| Id Trinity | TRINITY_DN51508_c1_g2_i11 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_298025 |
| Sequence | CACAGATCCAACTTCATTCCCACACCCGTTCTTCGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCGCAACCGCACCGGTTCTGAACACAGCTAACATGGATGACC TTCCCTTTAAAGTAGGGGATTTGGCTGAGTCTAAATCTTTTCAACGTGGTTTTCGTGGTGCATGGTTTCGGTGCAAGGTACGAGGAATTCGCACGCATAA TGATATGATGGTCCAGTTGGAGTATTTTGACTACCCCGATCAAAAGCTAACATGGTTCAAGCTGTATCAAAAACCTGGGACGTCAAAGTTCCTCACTAGG GAATTGATGCTGAGACCTGCGTTTCCTGCTATTTGTCATGAAAGTGAGGAACTTGATGTCAATACTATCACAGAAGTGATAGTTATTGTTAATAACATGT GGAAGGTGGGGGATTTGGTAGATTGGTTTAAAGATGGTTGCTATTGGTCTGGAAGAGTGACTGAAATATTGGGTAATGGCAAAGTTCAGATCGATTTACT ACCTCCTCCACTGGGTGAAGGGTCATCTTATCGAGCTTTAAGCAAGGACCTGCGCCCGTCCTTGCACTGGTGCCCAGATAAAGGTTGGACAGTGCCTATG CCTATGGTGTGTACTAGTAATCCTATAATTTTACTTTTTTCATATTTTTAACTTATCTTTGACATGCATTTTTCTCTGTGGTTAAATTTTCTGATAAGCC AACTTTATCAGTAAATAACATGATGTTTTCTGCTTATAGGTGGAAAGATTTTCCAATATGTTGTCACCCCTTATTTTCCAATTTTAGTTTGGCTTCTTAC ATTTTGCAAATCTGATTTAAGTACATACCCTGAGTTCCTGAAATAAAAAAATTTCTACTGGGAATATATTTTTTAGGTATTTGCACTGACGTAGAAATTG GTTGCATTTGCTGATTGCTGCCTTGTCAATTCTTTTTATTTTATTAAATATTAGTGGAACTGTGGAAGTCTGATGTTTCTGAATGTGAGAAAGTGTAGGT TCCTTGTGCAGAAGCTATAATAAGAGTATGAAGAGTTAGTGATATGGTTTCTGTAACCATCTTTGGGATGCTGTTCTCTTTATAGATATCTCGCCACTAA CTTGTGGGGAATCCAGAGATGAGAAACGCCTACTGGTCAGACTTAATAAATCATTTTAGTTGGGGGATTTATTTTTATGTTAAGATGGTGAGCTGCAGCA CACCTATATGGTTGGTACTTGGTGATGAAGAGGTCACGGGTTCAAATTCCATAAACAACCTCCCTGCTTGCAGGGATAAGGCTGTGTCCATCTTCTGCCC TCCCCACTGTGTTGCTTAGTCCCTTGTGTGGAGCCTTTTAGGCACTTGTGAATTTGTTGTTGCCCTTCTGTATTCTACTCGGTGGCAGTTTCATCCTCTT TATGGGCATCTCCATCATTTGTTTACCTTGTTTCTATATTTCTAGTATCCGTTCGCTACCTTAAGGTGGCAGTTTGGCCCTCCTACTTGTTTTTGTAGTG CTGTTTTCATACCTTTCTTTTCCCACTAATGGATATAGTAGTAGTTCTTTCTGTTGTCAATCATTTGAGTGATGACTTCTTCCTCATTGATGTGAGCCAT GCTAGTGACTATTTCTCTTTCGGTTGATGATCATTCCTATAATAACATATTCGTTATGTCTTATGTTAGCCCAACTCTTTAACCTAGGTGCTTTGGTGAC ATCCTATGTAGCTTGGGTACTCCTCTTTCCTTATTGCACGTACTGGTATTGCCGCGTATGTGTGGTTACACAAGTTTTTATTACAAAAACTAGGTACAGG GTGGGCCTCACGCAGGGTACAGCATGGATGCATGCTTAGTTAAACAGTGTTATTTGATGCAAGTTTTTTCTTTTCTTTTTTCAGTTTCATACAATTATGC CGATGATCATCTAGCTTTGTTGCTTAGTTATCTTTCTAACAGTTTTCTAGCATCTCCGGCTGTGTTCTTCTGAACCATTGTTTTCATTGTGCCTTATTCT TAACGTTTTGCTGTTTATATTATATGCTTTGTTTGATTATAGTGAACTAAGTGAGAAAGAAATAGGACGGAGAGAAATAGAGGAGAAATAAGAGATTCTG TTGGTAGGAGAGAATTAGGGAAGAGAGGATGAAATGTCACACCCATTGTTTTTTTGTTTTCTTCTCTCATTTGGGAGAAAGCGGGAATTAAGAGCAAATT GTTCCACTTTCCTATAATACTTTTACCCCCACCCACAATTGGTTTTTGTTAACAAAGACTAATTTTCTTTCAGTTCACTTTTTCATTTTTTTCATACATT CATATCAAACAAACTTAAAATTTGCTTTTTCTGTCATCAATTCATTTCTGCCCAGATTCTCTATTTTCATATTTTTCTCTTGCCATTTCAACCCCTTAAA CCTAATATACACATGGGGTGTTAGAATATTTGAGAAAATAGTTGCTTCTACTGATTATCATTGAGATTGGGTTGGTGTGAAGTCTACCGCTTGTGTAGCC TATGCGAAGGGAAGAAGCAAGGGATCGAGCTGAAAAAAAGAAAGCCTCCATTCCATTAAAGGGCTAATGCGCATTCGTTTTGGGTACAAGATCGAAAAGG AAGTATTTTAAGTATCTTATCAAAATCTCTAGAAAATAATTTATGCACCGATGGTGTAAGGGCTTTTACATTGTCAGCACATCATCTACCATTTATGTGT TAATCATCATTCACTCTTAAATAAAAAGTAATAGACATGAATATGTAGTTTGTTGTGTAAAAATGATGGTGCATAGATATTAAACTCAAGTATAAATAGG GCTGTTTGTTATGACGACCTCAATATGTTTCCCTTACCATCTCAGGTTTGCTGTGATGTTTGTGAACAGTGAAAAGCATAGCATGTTTGAAATATGGTTC TTCTGAGTTTGTTAAATTATTTAAGAACATTTACATATCTCAGTTTGCATTATCATGGTTTACTTCATGGCGAAAGTTGCAGGAGGATGGAAGCACATTT CCTCGTGCTCAGATAATTAATCCAGCAAATTCAGGCATCCATGGTACAGATGGGACAGTGAATTCTTGTCAGAGTTCTGAGAGGCCATTGAATTTTCCTG ACAGATCGATGAGGAAGAGAAAGCAATGCAACATTGGTAGAAATGATATGGAGATTGGCCAGTGTGACAATAAAATTAGTAAAACTTGTAATTTGGAAAT GACTAGTGTAAATGATGGATATAAGGATGGGAATCGTTCTAAGATGAGATGTAGCAAGAGCCTTTGTTTGAATTCCGTGTCTAACAGTACAATGGAAGCT GCAATTTTGGACTTGGAGGAACTTGTAAATAAGATTAAATGGTTAAGGGGTGTATTGGATTTTGAAGTGCCTTTGTTAGGTGCTAAACAACCAGCTTGGG AATTTTTACACCATGCGCCATGTAAATGACAGTTTTCATGAAAGCAGTACGTGAGATACTCTTGAGTTATTTTAGTCCGAGTCTTTTGGAAGCATTTGCT GCTTCTGTTGAAGTTGACCGCTAAAATTGGCAATTGGTGTTTAATAATTCATTTTTTTGGGTATGTAAATGGATATACAAGATACAAATTCTTCTGGACA AGATTATTAAAGTTAGTCTTTTCAATTTTTTCATCACTTACAAAATAAATAAAAGATGTACG BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_185437; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_298025
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | - |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019450420.1) |
| Pfam | Agenet domain (PF05641.11) |
| Rfam | - |
| GO | - |