| Id Trinity | TRINITY_DN51570_c0_g1_i19 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_298706 |
| Sequence | CAAAAAATTACTCTTTTTTTAATTTCTAATATGGGTTTTTATTCTTTTCAAGTTTTGATTATTGGGTATAGTTGAATTTACTATATATCTATGTAAAGTT CAAAATACTAGTATTTTTGTGTTAAAAGCTCTTTATAATACTTAATGGAGTAATTTTGTAGATCTAGCATTCATGAAATGCATCAGCTCCTTTATTCAGG GCCCATTTACATGATTAAGAAAGTGATTAGTAGATATTCTAAAAAAGTGATTTTGGAAAAGCTAAAAATATAGCTTCTCATAAATCCTGAGTTTCTGCCT TTTGTGCTTCTGGTTTTTAGTAAAAGCCCTACCAAATAAGCATTTCAGAAGATGATTTTTGTACCAAAAAGGAATTTTTTGTAGTTGTGAAAATCCTAAA CAAATGGGGCCTATATAATATATATTGAAAGTTGAGATTTTTGTATCAATTTTATATTGGTGTGAAGCTGAGATCTACTGATGAAGCGCAGTAATAGTGT GGAAAATAAAATTGTAAACAAAGCAAGCCGGGGGTTCATGAACCATGATGATTTTGTAAAGCTAGTGGCAGTTTGTGTGATTGATATGAAGGCCATTTTG CTTGGTGGTTATATTGGTTTTGAGTTGGCCGGAACTGACTATGACCTTTGTGATTTGCCTCAGATTTGACAAGTGAATAATTCACGAAACCAAAGTGGTT TTCGAGTGTTACATCATTTAGAAAGTAATAGAGAAGGGAGGCTGTGAAGAGATAGACAAGTGTTATTGTGGTCCAAATAAACTGAATGTTTCTTACTTCA TGCCTAGAAGCGGAGCTGAATTAAAGCTTATAACATATTTATGATAGCTAATTAATACGTGTAAAAAAATAATTTCTGTCAATCAATTATTGTAAATTTT GCAGCACAAAAATGGGAATCTCTATCTTCATTTAAGGGCAGTTTCGTTTTGTTACAGCTGAGATTGTAGCAGGATCTACAGCATGGCTCGGTAAAGGTCT TTCTTGTGTCTGTGCTCAGAGAAGAGAGAGTGAATCACGTCCTTCTTTTGATTTAACTCCAGTACAAGTAAGATTTTATTGATTTAATTGCTGGAGCAGC AATTTATAGCTAATTTAGTGATTCTGTTAATTTTCTCTTGAATCTTCCTGCCATACATAAAAGAAATGTTGTTCTAGGGTATGTGACATGTGTATAAAGG ATGTGCCATGTTTTTATTTTTTGGTTACTATTGTGAATATTGTGATGATAAGCATCTTCCGAACATAATCGACAGACAAGATTGCACTTTACCCTTTTAT TGAATGATCAATCTTCTTTTCAAATAATAAAAGTGTTCAAGTGGGTTCCTTGCTATATGCTCTTTTCTTGTGTATCCAACATACTTTCTACCTGGTTTGA GCTAGCTAAAAATCTGATCGCTGGAGAAAATTATTGAATAGAAAAAGCTGATAGACTATTGTGTTTAGTGGTGCCAAGATGCTGGTGTTCCTACTTATTA TTTGAAATTCTTGATACTTTTTATTCCCCTTTGGTTTTTAGTGATCAAATTATGAGGCTGACATACTCTTGTCTTTGCTTAATCTTTGTGTGTTCAAAAG CTTTCTTAACTAGAATTAACTATTCACATATTTTTGGAATTTATGCAGTTATGTTATGCTCAATTTTTCTCTTGCTCTGAATTTGTAGTAGCTTCCAATC ACACCCATCTTTCACATGGCTGGGTTTTTTGTATGAATTTTTTTATATTCAGTACTTTGATCATGTTGTATACCTCTTTGGATCAAAATATTGCACTCTA ATTATCTTTTCTATTAAATATTGTTTACAATTATGGCAAAATTCTCGATGCTGAACTTTTTATTCTCAGGAAGAATGCTTGCAGAGGATACAGAGCCGTA TAGATGTTCCCTATGATAGTTCTATCCCTGAGCACCAGGATGCCCTAAAGGCTTTATGGGATACTGCATTTCCTGAAGAAAAACTCCATGGCTTGATTTC TGAACAGTGGAAGGAAATGGGCTGGCAAGGGAAGGATCCATCAACCGATTTTAGGGGTGGTGGTTTCATATCATTGGAGAATTTGCTGTTTTTTGCTAGA AATTTCCCAGTATGTCTGTTTCTTATTTTATTCATTCTTTGTGATGCTATAACTAATATTTTGGAGCATTTGTTTCGACACGGACCCAAACGAATGTTCT TTTTTGCATGCTCATATCCCTTGCTTCCTTGCATAGTTTCACTATTTTGGTGGTGAAGTGTAGATTGCATGTTTCATTTGTCACGTGGTTGTCGATTTGT TTCGTTTAGGTTTTACTAGACATGGGTTTTATCTTACATGTTTTACTAGACACATTTTTGCACTTCTATGAGACCCTTTGCCCCCGTGTTTTGCTCTTTG TTAATCTACTATTGGTTCAATGGTTCTCAACTGTCTTGTGAATCTTAAATCTAATAAGTCATCTTTGCTATTGGTATCTCTTTCTCATAATGCCTGAACT TTTTATTCTGTAGAAATCCTTTCAGGATCTTTTACGGAAGCAGGAAGGAGATCGATCAGTTTGGGAATATCCATTTGCTGTTGCTGGTGTTAATATCACA TTCATGCTTATTCAGATGCTGGATCTTGAAGCAGGTTTGTCAGTTTTATTGTTATTAATATAATATTTTAGTCCAAACATATATCATGTCTAAAAGAATG GCTGAACAAATCCTAGATGTATAGTCATTTTCTCTTCTGGATTGTGCTGTCAATTTCATAGATCCCTAGCAACTTAACAAGTTGAGATTACTTTGAATTT ATTCGGTTCTTCGAATGTAACGTGTTGGCATAAATATGCTTATGTTATTTTACCATTTACTTTTGTATACTTCAGCTGTGTCTATCAGTCTTGGCCTTGG GCGGGCATCTATGCTACTACGGAAAGATGATTTCATTTCTTGTTATAGTATTTTCGTCTTCGTTAATTGGTTATTCTAAACAAATTATAAAGGCTGATCT CTAATATCTACTTCCTACTTTTAAGCATTTTTGCTAATTTTTGCATAGTATGAAATTGTTTTTTTAATTAAACATATTACAAAATTGTTATTAGAACTTC AAAAAATAGATAAATTTGCCAGGACCTTGCTTTGAATAGATTTTGTTATCCCAAATCATTGTGATGCTATCTGTTAATGATCTTTGCCTTTACAGTCAAG CCACGGACACTGGTTGGAGCAACTTTTCTAAAATTTCTTGCAGGTAGCCCGAATTATTCCCTGTT BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_185980; |
| Additional information | - |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_298706
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | ELMO domain-containing protein 2 from Homo with 44.59% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019459125.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |