTTAGGAAGGTTTGTGTTTTTCCTCCCGCAGTTT GGGCATTCCTCAGGAATATAATTCTTTGCCCTTAATTTCACCGTTTCCTAGTAGGTGTTCAGGGAAGGTCCACCAACATTCTTATGTTATTTTATTAGTT CTCAGAATGTTTCATTATACATAGATTTGCGGCAAAAAGCTTTTTCTTAGGACCTTAAACGATTCTGATCACCTCACTAAAGTAGTTAGGTCTTTTTTTG TTCTTTGTTCCATTTGTCAGGAAATGTTTTTATCTCCACATATGTACATTCATTTCCTTCTTGCTCACCTTGGCCCCTCAACCATTGTAATAAAAACTTG TATTGATTAAGACAAATGCTTTAAATTTTAATATTTTATGCTTTTTCAGAAATTGGAATTCAAGTTTCCCCTATCAGTGTCCTGTATCCATTTTATCTGC TCATCCATTGGAGCATACGTGGTAATTAAGATGCTGAAGCTTAAACCACTGATACATGTTGACCCTGAAGATCGCTGGAGAAGAATCTTTCCAATGTCAT TTGTGTTCTGTATTAACATAGTGCTGGGCAATGTGAGCCTACGATATATTCCAGTTTCTTTTATGCAGACCATAAAATCATTCACACCTGCAACAACAGT TGTTTTGCAATGGCTAGTTTGGAGGAAGTATTTTGAGTGGCGTATTTGGGCTTCTCTTATACCCATTGTTGGAGGGATACTTCTTGCTTCTGTTACAGAG CTTAGTTTTAACATGTTCGGATTTTGTGCTGCCTTATTTGGCTGTTTGGCTACATCTACAAAGACTATCCTTGCAGAGTCTCTTTTGCATGGATACAAAT TTGACAGGTGCATAATTCATGCTTTGCCTTTCTCTATTGTTTGTATTTTTATAATTTTCTGTTCTGTCTTTCCTTTCTCTCTGGAATTTTTCATGTGTAG ACTTTCCTGTTATTTATGGGTCTGTAATTCCCATTCCTTGTGTTGGACAACAGCTTTTTTTAACCACCTATGTTGACTCTATTTGTCCATTTCTTTATGG GATTTGGAGAACTAGAGCTAGTAAGTTGTTTGTATTGGAGTCGAGAACTTTTTAAGTGCTGCTAAGTTTGATCACAGCACCTGCTATCAGTACCCATGAA ACATGACAGCTGATGTATGTTTGCCGAATTTTGCTGGATTTTACGCAAAAGATGGATTTGGTTGATTTTGTTTCTTGGACCTATAATGTCGAAGTTCCTC ATTCTTGGTCATGATCTGTATGTATGTGTTTATATATGGAAATTAAAGATTGGGGTTTGTAATAACCACCTTGTCTAGTGTTTGCTAATATTTTAAAGAT TTGTTGAGAGTGACAAAATGGAAGCATAGTGATGCTGAAGCTGAAGCAACCCGAGCCTCCAACAATCCACCCTCTGGAGTTATTTCCTCTCATGTATGAA GTGCGTCTTGCAAAGAATCGTCGGAAAACGATTTCTGATGCACTATCTGCTAATGTTGCAGTGACGTCTCCATCACATCGATCTCCTCCTCCGGTTTTGT CTTCAAATCAGTCCCATTCGTCTCAGCTGTTACCATTGTCTTCGCAGCTTCCTTCTCGTCCTGAATTTCTACAGTCCTATGGTAGCTATGGAAGTTATGG TAACTAAGGTGGTGATTATGGGGGACGCTGTGTTGTTGGTGAAATTGCAGCAGTGTTGTGTTCATATCATGTTTTTGGATGCTTCTGTCCTTTTTAATGG GGGTGCAATCTCTTGGGTAAGGGAGAGGGAAAGGTGTTGCAGGACCAAGCCTCCAACACCAACTTCACAACCATGTCTCAAAATTGCGTTACAAGCTGGC GATGCTTCCGTCCTTACTCACTATGTCCTAAATGGACTGATATAATGTACCCAAAAAAAATGGACTGATATATGTAATATTCTCTAATTTCCGTGATAAT ATTAGTAACTTTTATGCAAGATGTAGATCTTGCTTAGCTCTGTGTCAATTAGCTTCCATAGGTTGCAATCAGTAACAGGACTCTTGAGGATGGAAATCTT TCCTTTTGCAGTTAAGCAGTCTGTGTTGTATAGCATTTATGATCAAAATCCACACTGGTGCTGACTTTTCAATATTTTTTTGTGTGTATCCTTTAATGCA TCAATTTTTAAAGAAAAAGAGAAGCGTTTCCCTTGGGTAGGTGGTGATCTTTATCATTCTCTTTATTGCCTGTATAATCACATTTGTCTTAGTTATGCTA TAGCATGTTCTATTCCATGCTTGTGCACATTTCTCTGAATTGCTTTGGCATGTTTTGTCTTCAGTACATAGCCTAATTCGTGTTTTGTATTTGTAGCATA AACACAGTTTATTACATGGCACCTTTTGCAACCATGATCTTGGCGATACCTGCTATGTTACTTGAGGGCAATGGGATTCTTGAGTGGCTAAGTATTCACC CATATCCTTGGTCAGCCCTGATAATCATTGTCACCTCTGGGGTTATGGCGTTCTGCCTTAATTTCTCCATTTTTTATGTGATTCACTCCACCACCGCTGT AACATTTAATGTTGCTGGAAACCTTAAGGTGAGATCTCTCAGGCAACAAATCAAATGCTTCGAGCCACTATTGTTTATTCTTAACATTCAAATTTATAAC TTTTCATTGTCAATCAGTTCAATCCATGCATTATTTGACAAAGTTGTTCATGTTTTCCTTTTCCTATTTAATAACCCGGAGAAACTGTTGTAGCTACAGT GTGTTGCCACATCATTATTCTTCAATCCTTGCTCTACAGCTTCATTGAATTTTACAATTTATCTTTAAGGTAGCATGGTTGGCAGATGTGTCAAAACATG ATGGAATGAAACATATGGTTTAAGTTCTATGTTTTTTGTACTTCATAAATAGAACATAACATGACATGAGGTAAAAAGGGAGAAAATTTTGGTTCCATGG AATGGGGTGGAAACCAAAGAGAATACAACAAAATATCCTGTTCCATCTGCTAACCAATTGTTACGTCAGTGCTCGACTGCTTTGATGGATGGAGGAAAGT GATGACTTGTGATAATGATGAAACTAAACCTTGATGTCTAAAAATCATAGTGATTCTGCATTTCTCAATTAACATTAATCATGTTTTTTGTGCAGGTTGC AGCTGCTGTCCTTGTTTCTTGGCTAATATTTAAGAACCCGATTTCATATTTGAACGCTGTTGGATGTGCTGTGACTCTTGTTGGATGTACATTCTATGGT TATGTCAGGCATATGATCTCCCAACAGCCACCAGTTCCAGGGACTCCTCGGACTCCTCGGACACCCAGAACACCTAGGACTCCTCTGAGTAAGATGGAGT TGCTTCCACTTGTAAATGATAAATTAGATGATAAGGTCTAATTGTTGGTTTAGCTATTCAGTAAGAGGTTTCTGCCATTTGGAAGGGCAGTAATAGCAGA AGGTACAAAAATATAAGTGGTCTTGGTTATTTATTCCTTTAGATTACCCAGGTTTCAATATATGGTTCTTTTTTTAGTTCCTCAAACTTTGTTTTATTTT ATTTATTTACTTTTTCTAGGGTATGATGCTTCATTTTTACTAGCTGTTTAGCCACTAGTTTTCTGCTGTTTTCTGATAGAGTACAACCTAAATGAATGGG ACCTTTGATAATTGATACTGCTAATTGTTATCATCATTATTATGTATTTGTTTTAGATCCAAGGTTCAAGGCAAAGTTCCTTGTTTGCAGTTCAACACAA TAGTGTATAGAACTGTCCTAGGCATGTGATTCAGTGATTCACACAAAACAAAGGAATAAAAATTTATTGAAAGTTCCACCAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_185145; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_380313
Blastp | - |
---|---|
Blastx | UDP-galactose transporter 1 from Arabidopsis with 94.19% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019430579.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | - |