Id Trinity | TRINITY_DN51508_c1_g2_i4 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_298014 |
Sequence | CACAGATCCAACTTCATTCCCACACCCGTTCTTCGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCGCAACCGCACCGGTTCTGAACACAGCTAACGTTAGAATCT GATAAAATGCACTTCACCTACGGTTTTGTTGTATCTTTCATTCAATTGTAAATTTAATAAATTATTGCCCTAGGTATTTGCATATCCAAATGTATCTCTT TCCCAATTCCCATCTTTATTTTATTCATGGTGCTATATAAGTAACCTTGTAAGCTTCTATGTTAACACCACTGTTGTGTAATTAATTTTTTCAGATGGAT GACCTTCCCTTTAAAGTAGGGGATTTGGCTGAGTCTAAATCTTTTCAACGTGGTTTTCGTGGTGCATGGTTTCGGTGCAAGGTACGAGGAATTCGCACGC ATAATGATATGATGGTCCAGTTGGAGTATTTTGACTACCCCGATCAAAAGCTAACATGGTTCAAGCTGTATCAAAAACCTGGGACGTCAAAGTTCCTCAC TAGGGAATTGATGCTGAGACCTGCGTTTCCTGCTATTTGTCATGAAAGTGAGGAACTTGATGTCAATACTATCACAGAAGTGATAGTTATTGTTAATAAC ATGTGGAAGGTGGGGGATTTGGTAGATTGGTTTAAAGATGGTTGCTATTGGTCTGGAAGAGTGACTGAAATATTGGGTAATGGCAAAGTTCAGATCGATT TACTACCTCCTCCACTGGGTGAAGGGTCATCTTATCGAGCTTTAAGCAAGGACCTGCGCCCGTCCTTGCACTGGTGCCCAGATAAAGGTTGGACAGTGCC TATGCCTATGGTGTGTACTAGTAATCCTATAATTTTACTTTTTTCATATTTTTAACTTATCTTTGACATGCATTTTTCTCTGTGGTTAAATTTTCTGATA AGCCAACTTTATCAGTAAATAACATGATGTTTTCTGCTTATAGGTGGAAAGATTTTCCAATATGTTGTCACCCCTTATTTTCCAATTTTAGTTTGGCTTC TTACATTTTGCAAATCTGATTTAAGTACATACCCTGAGTTCCTGAAATAAAAAAATTTCTACTGGGAATATATTTTTTAGGTATTTGCACTGACGTAGAA ATTGGTTGCATTTGCTGATTGCTGCCTTGTCAATTCTTTTTATTTTATTAAATATTAGTGGAACTGTGGAAGTCTGATGTTTCTGAATGTGAGAAAGTGT AGGTTCCTTGTGCAGAAGCTATAATAAGAGTATGAAGAGTTAGTGATATGGTTTCTGTAACCATCTTTGGGATGCTGTTCTCTTTATAGATATCTCGCCA CTAACTTGTGGGGAATCCAGAGATGAGAAACGCCTACTGGTCAGACTTAATAAATCATTTTAGTTGGGGGATTTATTTTTATGTTAAGATGGTGAGCTGC AGCACACCTATATGGTTGGTACTTGGTGATGAAGAGGTCACGGGTTCAAATTCCATAAACAACCTCCCTGCTTGCAGGGATAAGGCTGTGTCCATCTTCT GCCCTCCCCACTGTGTTGCTTAGTCCCTTGTGTGGAGCCTTTTAGGCACTTGTGAATTTGTTGTTGCCCTTCTGTATTCTACTCGGTGGCAGTTTCATCC TCTTTATGGGCATCTCCATCATTTGTTTACCTTGTTTCTATATTTCTAGTATCCGTTCGCTACCTTAAGGTGGCAGTTTGGCCCTCCTACTTGTTTTTGT AGTGCTGTTTTCATACCTTTCTTTTCCCACTAATGGATATAGTAGTAGTTCTTTCTGTTGTCAATCATTTGAGTGATGACTTCTTCCTCATTGATGTGAG CCATGCTAGTGACTATTTCTCTTTCGGTTGATGATCATTCCTATAATAACATATTCGTTATGTCTTATGTTAGCCCAACTCTTTAACCTAGGTGCTTTGG TGACATCCTATGTAGCTTGGGTACTCCTCTTTCCTTATTGCACGTACTGGTATTGCCGCGTATGTGTGGTTACACAAGTTTTTATTACAAAAACTAGGTA CAGGGTGGGCCTCACGCAGGGTACAGCATGGATGCATGCTTAGTTAAACAGTGTTATTTGATGCAAGTTTTTTCTTTTCTTTTTTCAGTTTCATACAATT ATGCCGATGATCATCTAGCTTTGTTGCTTAGTTATCTTTCTAACAGTTTTCTAGCATCTCCGGCTGTGTTCTTCTGAACCATTGTTTTCATTGTGCCTTA TTCTTAACGTTTTGCTGTTTATATTATATGCTTTGTTTGATTATAGTGAACTAAGTGAGAAAGAAATAGGACGGAGAGAAATAGAGGAGAAATAAGAGAT TCTGTTGGTAGGAGAGAATTAGGGAAGAGAGGATGAAATGTCACACCCATTGTTTTTTTGTTTTCTTCTCTCATTTGGGAGAAAGCGGGAATTAAGAGCA AATTGTTCCACTTTCCTATAATACTTTTACCCCCACCCACAATTGGTTTTTGTTAACAAAGACTAATTTTCTTTCAGTTCACTTTTTCATTTTTTTCATA CATTCATATCAAACAAACTTAAAATTTGCTTTTTCTGTCATCAATTCATTTCTGCCCAGATTCTCTATTTTCATATTTTTCTCTTGCCATTTCAACCCCT TAAACCTAATATACACATGGGGTGTTAGAATATTTGAGAAAATAGTTGCTTCTACTGATTATCATTGAGATTGGGTTGGTGTGAAGTCTACCGCTTGTGT AGCCTATGCGAAGGGAAGAAGCAAGGGATCGAGCTGAAAAAAAGAAAGCCTCCATTCCATTAAAGGGCTAATGCGCATTCGTTTTGGGTACAAGATCGAA AAGGAAGTATTTTAAGTATCTTATCAAAATCTCTAGAAAATAATTTATGCACCGATGGTGTAAGGGCTTTTACATTGTCAGCACATCATCTACCATTTAT GTGTTAATCATCATTCACTCTTAAATAAAAAGTAATAGACATGAATATGTAGTTTGTTGTGTAAAAATGATGGTGCATAGATATTAAACTCAAGTATAAA TAGGGCTGTTTGTTATGACGACCTCAATATGTTTCCCTTACCATCTCAGGTTTGCTGTGATGTTTGTGAACAGTGAAAAGCATAGCATGTTTGAAATATG GTTCTTCTGAGTTTGTTAAATTATTTAAGAACATTTACATATCTCAGTTTGCATTATCATGGTTTACTTCATGGCGAAAGTTGCAGGAGGATGGAAGCAC ATTTCCTCGTGCTCAGATAATTAATCCAGCAAATTCAGGCATCCATGGTACAGATGGGACAGTGAATTCTTGTCAGAGTTCTGAGAGGCCATTGAATTTT CCTGACAGATCGATGAGGAAGAGAAAGCAATGCAACATTGGTAGAAATGATATGGAGATTGGCCAGTGTGACAATAAAATTAGTAAAACTTGTAATTTGG AAATGACTAGTGTAAATGATGGATATAAGGATGGGAATCGTTCTAAGATGAGATGTAGCAAGAGCCTTTGTTTGAATTCCGTGTCTAACAGTACAATGGA AGCTGCAATTTTGGACTTGGAGGAACTTGTAAATAAGATTAAATGGTTAAGGGGTGTATTGGATTTTGAAGTGCCTTTGTTAGGTGCTAAACAACCAGCT TGGGAATTTTTACACCATGCGCCATGTAAATGACAGTTTTCATGAAAGCAGTACGTGAGATACTCTTGAGTTATTTTAGTCCGAGTCTTTTGGAAGCATT TGCTGCTTCTGTTGAAGTTGACCGCTAAAATTGGCAATTGGTGTTTAATAATTCATTTTTTTGGGTATGTAAATGGATATACAAGATACAAATTCTTCTG GACAAGATTATTAAAGTTAGTCTTTTCAATTTTTTCATCACTTACAAAATAAATAAAAGATGTACG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_185437; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_298014
Blastp | - |
---|---|
Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019450420.1) |
Pfam | Agenet domain (PF05641.11) |
Rfam | - |
GO | - |